More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_39864 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_39864  predicted protein  100 
 
 		 966 aa  1965    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  27.49 
 
 		 722 aa  253  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0338  RNA-binding S1 domain-containing protein  28.55 
 
 		 722 aa  250  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1676  S1 RNA-binding domain-containing protein  27.49 
 
 		 716 aa  245  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  28.29 
 
 		 718 aa  246  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2100  RNA-binding S1 domain-containing protein  27.07 
 
 		 716 aa  241  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0300977  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2137  RNA-binding S1 domain-containing protein  27.07 
 
 		 716 aa  241  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.580609  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0289  S1 RNA binding domain protein  28.04 
 
 		 724 aa  239  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032333  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1181  RNA-binding S1 domain-containing protein  26.94 
 
 		 720 aa  239  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3345  RNA-binding S1 domain-containing protein  30.19 
 
 		 706 aa  239  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  27.21 
 
 		 712 aa  238  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0286  RNA-binding S1 domain-containing protein  27.38 
 
 		 726 aa  238  4e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000736156  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2544  RNA binding S1 domain protein  30.63 
 
 		 762 aa  238  5.0000000000000005e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.493353  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  28.34 
 
 		 720 aa  238  6e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0735  RNA binding S1 domain protein  30.59 
 
 		 773 aa  237  7e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1388  RNA binding S1 domain protein  27.2 
 
 		 721 aa  237  7e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000247935  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3444  RNA-binding S1 domain-containing protein  29.92 
 
 		 787 aa  237  7e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.249053 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2668  RNA binding S1 domain-containing protein  28.31 
 
 		 783 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427217  normal  0.51511 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  27.93 
 
 		 720 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7512  transcriptional accessory protein  30.56 
 
 		 771 aa  235  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0317  RNA binding S1  30.64 
 
 		 772 aa  235  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499934  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0962  hypothetical protein  30.58 
 
 		 770 aa  234  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1095  RNA binding S1 domain protein  27.26 
 
 		 762 aa  234  6e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2252  RNA-binding S1 domain-containing protein  28.37 
 
 		 757 aa  234  7.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000694259  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0610  RNA binding S1 domain protein  27.58 
 
 		 727 aa  234  8.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1079  Tex-like protein protein-like protein  28.85 
 
 		 704 aa  234  8.000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2122  RNA-binding S1 domain-containing protein  29.36 
 
 		 849 aa  234  9e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00161735  normal  0.0955174 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5055  S1 RNA binding domain protein  27.65 
 
 		 722 aa  233  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0772  RNA binding S1 domain protein  29.87 
 
 		 771 aa  233  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2413  RNA binding S1 domain protein  29.05 
 
 		 736 aa  233  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.746859  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0356  Tex-like protein protein-like protein  29.02 
 
 		 703 aa  231  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0270  S1 RNA binding domain protein  27.84 
 
 		 722 aa  231  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00390714  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2410  RNA binding S1 domain protein  30.04 
 
 		 795 aa  231  6e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.367587  normal  0.911918 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  28.1 
 
 		 773 aa  231  6e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1762  RNA binding S1 domain protein  29.63 
 
 		 785 aa  230  8e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432806  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1680  RNA binding S1 domain-containing protein  28.79 
 
 		 784 aa  230  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3200  RNA-binding S1 domain-containing protein  29.27 
 
 		 785 aa  230  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0648133  normal  0.853857 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1283  transcriptional accessory protein  28.65 
 
 		 730 aa  230  1e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0241  RNA-binding S1 domain-containing protein  27.76 
 
 		 722 aa  229  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0577162  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2991  RNA-binding S1 domain-containing protein  30.56 
 
 		 772 aa  229  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.940851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0669  Tex-like protein protein-like protein  27.69 
 
 		 713 aa  229  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4627  RNA-binding S1 domain-containing protein  29.54 
 
 		 777 aa  229  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1810  RNA-binding S1 domain-containing protein  28.31 
 
 		 728 aa  229  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.547595  normal  0.164556 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1012  tex protein, putative  26.74 
 
 		 817 aa  228  3e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2205  RNA-binding S1 domain-containing protein  30.96 
 
 		 766 aa  228  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234468  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  27.47 
 
 		 766 aa  229  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  27.24 
 
 		 718 aa  228  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2650  RNA binding S1 domain protein  30.15 
 
 		 795 aa  228  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00533816  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0136  RNA binding S1  28.02 
 
 		 840 aa  228  4e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.43679  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0275  S1 RNA-binding domain-containing protein  28.36 
 
