More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1737 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1737  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  100 
 
 
113 aa  226  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0277937 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0982  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  55.75 
 
 
256 aa  120  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0912  sigma-70 region 4 domain-containing protein  55.56 
 
 
118 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  50 
 
 
239 aa  117  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2798  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  56.48 
 
 
234 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4421  sporulation sigma factor SigK  54.63 
 
 
265 aa  114  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4236  sporulation sigma factor SigK  54.63 
 
 
237 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4074  sporulation sigma factor SigK  54.63 
 
 
237 aa  114  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4084  sporulation sigma factor SigK  54.63 
 
 
237 aa  114  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0778  sporulation sigma factor SigK  54.63 
 
 
237 aa  114  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.377161  hitchhiker  0.0088749 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4566  sporulation sigma factor SigK  54.63 
 
 
237 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4472  sporulation sigma factor SigK  54.63 
 
 
237 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3065  sporulation sigma factor SigK  54.63 
 
 
237 aa  114  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4459  sporulation sigma factor SigK  54.63 
 
 
237 aa  114  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4190  sporulation sigma factor SigK  54.63 
 
 
237 aa  114  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2021  sporulation sigma factor SigK  54.13 
 
 
233 aa  113  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.653409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1738  sporulation sigma factor SigK  54.13 
 
 
233 aa  113  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.475543  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  50 
 
 
236 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05860  sporulation sigma factor SigK  50.89 
 
 
232 aa  110  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0982  sporulation sigma factor SigK  49.07 
 
 
245 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1582  sporulation sigma factor SigK  54.9 
 
 
226 aa  108  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000492275  normal  0.195753 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1501  sporulation sigma factor SigK  51.75 
 
 
231 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3546  sporulation sigma factor SigK  48.18 
 
 
249 aa  104  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0517  sporulation sigma factor SigK  49.07 
 
 
244 aa  103  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1012  sporulation sigma factor SigK  50.45 
 
 
236 aa  101  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1426  sporulation sigma factor SigE  44.44 
 
 
241 aa  99.8  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3949  sporulation sigma factor SigE  41.67 
 
 
239 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000781708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3731  sporulation sigma factor SigE  41.67 
 
 
239 aa  97.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278458  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3755  sporulation sigma factor SigE  41.67 
 
 
239 aa  97.8  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00369355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3646  sporulation sigma factor SigE  41.67 
 
 
239 aa  97.8  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000510031  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4005  sporulation sigma factor SigE  41.67 
 
 
239 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3663  sporulation sigma factor SigE  41.67 
 
 
239 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000395259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1236  sporulation sigma factor SigE  41.67 
 
 
239 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000024975  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3918  sporulation sigma factor SigE  41.67 
 
 
239 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000071882 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4043  sporulation sigma factor SigE  41.67 
 
 
239 aa  97.8  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3957  sporulation sigma factor SigE  41.67 
 
 
239 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000112899  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2553  sporulation sigma factor SigE  41.67 
 
 
239 aa  96.7  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000344705  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0686  sporulation sigma factor SigE  42.59 
 
 
241 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2290  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  50 
 
 
207 aa  94.7  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.345877  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0835  sporulation sigma factor SigE  44.44 
 
 
240 aa  95.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.935984  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2062  sporulation sigma factor SigE  43.52 
 
 
243 aa  94.4  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000360983  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  40.74 
 
 
239 aa  93.6  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1066  sporulation sigma factor SigE  40.74 
 
 
241 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000178993  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2015  sporulation sigma factor SigE  42.59 
 
 
235 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.785691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1733  sporulation sigma factor SigE  42.59 
 
 
235 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265453  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1290  sporulation sigma factor SigE  42.59 
 
 
249 aa  92  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0852  sporulation sigma factor SigE  40.74 
 
 
243 aa  91.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0114797  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4054  sporulation sigma factor SigE  40.74 
 
 
249 aa  90.5  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09150  sporulation sigma factor SigE  42.2 
 
 
245 aa  89.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000261644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0787  sporulation sigma factor SigE  39.81 
 
