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for query gene Franean1_5554 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5554  major facilitator transporter  100 
 
 		 550 aa  1054    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6606  major facilitator superfamily MFS_1  61.9 
 
 		 552 aa  563  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3786  major facilitator superfamily MFS_1  54.7 
 
 		 560 aa  491  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398253  normal  0.51855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0876  major facilitator superfamily MFS_1  44.91 
 
 		 532 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.757243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2415  transmembrane efflux protein  37.16 
 
 		 525 aa  306  9.000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0516  major facilitator superfamily MFS_1  33.14 
 
 		 512 aa  256  6e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2131  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 529 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.025245 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2253  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 546 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2142  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 546 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3967  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 535 aa  179  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.32 
 
 		 532 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1504  major facilitator superfamily MFS_1  29.98 
 
 		 535 aa  162  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.74 
 
 		 522 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 		 502 aa  154  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.18 
 
 		 524 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3316  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.7 
 
 		 550 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0200557  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.4 
 
 		 502 aa  147  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0847  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.01 
 
 		 551 aa  147  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.21 
 
 		 541 aa  147  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 		 518 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.47 
 
 		 540 aa  146  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
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NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 532 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 480 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.16 
 
 		 583 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.07 
 
 		 522 aa  139  8.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.79 
 
 		 534 aa  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.63 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 		 471 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.17 
 
 		 478 aa  137  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0484  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.29 
 
 		 551 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 463 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  29.74 
 
 		 476 aa  136  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 		 477 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 486 aa  133  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.97 
 
 		 504 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.67 
 
 		 579 aa  131  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_3154  RemN protein  30.41 
 
 		 519 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.3 
 
 		 788 aa  131  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
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NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.72 
 
 		 763 aa  131  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30480  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.31 
 
 		 559 aa  131  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.43 
 
 		 528 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.18 
 
 		 508 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.75 
 
 		 476 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013525  Tter_1557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.38 
 
 		 539 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.9 
 
 		 480 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  26.16 
 
 		 480 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.63 
 
 		 505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_4579  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 531 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.375982 
 
 
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NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.78 
 
 		 480 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.69 
 
 		 480 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  25.69 
 
 		 480 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.69 
 
 		 480 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.69 
 
 		 480 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.95 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.96 
 
 		 479 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  27.9 
 
 		 490 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 630 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.51 
 
 		 534 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2986  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.3 
 
 		 476 aa  127  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.18 
 
 		 522 aa  127  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.67 
 
 		 607 aa  126  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.67 
 
 		 487 aa  126  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.87 
 
 		 511 aa  126  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  31.26 
 
 		 507 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5411  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 521 aa  126  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.423231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  30.44 
 
 		 497 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.84 
 
 		 471 aa  126  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  29.74 
 
 		 457 aa  126  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1760  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.56 
 
 		 466 aa  126  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 471 aa  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.05 
 
 		 525 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.88 
 
 		 510 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31 
 
 		 520 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.75 
 
 		 478 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.12 
 
 		 558 aa  125  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.73 
 
 		 487 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  31.14 
 
 		 503 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  26.31 
 
 		 520 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2474  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.95 
 
 		 480 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  27.48 
 
 		 493 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.52 
 
 		 520 aa  124  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.67 
 
 		 521 aa  124  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 555 aa  124  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.94 
 
 		 527 aa  124  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3647  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.43 
 
 		 486 aa  124  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.04243 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.4 
 
 		 488 aa  123  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.6 
 
 		 492 aa  123  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  26.83 
 
 		 467 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.35 
 
 		 545 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 494 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.49 
 
 		 505 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0757914 
 
 
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NC_013595  Sros_7777  transporter  26.62 
 
 		 480 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.48 
 
 		 504 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
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NC_009921  Franean1_7124  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 517 aa  121  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.21 
 
 		 512 aa  121  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 492 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.64 
 
 		 564 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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