More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1501 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1501  sporulation sigma factor SigK  100 
 
 
231 aa  463  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1012  sporulation sigma factor SigK  70.93 
 
 
236 aa  306  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2021  sporulation sigma factor SigK  65.73 
 
 
233 aa  282  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.653409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1738  sporulation sigma factor SigK  65.26 
 
 
233 aa  281  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.475543  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0982  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  61.23 
 
 
256 aa  270  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1582  sporulation sigma factor SigK  61.01 
 
 
226 aa  261  4.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000492275  normal  0.195753 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0517  sporulation sigma factor SigK  59.39 
 
 
244 aa  258  7e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2798  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  58.62 
 
 
234 aa  256  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3546  sporulation sigma factor SigK  55.37 
 
 
249 aa  254  8e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05860  sporulation sigma factor SigK  58.11 
 
 
232 aa  251  5.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3065  sporulation sigma factor SigK  55.56 
 
 
237 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0778  sporulation sigma factor SigK  54.67 
 
 
237 aa  246  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.377161  hitchhiker  0.0088749 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4421  sporulation sigma factor SigK  54.67 
 
 
265 aa  246  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4472  sporulation sigma factor SigK  54.67 
 
 
237 aa  246  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4236  sporulation sigma factor SigK  54.67 
 
 
237 aa  246  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4074  sporulation sigma factor SigK  54.67 
 
 
237 aa  246  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4084  sporulation sigma factor SigK  54.67 
 
 
237 aa  246  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4459  sporulation sigma factor SigK  54.67 
 
 
237 aa  246  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177817  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4566  sporulation sigma factor SigK  54.67 
 
 
237 aa  246  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4190  sporulation sigma factor SigK  54.67 
 
 
237 aa  246  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  55.56 
 
 
236 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0736  sporulation sigma factor SigK  60.48 
 
 
219 aa  241  7e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000259555  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  50.67 
 
 
239 aa  238  5.999999999999999e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0982  sporulation sigma factor SigK  54.22 
 
 
245 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2290  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  59.38 
 
 
207 aa  221  7e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.345877  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1290  sporulation sigma factor SigE  49.52 
 
 
249 aa  211  9e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1030  sporulation sigma factor SigE  48.57 
 
 
239 aa  210  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000129886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3731  sporulation sigma factor SigE  47.39 
 
 
239 aa  208  7e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278458  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  50 
 
 
239 aa  208  7e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1900  sporulation sigma factor SigE  48.1 
 
 
239 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3949  sporulation sigma factor SigE  46.96 
 
 
239 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000781708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3755  sporulation sigma factor SigE  46.96 
 
 
239 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00369355  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3918  sporulation sigma factor SigE  46.96 
 
 
239 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000071882 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3646  sporulation sigma factor SigE  46.96 
 
 
239 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000510031  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1236  sporulation sigma factor SigE  46.96 
 
 
239 aa  206  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000024975  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3663  sporulation sigma factor SigE  46.96 
 
 
239 aa  206  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000395259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4005  sporulation sigma factor SigE  46.96 
 
 
239 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4043  sporulation sigma factor SigE  46.96 
 
 
239 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3957  sporulation sigma factor SigE  46.96 
 
 
239 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000112899  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0686  sporulation sigma factor SigE  45.96 
 
 
241 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2553  sporulation sigma factor SigE  49.05 
 
 
239 aa  205  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000344705  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2062  sporulation sigma factor SigE  47.25 
 
 
243 aa  203  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000360983  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1066  sporulation sigma factor SigE  47.39 
 
 
241 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000178993  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0447  sporulation sigma factor SigE  50.24 
 
 
244 aa  202  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000743913  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1426  sporulation sigma factor SigE  47.85 
 
 
241 aa  202  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2015  sporulation sigma factor SigE  47.62 
 
 
235 aa  201  5e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.785691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1733  sporulation sigma factor SigE  47.62 
 
 
235 aa  201  5e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265453  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4054  sporulation sigma factor SigE  50.72 
 
 
249 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2001  sporulation sigma factor SigE  50 
 
 
241 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000755771  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0852  sporulation sigma factor SigE  45.5 
 
 
243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0114797  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09150  sporulation sigma factor SigE  47.39 
 
