More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_2001 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2001  sporulation sigma factor SigE  100 
 
 
241 aa  473  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000755771  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2062  sporulation sigma factor SigE  72.34 
 
 
243 aa  341  5.999999999999999e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000360983  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0447  sporulation sigma factor SigE  71.13 
 
 
244 aa  336  1.9999999999999998e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000743913  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3949  sporulation sigma factor SigE  70.04 
 
 
239 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000781708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3755  sporulation sigma factor SigE  70.04 
 
 
239 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00369355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3646  sporulation sigma factor SigE  70.04 
 
 
239 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000510031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3663  sporulation sigma factor SigE  70.04 
 
 
239 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000395259  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1066  sporulation sigma factor SigE  67.92 
 
 
241 aa  336  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000178993  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1236  sporulation sigma factor SigE  70.04 
 
 
239 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000024975  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4043  sporulation sigma factor SigE  70.04 
 
 
239 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3918  sporulation sigma factor SigE  70.04 
 
 
239 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000071882 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4005  sporulation sigma factor SigE  70.04 
 
 
239 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3957  sporulation sigma factor SigE  70.04 
 
 
239 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000112899  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2553  sporulation sigma factor SigE  70.17 
 
 
239 aa  335  3.9999999999999995e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000344705  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0852  sporulation sigma factor SigE  75.59 
 
 
243 aa  335  5e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0114797  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3731  sporulation sigma factor SigE  69.33 
 
 
239 aa  335  5e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278458  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0686  sporulation sigma factor SigE  69.53 
 
 
241 aa  334  5.999999999999999e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1030  sporulation sigma factor SigE  68.51 
 
 
239 aa  332  4e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000129886  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2015  sporulation sigma factor SigE  72.17 
 
 
235 aa  330  1e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.785691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1733  sporulation sigma factor SigE  72.17 
 
 
235 aa  330  1e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265453  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1900  sporulation sigma factor SigE  71.89 
 
 
239 aa  329  3e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1290  sporulation sigma factor SigE  71.96 
 
 
249 aa  326  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2469  sporulation sigma factor SigE  69.83 
 
 
246 aa  317  1e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130703  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1426  sporulation sigma factor SigE  71.7 
 
 
241 aa  317  1e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0835  sporulation sigma factor SigE  71.43 
 
 
240 aa  311  6.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.935984  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4054  sporulation sigma factor SigE  67.22 
 
 
249 aa  310  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0787  sporulation sigma factor SigE  69.77 
 
 
244 aa  305  4.0000000000000004e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.761292  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  70.42 
 
 
239 aa  302  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1553  sporulation sigma factor SigE  66.05 
 
 
242 aa  300  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000347236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09150  sporulation sigma factor SigE  61.18 
 
 
245 aa  294  9e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000261644  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0982  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  54.15 
 
 
256 aa  223  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2798  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  54.29 
 
 
234 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1012  sporulation sigma factor SigK  53.11 
 
 
236 aa  207  9e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0517  sporulation sigma factor SigK  46.7 
 
 
244 aa  204  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0982  sporulation sigma factor SigK  52.94 
 
 
245 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  51.96 
 
 
236 aa  201  9e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1582  sporulation sigma factor SigK  52.08 
 
 
226 aa  200  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000492275  normal  0.195753 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1501  sporulation sigma factor SigK  50 
 
 
231 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1738  sporulation sigma factor SigK  50 
 
 
233 aa  199  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.475543  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  47.03 
 
 
239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2021  sporulation sigma factor SigK  50 
 
 
233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.653409  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4421  sporulation sigma factor SigK  52.45 
 
 
265 aa  198  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4472  sporulation sigma factor SigK  52.45 
 
 
237 aa  197  9e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4236  sporulation sigma factor SigK  52.45 
 
 
237 aa  197  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4074  sporulation sigma factor SigK  52.45 
 
 
237 aa  197  9e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4084  sporulation sigma factor SigK  52.45 
 
 
237 aa  197  9e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4190  sporulation sigma factor SigK  52.45 
 
 
237 aa  197  9e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4566  sporulation sigma factor SigK  52.45 
 
 
237 aa  197  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4459  sporulation sigma factor SigK  52.45 
 
