130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA02720 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA02720  expressed protein  100 
 
 
185 aa  373  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02170  conserved hypothetical protein  63.5 
 
 
513 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.922145  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02100  expressed protein  61.43 
 
 
529 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.320661  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02980  hypothetical protein  41.91 
 
 
598 aa  99.8  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.157268  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04630  efflux protein EncT, putative  32 
 
 
533 aa  90.9  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.794342  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01170  hypothetical protein  39.67 
 
 
554 aa  77.4  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.82 
 
 
763 aa  61.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.3 
 
 
527 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.73 
 
 
487 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00880  sugar phosphate permease  34.95 
 
 
458 aa  56.2  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01724  conserved hypothetical protein  24.43 
 
 
576 aa  55.5  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 
493 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.05 
 
 
487 aa  55.1  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2069  major facilitator superfamily permease  31.53 
 
 
440 aa  52.4  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.87 
 
 
478 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0782  multidrug resistance protein B  32.17 
 
 
520 aa  50.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.78 
 
 
527 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.59 
 
 
499 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.26 
 
 
478 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  30.59 
 
 
497 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09370  MFS transporter of unkown specificity (AFU_orthologue; AFUA_5G09940)  29.19 
 
 
608 aa  49.7  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0140992 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02040  efflux protein, putative  35.29 
 
 
618 aa  49.7  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.239478  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2315  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 
523 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4526  efflux transporter  27.62 
 
 
303 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.344651  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.19 
 
 
1112 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 
502 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.91 
 
 
534 aa  48.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 
494 aa  47.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.26 
 
 
490 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47230  putative MFS transporter  32.74 
 
 
513 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5138  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 
477 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 
483 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5578  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 
478 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.64 
 
 
532 aa  47  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2451  transporter protein  29.2 
 
 
472 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.507711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  33.96 
 
 
461 aa  47  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.07 
 
 
534 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371671  normal  0.0821497 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30815  MFS family transporter multidrug-resistance type transporter  31.3 
 
 
490 aa  46.6  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.179755  normal  0.31113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4075  MFS family transporter  32.74 
 
 
513 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118331  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.93 
 
 
532 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3703  permease of the major facilitator superfamily  27.52 
 
 
477 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805067  normal  0.0440675 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0290  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 
535 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.344355 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2214  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 
529 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.146904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.34 
 
 
583 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.4 
 
 
505 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  31.31 
 
 
1048 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4704  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 
478 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.9 
 
 
788 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1705  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 
733 aa  45.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.19 
 
 
478 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2493  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
517 aa  45.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000001804  hitchhiker  0.00137453 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 
579 aa  45.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0336  transporter protein  30.36 
 
 
489 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0230531  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5593  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 
499 aa  45.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 
458 aa  45.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  27.43 
 
 
1065 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3744  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 
484 aa  45.1  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.52 
 
 
473 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00450  MFS transporter, putative  36.99 
 
 
540 aa  45.1  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.454016  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3272  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.13 
 
 
469 aa  45.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4981  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 
518 aa  44.7  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.547375  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6678  major facilitator superfamily MFS_1  34.55 
 
 
523 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519624  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.18 
 
 
539 aa  44.7  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5554  major facilitator transporter  33.65 
 
 
550 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.82 
 
 
498 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  30.53 
 
 
510 aa  44.7  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.3 
 
 
509 aa  44.7  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  28.4 
 
 
475 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1611  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.85 
 
 
503 aa  44.7  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00430  conserved hypothetical protein  27.67 
 
 
562 aa  43.9  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.972638  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3312  major facilitator transporter  31.96 
 
 
537 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.77 
 
 
482 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 
458 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1077  major facilitator superfamily permease  31.13 
 
 
444 aa  44.3  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.61 
 
 
504 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.35 
 
 
476 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0876  major facilitator superfamily MFS_1  34.26 
 
 
532 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.757243  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  27.46 
 
 
486 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 
507 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  35.82 
 
 
523 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.53 
 
 
505 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.2 
 
 
478 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  29.52 
 
 
481 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.2 
 
 
484 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29969  multidrug-resistance type transporter  28.7 
 
 
497 aa  43.5  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.83115  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41453  multidrug-resistance type transporter aminotriazole resistance  38.36 
 
 
473 aa  43.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.141492  normal  0.652561 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.36 
 
 
478 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4865  major facilitator transporter  30.48 
 
 
523 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.85 
 
 
474 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.15 
 
 
480 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.38 
 
 
514 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  31.62 
 
 
489 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2542  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 
485 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494815  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4680  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
467 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03220  MFS transporter, putative  23.17 
 
 
563 aa  42.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.118542  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.19 
 
 
498 aa  42.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.2 
 
 
478 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.95 
 
 
507 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1997  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 
467 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.956973 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2510  major facilitator superfamily MFS_1  33.82 
 
 
480 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.563077 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>