More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_41453 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_41453  multidrug-resistance type transporter aminotriazole resistance  100 
 
 
473 aa  941    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.141492  normal  0.652561 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09370  MFS transporter of unkown specificity (AFU_orthologue; AFUA_5G09940)  41.54 
 
 
608 aa  380  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0140992 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29969  multidrug-resistance type transporter  38.16 
 
 
497 aa  326  4.0000000000000003e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.83115  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30815  MFS family transporter multidrug-resistance type transporter  37.61 
 
 
490 aa  321  9.999999999999999e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.179755  normal  0.31113 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02625  MFS transporter of unkown specificity (AFU_orthologue; AFUA_1G11350)  34.62 
 
 
520 aa  295  1e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01724  conserved hypothetical protein  31.22 
 
 
576 aa  212  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00450  MFS transporter, putative  32.25 
 
 
540 aa  206  9e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.454016  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03220  MFS transporter, putative  31.02 
 
 
563 aa  205  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.118542  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00390  multidrug efflux pump, putative  29.51 
 
 
654 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03301  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13820)  30.59 
 
 
516 aa  184  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.286718 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02368  conserved hypothetical protein  27.19 
 
 
520 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.291195 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00601  conserved hypothetical protein  28.93 
 
 
639 aa  146  9e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02040  efflux protein, putative  25.27 
 
 
618 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.239478  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00430  conserved hypothetical protein  26.34 
 
 
562 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.972638  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.42 
 
 
487 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10862  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06760)  24.65 
 
 
518 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.21 
 
 
508 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.68 
 
 
498 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 
494 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.83 
 
 
527 aa  110  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.59 
 
 
487 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  25.29 
 
 
497 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1705  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 
733 aa  103  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.43 
 
 
487 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.1 
 
 
534 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02100  expressed protein  26.55 
 
 
529 aa  101  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.320661  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.71 
 
 
757 aa  101  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.81 
 
 
505 aa  101  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.89 
 
 
501 aa  100  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.98 
 
 
504 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1077  major facilitator superfamily permease  24.94 
 
 
444 aa  98.6  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.26 
 
 
452 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02170  conserved hypothetical protein  24.89 
 
 
513 aa  97.1  6e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.922145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.31 
 
 
509 aa  97.1  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.23 
 
 
512 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.76 
 
 
763 aa  95.9  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.19 
 
 
480 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 
517 aa  94  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  24.75 
 
 
471 aa  94  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 
515 aa  93.6  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 
574 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 
491 aa  92.4  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.25 
 
 
509 aa  93.2  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.87 
 
 
514 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.23 
 
 
1112 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.36 
 
 
478 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2307  major facilitator superfamily transporter  27.5 
 
 
508 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.018174  normal  0.0567456 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  26.81 
 
 
579 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.4 
 
 
505 aa  90.5  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  28.11 
 
 
543 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.65 
 
 
519 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  28.09 
 
 
462 aa  88.6  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  27.31 
 
 
501 aa  88.2  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.33 
 
 
493 aa  87.8  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0782  multidrug resistance protein B  25.4 
 
 
520 aa  87.4  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.05 
 
 
477 aa  87.4  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2293  major facilitator superfamily MFS_1  23.19 
 
 
513 aa  87  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.88 
 
 
539 aa  87  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  27.04 
 
 
498 aa  86.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.59 
 
 
609 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0336  transporter protein  24 
 
 
489 aa  86.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0230531  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1718  major facilitator superfamily MFS_1  21.29 
 
 
500 aa  86.7  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8690  major facilitator superfamily MFS_1  22.99 
 
 
507 aa  86.7  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2069  major facilitator superfamily permease  24.5 
 
 
440 aa  86.3  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7524  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 
503 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47136  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5593  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 
499 aa  85.5  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.18 
 
 
502 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.77 
 
 
504 aa  85.1  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.73 
 
 
579 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.2 
 
 
579 aa  84.3  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  23.27 
 
 
500 aa  84  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  26.29 
 
 
444 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.01 
 
 
458 aa  84  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.51 
 
 
788 aa  83.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4704  major facilitator superfamily MFS_1  22.15 
 
 
478 aa  83.6  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  23.48 
 
 
481 aa  83.2  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4580  major facilitator superfamily MFS_1  23.13 
 
 
500 aa  83.2  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.567616 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01145  conserved hypothetical protein  23.66 
 
 
533 aa  82.8  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0445275 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2058  major facilitator transporter  26.19 
 
 
529 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283059  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.32 
 
 
528 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2752  major facilitator transporter  25 
 
 
498 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.34 
 
 
541 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2075  major facilitator transporter  26.19 
 
 
529 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0542399  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2121  major facilitator superfamily transporter  26.19 
 
 
529 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.360369  normal  0.0488476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2451  transporter protein  21.32 
 
 
472 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.507711 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  24.45 
 
 
505 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04180  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08230)  25.98 
 
 
561 aa  82.4  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.82 
 
 
512 aa  82.4  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.038471 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  28.07 
 
 
529 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0892  major facilitator superfamily MFS_1  22.25 
 
 
508 aa  82.4  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.91 
 
 
478 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4079  major facilitator transporter  21.62 
 
 
470 aa  81.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0276069  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0301  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.94 
 
 
489 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.11 
 
 
499 aa  81.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  22.49 
 
 
475 aa  81.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  21.66 
 
 
493 aa  81.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.55 
 
 
486 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.55 
 
 
486 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.21 
 
 
627 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.55 
 
 
486 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>