 		 722 aa  228  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302481  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0259  RNA binding S1  29.93 
 
 		 782 aa  228  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6302  RNA binding S1 domain protein  28.01 
 
 		 760 aa  228  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.820559  normal  0.459443 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1875  Tex-like protein protein-like protein  29.39 
 
 		 719 aa  228  6e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0320  RNA binding S1 domain protein  28.74 
 
 		 775 aa  227  9e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4458  RNA-binding S1 domain-containing protein  29.55 
 
 		 770 aa  227  9e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.135865  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3413  RNA-binding S1 domain-containing protein  30.07 
 
 		 777 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.268774 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0306  RNA-binding S1 domain-containing protein  28.39 
 
 		 773 aa  226  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0813  RNA-binding S1 domain-containing protein  30.09 
 
 		 771 aa  227  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.179863  normal  0.675147 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3402  RNA binding S1  30.07 
 
 		 777 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4226  RNA binding S1  28.31 
 
 		 775 aa  226  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1222  RNA-binding S1 domain-containing protein  27.82 
 
 		 784 aa  226  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.923017  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08480  transcriptional accessory protein  29.36 
 
 		 775 aa  226  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.205113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3465  RNA-binding S1 domain-containing protein  30.07 
 
 		 777 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0520742 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0241  S1 RNA-binding domain-containing protein  28.08 
 
 		 724 aa  226  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0227  transcription accessory protein  28.08 
 
 		 724 aa  226  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.409701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0229  transcription accessory protein  28.21 
 
 		 724 aa  226  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  28.52 
 
 		 773 aa  226  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2875  RNA binding S1 domain protein  29.78 
 
 		 791 aa  226  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0267  S1 RNA binding domain protein  28.08 
 
 		 722 aa  226  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3820  RNA-binding S1 domain-containing protein  28.33 
 
 		 776 aa  226  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2039  RNA binding S1 domain protein  29.35 
 
 		 795 aa  226  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.883528  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  28.48 
 
 		 757 aa  225  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4104  Tex-like protein protein-like protein  29.09 
 
 		 777 aa  225  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0767  RNA-binding S1 domain-containing protein  27.77 
 
 		 720 aa  225  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0127  hypothetical protein  28.08 
 
 		 840 aa  225  3e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.294313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0240  RNA binding S1 domain protein  28.55 
 
 		 780 aa  225  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3688  putative transcriptional accessory protein  28.39 
 
 		 773 aa  224  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.913461 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  29.11 
 
 		 781 aa  224  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0703  RNA binding S1  30.24 
 
 		 814 aa  225  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.509283  normal  0.104907 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00795  S1 RNA binding domain protein  29.19 
 
 		 786 aa  224  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0660252  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3912  RNA binding S1 domain protein  28.91 
 
 		 777 aa  224  6e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03211  hypothetical protein  28.39 
 
 		 773 aa  224  6e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3786  putative transcriptional accessory protein  28.39 
 
 		 773 aa  224  7e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0255  s1 RNA-binding domain-containing protein  27.95 
 
 		 722 aa  224  7e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.914514  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3604  protein yhgF  28.39 
 
 		 773 aa  224  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3881  protein yhgF  28.39 
 
 		 773 aa  224  7e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03259  predicted transcriptional accessory protein  28.39 
 
 		 772 aa  224  8e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1493  transcription accessory protein  28.1 
 
 		 767 aa  224  8e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2166  RNA-binding S1 domain-containing protein  30.09 
 
 		 780 aa  223  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.897398  normal  0.40683 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2628  Tex-like protein protein-like protein  29.53 
 
 		 801 aa  223  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2527  RNA binding S1 domain protein  29.2 
 
 		 782 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197314  hitchhiker  0.0000000921984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2537  RNA binding S1  30.45 
 
 		 803 aa  223  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417013 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1460  RNA-binding S1 domain-containing protein  29.56 
 
 		 773 aa  223  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0675238  normal  0.590936 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0306  RNA binding S1 domain protein  28.32 
 
 		 773 aa  223  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1628  Tex-like protein protein-like protein  29.85 
 
 		 796 aa  222  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4965  putative transcription accessory protein  29.4 
 
 		 796 aa  223  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1942  RNA-binding S1 domain-containing protein  29.77 
 
 		 778 aa  223  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0410513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0539  RNA binding S1 domain protein  28.92 
 
 		 769 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.500263  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2189  RNA binding S1  29.05 
 
 		 798 aa  223  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4713  putative transcriptional accessory protein  28.19 
 
 		 773 aa  222  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>