114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_2022 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009360  OSTLU_2022    100 
 
 		 1776 bp  3521    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_1494  BCCT family transporter: carnitine/choline  84.13 
 
 		 1716 bp  137  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.370102  normal  0.0552905 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  91.95 
 
 		 1752 bp  117  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0174  choline/carnitine/betaine transporter  95.24 
 
 		 1626 bp  101  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.525828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3457  choline/carnitine/betaine transporter  93.65 
 
 		 2085 bp  93.7  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  93.65 
 
 		 1833 bp  93.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  93.55 
 
 		 1821 bp  91.7  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3341  choline/carnitine/betaine transporter  92.06 
 
 		 1914 bp  85.7  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1121  choline/carnitine/betaine transporter  94.55 
 
 		 1836 bp  85.7  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3326  choline/carnitine/betaine transporter  91.94 
 
 		 1578 bp  83.8  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188195  normal  0.774831 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  94.44 
 
 		 1722 bp  83.8  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  92.86 
 
 		 1596 bp  79.8  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0023  choline/carnitine/betaine transporter  89.55 
 
 		 1620 bp  77.8  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.16107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  90.48 
 
 		 1749 bp  77.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  90.48 
 
 		 1749 bp  77.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  90.48 
 
 		 1749 bp  77.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3436  choline/carnitine/betaine transporter  90.48 
 
 		 1581 bp  77.8  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.97143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6160  choline transporter BetT  90.48 
 
 		 1605 bp  77.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  87.18 
 
 		 1578 bp  75.8  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10935  glycine betaine transport integral membrane protein betP  90.32 
 
 		 1782 bp  75.8  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5310  choline/carnitine/betaine transporter  90.32 
 
 		 2097 bp  75.8  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.910175  normal  0.618905 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4045  choline/carnitine/betaine transporter  90.32 
 
 		 2022 bp  75.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.57128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00590  choline/carnitine/betaine transport  90.32 
 
 		 1779 bp  75.8  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0767816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  93.88 
 
 		 1704 bp  73.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  88.24 
 
 		 1752 bp  71.9  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01900  choline/carnitine/betaine transport  92.31 
 
 		 1860 bp  71.9  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3628  choline/carnitine/betaine transporter  88.89 
 
 		 1746 bp  69.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5061  choline/carnitine/betaine transporter  89.83 
 
 		 2004 bp  69.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70980  choline transporter BetT  88.89 
 
 		 1551 bp  69.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.92652 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  88.89 
 
 		 1596 bp  69.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4750  choline/carnitine/betaine transporter  88.89 
 
 		 1629 bp  69.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.216648  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0404  choline/carnitine/betaine transporter  89.83 
 
 		 2004 bp  69.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.766464 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06510  choline/carnitine/betaine transport  88.89 
 
 		 1929 bp  69.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2125  choline/carnitine/betaine transport  90.74 
 
 		 1650 bp  67.9  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  90.74 
 
 		 1980 bp  67.9  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2299  choline/carnitine/betaine transporter  90.74 
 
 		 1980 bp  67.9  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.944514  normal  0.189875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  90.74 
 
 		 1980 bp  67.9  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  89.29 
 
 		 1722 bp  63.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2914  choline/carnitine/betaine transporter  89.29 
 
 		 1836 bp  63.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34631  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0229  choline/carnitine/betaine transporter  87.3 
 
 		 1962 bp  61.9  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3080  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  89.09 
 
 		 1656 bp  61.9  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3298  BCCT transporter  87.3 
 
 		 1476 bp  61.9  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  85.92 
 
 		 2004 bp  61.9  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3716  choline/carnitine/betaine transporter  87.3 
 
 		 1890 bp  61.9  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.903721  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0237  choline/carnitine/betaine transporter  89.09 
 
 		 1653 bp  61.9  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000527978  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3807  choline/carnitine/betaine transporter  89.09 
 
 		 1656 bp  61.9  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00825508  normal  0.301611 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3929  hypothetical protein  89.09 
 
 		 1656 bp  61.9  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.720842  normal  0.613133 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4548  choline/carnitine/betaine transporter  89.09 
 
 		 1656 bp  61.9  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0898  BCCT family transporter  89.09 
 
 		 1623 bp  61.9  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0244  choline/carnitine/betaine transporter  87.3 
 
 		 2004 bp  61.9  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300044  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2105  choline/carnitine/betaine transporter  90.2 
 
 		 1746 bp  61.9  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4934  choline/carnitine/betaine transporter  88.14 
 
