More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK02980 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006680  CNK02980  hypothetical protein  100 
 
 
598 aa  1195    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.157268  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01170  hypothetical protein  42.54 
 
 
554 aa  430  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04630  efflux protein EncT, putative  37.29 
 
 
533 aa  351  2e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.794342  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02100  expressed protein  36.35 
 
 
529 aa  323  8e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.320661  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02170  conserved hypothetical protein  39.11 
 
 
513 aa  319  7.999999999999999e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.922145  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.69 
 
 
527 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02040  efflux protein, putative  25.6 
 
 
618 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.239478  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00430  conserved hypothetical protein  24.02 
 
 
562 aa  110  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.972638  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.86 
 
 
763 aa  108  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  23.78 
 
 
497 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.06 
 
 
528 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01724  conserved hypothetical protein  25.11 
 
 
576 aa  104  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09370  MFS transporter of unkown specificity (AFU_orthologue; AFUA_5G09940)  23.52 
 
 
608 aa  104  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0140992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25 
 
 
788 aa  103  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8690  major facilitator superfamily MFS_1  25.11 
 
 
507 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.27 
 
 
509 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27 
 
 
493 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3703  permease of the major facilitator superfamily  25.34 
 
 
477 aa  100  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805067  normal  0.0440675 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02720  expressed protein  41.91 
 
 
185 aa  99.4  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.65 
 
 
487 aa  98.2  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  25.23 
 
 
528 aa  97.8  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.74 
 
 
469 aa  97.4  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.05 
 
 
583 aa  97.4  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03301  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13820)  22.7 
 
 
516 aa  96.7  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.286718 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2069  major facilitator superfamily permease  24.48 
 
 
440 aa  96.7  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.47 
 
 
474 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.58 
 
 
521 aa  94.7  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00390  multidrug efflux pump, putative  23.91 
 
 
654 aa  94.7  5e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.48 
 
 
488 aa  93.2  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.66 
 
 
607 aa  93.2  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.33 
 
 
534 aa  93.2  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  25.16 
 
 
480 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.46 
 
 
522 aa  92.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.85 
 
 
519 aa  91.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.89 
 
 
534 aa  92  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2726  major facilitator transporter  25.77 
 
 
484 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.71 
 
 
564 aa  91.3  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01145  conserved hypothetical protein  25.57 
 
 
533 aa  90.9  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0445275 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.9 
 
 
508 aa  90.9  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29969  multidrug-resistance type transporter  23.42 
 
 
497 aa  90.9  6e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.83115  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.88 
 
 
553 aa  90.9  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.67 
 
 
514 aa  90.1  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.7 
 
 
478 aa  90.1  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5578  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 
478 aa  90.1  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.17 
 
 
473 aa  89.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.77 
 
 
487 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  24.21 
 
 
480 aa  89.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.15 
 
 
487 aa  89  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.94 
 
 
498 aa  89  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.45 
 
 
478 aa  88.6  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  23.85 
 
 
457 aa  88.2  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.03 
 
 
510 aa  87.4  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  26.35 
 
 
555 aa  87.4  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.14 
 
 
517 aa  87.4  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.07 
 
 
532 aa  87.4  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.76 
 
 
537 aa  87.4  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  26.03 
 
 
492 aa  87  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02625  MFS transporter of unkown specificity (AFU_orthologue; AFUA_1G11350)  20.6 
 
 
520 aa  86.7  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  24.84 
 
 
483 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.16 
 
 
757 aa  86.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  23.38 
 
 
494 aa  85.1  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00601  conserved hypothetical protein  22.13 
 
 
639 aa  84.7  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  25 
 
 
469 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0892  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 
508 aa  84.3  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0738  major facilitator superfamily transporter  27.38 
 
 
488 aa  84.7  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1276  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 
483 aa  84.7  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4580  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 
500 aa  84.3  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  21.97 
 
 
522 aa  84  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.31 
 
 
517 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02368  conserved hypothetical protein  24.44 
 
 
520 aa  83.2  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.291195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.48 
 
 
489 aa  82.8  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  26 
 
 
484 aa  83.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2701  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 
503 aa  82.8  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417248  normal  0.482514 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03220  MFS transporter, putative  22.57 
 
 
563 aa  82.8  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.118542  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1147  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.55 
 
 
702 aa  82.8  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.624322  normal  0.188028 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.46 
 
 
501 aa  82.4  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 
507 aa  82.8  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3373  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 
482 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0499  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 
465 aa  81.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.1 
 
 
505 aa  81.6  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.92 
 
 
532 aa  81.6  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0847  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.78 
 
 
551 aa  82  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5749  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  21.46 
 
 
607 aa  81.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  24.54 
 
 
479 aa  81.3  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  23.16 
 
 
498 aa  81.6  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  23.16 
 
 
1062 aa  81.6  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5138  major facilitator superfamily MFS_1  24.02 
 
 
477 aa  81.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  23.6 
 
 
467 aa  81.3  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2897  major facilitator superfamily drug efflux transporter  24.57 
 
 
525 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430026  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  26.3 
 
 
481 aa  81.3  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 
506 aa  80.9  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.8 
 
 
512 aa  80.9  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.81 
 
 
541 aa  80.5  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5593  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 
499 aa  80.5  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.34 
 
 
500 aa  80.5  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.29 
 
 
487 aa  80.5  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.8 
 
 
525 aa  80.5  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.75 
 
 
521 aa  80.5  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1705  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 
733 aa  80.5  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.5 
 
 
531 aa  79.7  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0658046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>