More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1276 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1276  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 483 aa  927    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4580  major facilitator superfamily MFS_1  59.2 
 
 		 500 aa  492  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8690  major facilitator superfamily MFS_1  63.41 
 
 		 507 aa  470  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1718  major facilitator superfamily MFS_1  56.57 
 
 		 500 aa  410  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0336  transporter protein  50.1 
 
 		 489 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0230531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0892  major facilitator superfamily MFS_1  52.72 
 
 		 508 aa  388  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2451  transporter protein  50.11 
 
 		 472 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.507711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4704  major facilitator superfamily MFS_1  47.98 
 
 		 478 aa  352  1e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5620  major facilitator superfamily MFS_1  53.46 
 
 		 488 aa  341  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000613899 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3744  major facilitator superfamily MFS_1  48 
 
 		 484 aa  318  1e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.9 
 
 		 487 aa  283  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0772  major facilitator superfamily transporter  38.79 
 
 		 464 aa  281  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.29 
 
 		 487 aa  275  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1035  major facilitator superfamily MFS_1  44.34 
 
 		 466 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.97 
 
 		 498 aa  266  5e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0901  major facilitator superfamily MFS_1  44.57 
 
 		 466 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 494 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.73 
 
 		 507 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39 
 
 		 490 aa  247  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.73 
 
 		 553 aa  243  7.999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  42.39 
 
 		 485 aa  242  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.81 
 
 		 763 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  36.95 
 
 		 497 aa  237  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4526  efflux transporter  54.44 
 
 		 303 aa  236  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.344651  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.31 
 
 		 527 aa  229  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.27 
 
 		 496 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.18 
 
 		 522 aa  227  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.96 
 
 		 519 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.86 
 
 		 508 aa  226  7e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.19 
 
 		 478 aa  226  8e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.11 
 
 		 474 aa  225  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  39.61 
 
 		 492 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.95 
 
 		 482 aa  226  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.95 
 
 		 482 aa  226  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.14 
 
 		 482 aa  224  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.52 
 
 		 487 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4328  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 482 aa  221  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  37.59 
 
 		 492 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.05 
 
 		 788 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 481 aa  217  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40 
 
 		 479 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.21 
 
 		 534 aa  216  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 490 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  39.43 
 
 		 481 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  39.14 
 
 		 471 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8208  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  39.91 
 
 		 463 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  34.92 
 
 		 470 aa  211  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.04 
 
 		 500 aa  211  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.38 
 
 		 506 aa  210  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4316  major facilitator transporter  36.96 
 
 		 486 aa  210  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  36.93 
 
 		 487 aa  209  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8232  major facilitator superfamily MFS_1  36.26 
 
 		 513 aa  209  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.12 
 
 		 478 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0103  major facilitator transporter  35.79 
 
 		 470 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360848  hitchhiker  0.000281581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  35.4 
 
 		 498 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3935  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.4 
 
 		 479 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000976381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.94 
 
 		 519 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0693  major facilitator superfamily MFS_1  37.21 
 
 		 472 aa  207  5e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3703  permease of the major facilitator superfamily  35.07 
 
 		 477 aa  206  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805067  normal  0.0440675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.52 
 
 		 493 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.36 
 
 		 489 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4898  putative transport protein  38.09 
 
 		 489 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00331224  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2293  major facilitator superfamily MFS_1  37.37 
 
 		 513 aa  204  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.53 
 
 		 487 aa  203  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.608352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  37.25 
 
 		 475 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  36.52 
 
 		 491 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.32 
 
 		 479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.32 
 
 		 479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.880414  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.32 
 
 		 479 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.23 
 
 		 487 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  33.55 
 
 		 457 aa  199  7e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.53 
 
 		 514 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4413  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.27 
 
 		 497 aa  199  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0337  major facilitator superfamily MFS_1  40.18 
 
 		 494 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0498428  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.33 
 
 		 480 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.189888  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.33 
 
 		 480 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.33 
 
 		 480 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.33 
 
 		 480 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3141  drug resistance MFS transporter  39.33 
 
 		 480 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3178  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.33 
 
 		 480 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1885  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.33 
 
 		 480 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3373  major facilitator superfamily MFS_1  38.41 
 
 		 482 aa  196  7e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4243  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.94 
 
 		 504 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.46 
 
 		 509 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 483 aa  194  3e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1483  drug resistance MFS transporter  40.67 
 
 		 480 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1424  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.06 
 
 		 548 aa  193  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.589759  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4079  major facilitator transporter  35.84 
 
 		 470 aa  193  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0276069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5138  major facilitator superfamily MFS_1  38.72 
 
 		 477 aa  192  8e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.43 
 
 		 480 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0272  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  37.41 
 
 		 494 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1398  drug resistance MFS transporter  40.43 
 
 		 480 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.4 
 
 		 502 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.65 
 
 		 505 aa  190  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.17 
 
 		 1112 aa  189  7e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7158  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.16 
 
 		 502 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.454502 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.93 
 
 		 481 aa  188  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0548  major facilitator transporter  35.09 
 
 		 500 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 499 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  37.73 
 
 		 501 aa  186  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.246435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>