 
237 aa  197  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0778  sporulation sigma factor SigK  52.45 
 
 
237 aa  197  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.377161  hitchhiker  0.0088749 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05860  sporulation sigma factor SigK  50.97 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3065  sporulation sigma factor SigK  52.45 
 
 
237 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0736  sporulation sigma factor SigK  49.07 
 
 
219 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000259555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3546  sporulation sigma factor SigK  44.14 
 
 
249 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2655  sporulation sigma factor SigK  47.64 
 
 
232 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2290  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  48.44 
 
 
207 aa  167  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.345877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4418  RNA polymerase sigma-K factor  58.33 
 
 
149 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1770  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  62.64 
 
 
114 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.692748  normal  0.378996 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2061  sporulation sigma factor SigG  35.25 
 
 
257 aa  112  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147139  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0501  sigma 28 (flagella/sporulation)  48.28 
 
 
126 aa  111  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2870  sporulation sigma factor SigG  34.57 
 
 
273 aa  111  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000515832  hitchhiker  0.0000000000171975 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1552  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  31.45 
 
 
256 aa  109  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0448  sporulation sigma factor SigG  32.92 
 
 
257 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243038  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0788  sporulation sigma factor SigG  32.67 
 
 
255 aa  106  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667987  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0997  sigma-70 region 2 domain-containing protein  55.1 
 
 
118 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0687  sporulation sigma factor SigG  34.43 
 
 
257 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1425  sporulation sigma factor SigG  31.71 
 
 
255 aa  105  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00153435  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3442  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  32.79 
 
 
261 aa  105  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09160  sporulation sigma factor SigG  33.47 
 
 
260 aa  105  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000197734  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1291  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  31.2 
 
 
259 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0836  sporulation sigma factor SigG  32.35 
 
 
234 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.904059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0912  sigma-70 region 4 domain-containing protein  49.11 
 
 
118 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2014  sporulation sigma factor SigG  32.3 
 
 
257 aa  102  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0853  sporulation sigma factor SigG  31.45 
 
 
272 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0182418  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1067  sporulation sigma factor SigG  31.51 
 
 
257 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000166979  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1732  sporulation sigma factor SigG  32.3 
 
 
257 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0249664  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2000  sporulation sigma factor SigG  32.26 
 
 
256 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000480045  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0975  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  27.78 
 
 
285 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000391946  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12400  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  32.11 
 
 
358 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0607  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2284  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  32.07 
 
 
249 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2468  sporulation sigma factor SigG  34.3 
 
 
260 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000740675  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0492  RNA polymerase sigma factor RpoD  31.58 
 
 
360 aa  99  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.187427  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0374  sporulation sigma factor SigF  31.69 
 
 
252 aa  99  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1496  sigma 28 (flagella/sporulation)  30.45 
 
 
270 aa  98.6  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1726  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  32.11 
 
 
369 aa  98.6  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4053  sporulation sigma factor SigG  30.65 
 
 
257 aa  98.6  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000132793  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0157  RNA polymerase sigma factor RpoD  31.58 
 
 
375 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1901  sporulation sigma factor SigG  32.1 
 
 
259 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2414  RNA polymerase sigma factor RpoD  31.58 
 
 
374 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000700134  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1680  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  32.77 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3019  RNA polymerase sigma factor RpoD  31.43 
 
 
373 aa  97.8  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000207905  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1031  sporulation sigma factor SigG  31.69 
 
 
259 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000174079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4314  RNA polymerase sigma factor RpoD  31.43 
 
 
373 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.2227e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0827  RNA polymerase sigma factor RpoD  31.43 
 
 
375 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000804536  decreased coverage  6.75333e-22 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1744  sporulation sigma factor SigF  32.37 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4032  RNA polymerase sigma factor RpoD  31.43 
 
 
373 aa  97.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.92398e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4042  RNA polymerase sigma factor RpoD  31.43 
 
 
373 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000102439  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2462  RNA polymerase sigma factor RpoD  31.3 
 
 
367 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0127291  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4409  RNA polymerase sigma factor RpoD  31.43 
 
 
375 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000427068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4426  RNA polymerase sigma factor RpoD  31.43 
 
 
375 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>