 
244 aa  88.6  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.761292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0736  sporulation sigma factor SigK  48.67 
 
 
219 aa  88.6  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000259555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0447  sporulation sigma factor SigE  43.24 
 
 
244 aa  88.2  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000743913  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2001  sporulation sigma factor SigE  43.52 
 
 
241 aa  88.2  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000755771  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1900  sporulation sigma factor SigE  38.89 
 
 
239 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1030  sporulation sigma factor SigE  38.89 
 
 
239 aa  87.4  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000129886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4361  RNA polymerase sigma-K factor  54.76 
 
 
100 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2469  sporulation sigma factor SigE  41.07 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130703  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2655  sporulation sigma factor SigK  37.96 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1553  sporulation sigma factor SigE  38.68 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000347236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2462  RNA polymerase sigma factor RpoD  33.68 
 
 
367 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0127291  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1726  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  31.58 
 
 
369 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_17029  predicted protein  31.13 
 
 
329 aa  57.8  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.698302  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5429  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  35.11 
 
 
276 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3036  RNA polymerase sigma factor RpoD  33.68 
 
 
359 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0549205  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4510  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  36.17 
 
 
465 aa  57  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.195113  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0064  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  34.9 
 
 
285 aa  57  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.534501  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0577  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  40.66 
 
 
280 aa  57  0.00000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4216  RNA polymerase sigma factor RpoD  33.68 
 
 
372 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000301264  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2245  RNA polymerase sigma factor RpoD  28.71 
 
 
489 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24330  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  28.71 
 
 
439 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.134736 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0327  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  32.99 
 
 
590 aa  55.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3764  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  28.71 
 
 
448 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3939  RNA polymerase sigma factor  28.71 
 
 
488 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2185  RNA polymerase sigma factor  28.71 
 
 
480 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1864  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  28.71 
 
 
429 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.123565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2231  RNA polymerase sigma factor  28.71 
 
 
480 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128274  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2174  RNA polymerase sigma factor  28.71 
 
 
480 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.512894  hitchhiker  0.00228971 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0492  RNA polymerase sigma factor RpoD  31.58 
 
 
360 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.187427  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2461  RNA polymerase sigma factor  28.71 
 
 
478 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1509  RNA polymerase sigma factor  28.71 
 
 
435 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12718  RNA polymerase sigma factor  28.71 
 
 
528 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0624  RNA polymerase sigma factor RpoD  30.53 
 
 
361 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00076534  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1878  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  28.71 
 
 
483 aa  54.7  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.230521  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0895  RNA polymerase sigma factor RpoD  33.68 
 
 
358 aa  54.3  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000160053  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2151  RpoD family RNA polymerase sigma factor  31.13 
 
 
738 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1237  RpoD family RNA polymerase sigma factor  30.3 
 
 
423 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002863 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1410  RNA polymerase sigma factor RpoD  30.85 
 
 
390 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.414735  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3505  sigma 38  30.3 
 
 
422 aa  52  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2817  RpoD subfamily RNA polymerase sigma 70 subunit  30.85 
 
 
390 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00156659  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0996  DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32)  35.79 
 
 
458 aa  52  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0967  RpoD subfamily RNA polymerase sigma-70  34.62 
 
 
311 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1407  RNA polymerase sigma factor  33.77 
 
 
438 aa  51.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.723356  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1493  RNA polymerase sigma factor SigB  31.31 
 
 
330 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.499176  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1677  RNA polymerase sigma factor SigB  33.7 
 
 
256 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0035  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  46.3 
 
 
295 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00102748  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1314  RNA polymerase sigma factor RpoD  43.1 
 
 
357 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000145678  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0979  RNA polymerase sigma factor RpoD  34.38 
 
 
669 aa  51.6  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0235491  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6393  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  31.58 
 
 
697 aa  50.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1975  RNA polymerase sigma factor RpoD  43.1 
 
 
366 aa  50.8  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000064083  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1514  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  30.85 
 
 
378 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>