More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB02040 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB02040  efflux protein, putative  100 
 
 
618 aa  1258    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.239478  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00430  conserved hypothetical protein  31.43 
 
 
562 aa  300  5e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.972638  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10862  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06760)  30.85 
 
 
518 aa  208  3e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.63 
 
 
487 aa  172  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01724  conserved hypothetical protein  26.35 
 
 
576 aa  170  6e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.03 
 
 
788 aa  170  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.42 
 
 
487 aa  163  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.46 
 
 
487 aa  161  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.11 
 
 
498 aa  160  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.07 
 
 
527 aa  158  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.65 
 
 
763 aa  154  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_006686  CND00450  MFS transporter, putative  28.3 
 
 
540 aa  154  5e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.454016  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.44 
 
 
522 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09370  MFS transporter of unkown specificity (AFU_orthologue; AFUA_5G09940)  25.09 
 
 
608 aa  150  5e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0140992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 
494 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03220  MFS transporter, putative  27.89 
 
 
563 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.118542  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29969  multidrug-resistance type transporter  25.35 
 
 
497 aa  147  5e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.83115  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.3 
 
 
509 aa  146  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02368  conserved hypothetical protein  27.31 
 
 
520 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.291195 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30815  MFS family transporter multidrug-resistance type transporter  25.81 
 
 
490 aa  144  3e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.179755  normal  0.31113 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.14 
 
 
534 aa  144  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01145  conserved hypothetical protein  27.92 
 
 
533 aa  144  6e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0445275 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.63 
 
 
1112 aa  143  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4704  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 
478 aa  143  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41453  multidrug-resistance type transporter aminotriazole resistance  25.27 
 
 
473 aa  143  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.141492  normal  0.652561 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.66 
 
 
490 aa  141  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.13 
 
 
508 aa  140  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.95 
 
 
514 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  28.97 
 
 
497 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  29.65 
 
 
492 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.96 
 
 
489 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5131  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
487 aa  134  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22804  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0336  transporter protein  30.83 
 
 
489 aa  133  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0230531  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1705  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 
733 aa  133  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00601  conserved hypothetical protein  24.9 
 
 
639 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00390  multidrug efflux pump, putative  24.19 
 
 
654 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 
501 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.06 
 
 
500 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.6 
 
 
757 aa  131  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2451  transporter protein  28.99 
 
 
472 aa  131  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.507711 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0772  major facilitator superfamily transporter  30.07 
 
 
464 aa  130  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0892  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
508 aa  130  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04630  efflux protein EncT, putative  25.79 
 
 
533 aa  130  8.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.794342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.07 
 
 
528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  30.05 
 
 
470 aa  128  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.65 
 
 
478 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  28.2 
 
 
498 aa  127  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 
532 aa  127  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.81 
 
 
502 aa  126  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.44 
 
 
532 aa  126  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  33.11 
 
 
471 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.38 
 
 
541 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.52 
 
 
534 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  28.18 
 
 
530 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2962  major facilitator transporter  29.29 
 
 
462 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.42 
 
 
522 aa  125  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.99 
 
 
627 aa  125  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  30.75 
 
 
481 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02100  expressed protein  25.46 
 
 
529 aa  124  7e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.320661  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.68 
 
 
522 aa  123  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.18 
 
 
519 aa  123  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  29.07 
 
 
457 aa  123  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8232  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 
513 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.71 
 
 
499 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3195  major facilitator transporter  29.59 
 
 
445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324382  hitchhiker  0.00530067 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.92 
 
 
482 aa  121  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.3 
 
 
505 aa  121  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  27.21 
 
 
480 aa  120  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2609  major facilitator transporter  28.53 
 
 
516 aa  120  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.92 
 
 
505 aa  120  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  28.14 
 
 
490 aa  120  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02625  MFS transporter of unkown specificity (AFU_orthologue; AFUA_1G11350)  25.44 
 
 
520 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 
491 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2971  major facilitator transporter  29.47 
 
 
445 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.41 
 
 
456 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 
524 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  30.09 
 
 
483 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.67 
 
 
519 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 
480 aa  119  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.93 
 
 
486 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  26.86 
 
 
465 aa  118  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.4 
 
 
512 aa  118  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.93 
 
 
486 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  28.48 
 
 
492 aa  118  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.93 
 
 
486 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.93 
 
 
486 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.93 
 
 
486 aa  117  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.51 
 
 
478 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.93 
 
 
486 aa  117  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0847  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.26 
 
 
551 aa  117  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  30.75 
 
 
481 aa  117  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4141  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 
486 aa  117  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.52 
 
 
478 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.66 
 
 
540 aa  117  7.999999999999999e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.64 
 
 
509 aa  117  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.99 
 
 
579 aa  117  8.999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  27.59 
 
 
481 aa  116  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  26.55 
 
 
519 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4079  major facilitator transporter  30.11 
 
 
470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0276069  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.49 
 
 
501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>