 		 2004 bp  61.9  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.205263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3804    90.2 
 
 		 1969 bp  61.9  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2119  betaine/carnitine/choline transporter family protein  94.87 
 
 		 1575 bp  61.9  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2288  choline/carnitine/betaine transporter  87.3 
 
 		 1749 bp  61.9  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529795 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13010  choline/carnitine/betaine transport  87.3 
 
 		 1812 bp  61.9  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.639384 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1874  BCCT transporter  87.1 
 
 		 2031 bp  60  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0838618  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6409  choline/carnitine/betaine transporter  88.89 
 
 		 1758 bp  60  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4210  choline/carnitine/betaine transport  87.1 
 
 		 2031 bp  60  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157306  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4156  choline/carnitine/betaine transporter  87.1 
 
 		 2031 bp  60  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87836  normal  0.0109397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  87.1 
 
 		 1722 bp  60  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2025  choline/carnitine/betaine transporter  87.1 
 
 		 1602 bp  60  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4552  choline/carnitine/betaine transporter  88.89 
 
 		 1668 bp  60  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0421  choline/carnitine/betaine transporter  87.1 
 
 		 1986 bp  60  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.45567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3360  choline/carnitine/betaine transporter  87.1 
 
 		 2031 bp  60  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0225578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25390  choline/carnitine/betaine transport  87.93 
 
 		 1545 bp  60  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.229483  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5241  BCCT transporter  88.68 
 
 		 1998 bp  58  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151008  normal  0.0666066 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  88.68 
 
 		 1605 bp  58  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3745  choline/carnitine/betaine transporter  87.72 
 
 		 2175 bp  58  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3038  choline/carnitine/betaine transporter  87.72 
 
 		 1665 bp  58  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  96.97 
 
 		 2058 bp  58  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2003  choline/carnitine/betaine transport family protein  90.91 
 
 		 1608 bp  56  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0309  choline/carnitine/betaine transporter  87.5 
 
 		 1659 bp  56  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.670789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0077  choline/carnitine/betaine transporter  87.5 
 
 		 1641 bp  56  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0049  choline/carnitine/betaine transporter  87.5 
 
 		 1572 bp  56  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.335489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1835  choline/carnitine/betaine transporter  92.5 
 
 		 1551 bp  56  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22610  choline/carnitine/betaine transport  88.46 
 
 		 1992 bp  56  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.524203  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2261  choline/carnitine/betaine transporter  85.94 
 
 		 2016 bp  56  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  88.24 
 
 		 1986 bp  54  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3308  choline/carnitine/betaine transporter  89.36 
 
 		 2097 bp  54  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.634741 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1384  choline/carnitine/betaine transporter  87.27 
 
 		 1575 bp  54  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.095402  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1851  choline/carnitine/betaine transporter  85.71 
 
 		 1632 bp  54  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.993809  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3129  choline/carnitine/betaine transporter  85.71 
 
 		 1665 bp  54  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.32452  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1835  choline/carnitine/betaine transporter  90.7 
 
 		 2016 bp  54  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.314511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04020  choline/carnitine/betaine transport  85.71 
 
 		 1830 bp  54  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0187444  normal  0.0477577 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1055  choline/carnitine/betaine transporter  88.24 
 
 		 1563 bp  54  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.144567  normal  0.0392371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1338  choline/carnitine/betaine transporter  88 
 
 		 1629 bp  52  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1904  choline/carnitine/betaine transporter  85.48 
 
 		 2037 bp  52  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4280  choline/carnitine/betaine transporter  90.48 
 
 		 2163 bp  52  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.692689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0980  choline/carnitine/betaine transport  88 
 
 		 1647 bp  52  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2552  choline/carnitine/betaine transporter  100 
 
 		 1977 bp  52  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  92.11 
 
 		 1485 bp  52  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3496  choline/carnitine/betaine transporter  83.33 
 
 		 2175 bp  52  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.81429 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00860  choline/carnitine/betaine transport  86.21 
 
 		 1989 bp  52  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  85.48 
 
 		 1617 bp  52  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0971  choline/carnitine/betaine transporter  86.79 
 
 		 2031 bp  50.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.745252  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0234  BCCT family transporter  86.79 
 
 		 2151 bp  50.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1859  BCCT family transporter  86.79 
 
 		 2031 bp  50.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1774  BCCT family transporter  86.79 
 
 		 2031 bp  50.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841224  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1364  BCCT family transporter  86.79 
 
 		 2031 bp  50.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>