 
245 aa  199  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000261644  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0835  sporulation sigma factor SigE  47.87 
 
 
240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.935984  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0787  sporulation sigma factor SigE  45.16 
 
 
244 aa  194  7e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.761292  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2469  sporulation sigma factor SigE  49.06 
 
 
246 aa  194  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130703  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1553  sporulation sigma factor SigE  45.75 
 
 
242 aa  193  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000347236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2655  sporulation sigma factor SigK  42.42 
 
 
232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4418  RNA polymerase sigma-K factor  58.16 
 
 
149 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0997  sigma-70 region 2 domain-containing protein  62.39 
 
 
118 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1770  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  61.82 
 
 
114 aa  142  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.692748  normal  0.378996 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0501  sigma 28 (flagella/sporulation)  55.93 
 
 
126 aa  132  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0912  sigma-70 region 4 domain-containing protein  57.52 
 
 
118 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2001  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  37.19 
 
 
270 aa  108  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.605415  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1737  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  51.75 
 
 
113 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0277937 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0577  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  34.15 
 
 
280 aa  103  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0788  sporulation sigma factor SigG  33.6 
 
 
255 aa  101  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667987  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1552  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  31.37 
 
 
256 aa  101  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2000  sporulation sigma factor SigG  31.37 
 
 
256 aa  100  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000480045  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0431  RpoD family RNA polymerase sigma factor  32.51 
 
 
372 aa  101  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2614  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  32.39 
 
 
345 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00168562  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1726  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  30.71 
 
 
369 aa  97.8  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1680  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  34.89 
 
 
232 aa  97.1  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0624  RNA polymerase sigma factor RpoD  29.57 
 
 
361 aa  97.1  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00076534  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2061  sporulation sigma factor SigG  30.4 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147139  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2406  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  29.8 
 
 
444 aa  95.9  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127973  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0863  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  31.78 
 
 
245 aa  96.3  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12400  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  31.54 
 
 
358 aa  95.9  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0607  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2014  sporulation sigma factor SigG  29.8 
 
 
257 aa  95.5  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1732  sporulation sigma factor SigG  29.8 
 
 
257 aa  95.5  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0249664  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1311  sporulation sigma factor SigG  30.77 
 
 
269 aa  95.5  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000268367  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09160  sporulation sigma factor SigG  30.43 
 
 
260 aa  95.1  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000197734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3442  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  32.14 
 
 
261 aa  95.1  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0853  sporulation sigma factor SigG  29.02 
 
 
272 aa  94.4  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0182418  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0492  RNA polymerase sigma factor RpoD  29.62 
 
 
360 aa  94.4  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.187427  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0673  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  28.21 
 
 
363 aa  94.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1425  sporulation sigma factor SigG  29.53 
 
 
255 aa  94.4  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00153435  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1203  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  31.91 
 
 
281 aa  94  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512753  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0650  RpoD family RNA polymerase sigma factor  30.08 
 
 
418 aa  93.6  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1343  RpoD family RNA polymerase sigma factor  28.79 
 
 
407 aa  92.8  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000691641  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1343  RpoD family RNA polymerase sigma factor  28.79 
 
 
407 aa  92.8  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000061259  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0448  sporulation sigma factor SigG  30 
 
 
257 aa  93.6  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243038  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1291  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  29.46 
 
 
259 aa  92.8  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4053  sporulation sigma factor SigG  29.41 
 
 
257 aa  92.8  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000132793  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1448  RNA polymerase sigma factor RpoD  30.74 
 
 
369 aa  92.4  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000454729  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0713  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  30.98 
 
 
417 aa  92  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0937  RNA polymerase sigma-70 factor family protein  29.18 
 
 
286 aa  91.7  8e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1800  putative RNA polymerase, sigma 70 family subunit  27.45 
 
 
331 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157774  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4616  RpoD family RNA polymerase sigma factor  29.41 
 
 
401 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1031  sporulation sigma factor SigG  29.34 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000174079  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4672  RpoD family RNA polymerase sigma factor  32.38 
 
 
375 aa  90.5  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2462  RNA polymerase sigma factor RpoD  30.31 
 
 
367 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0127291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>