More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2020 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  100 
 
 		 239 aa  488  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0982  sporulation sigma factor SigK  57.33 
 
 		 245 aa  281  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  57.59 
 
 		 236 aa  275  5e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3065  sporulation sigma factor SigK  59.01 
 
 		 237 aa  272  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4421  sporulation sigma factor SigK  58.56 
 
 		 265 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4236  sporulation sigma factor SigK  58.56 
 
 		 237 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4472  sporulation sigma factor SigK  58.56 
 
 		 237 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4074  sporulation sigma factor SigK  58.56 
 
 		 237 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4084  sporulation sigma factor SigK  58.56 
 
 		 237 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4566  sporulation sigma factor SigK  58.56 
 
 		 237 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4459  sporulation sigma factor SigK  58.56 
 
 		 237 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0778  sporulation sigma factor SigK  58.56 
 
 		 237 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.377161  hitchhiker  0.0088749 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4190  sporulation sigma factor SigK  58.56 
 
 		 237 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1582  sporulation sigma factor SigK  57.8 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000492275  normal  0.195753 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0982  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  54.39 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2798  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  56.7 
 
 		 234 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0517  sporulation sigma factor SigK  52.59 
 
 		 244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05860  sporulation sigma factor SigK  55.66 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3546  sporulation sigma factor SigK  52.56 
 
 		 249 aa  241  6e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1501  sporulation sigma factor SigK  50.67 
 
 		 231 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2021  sporulation sigma factor SigK  51.1 
 
 		 233 aa  225  4e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.653409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1738  sporulation sigma factor SigK  51.1 
 
 		 233 aa  224  7e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.475543  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1012  sporulation sigma factor SigK  52.09 
 
 		 236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0736  sporulation sigma factor SigK  54.19 
 
 		 219 aa  211  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000259555  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1030  sporulation sigma factor SigE  49.49 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000129886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1900  sporulation sigma factor SigE  49.49 
 
 		 239 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2001  sporulation sigma factor SigE  47.03 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000755771  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2290  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  51.04 
 
 		 207 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.345877  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3949  sporulation sigma factor SigE  48.48 
 
 		 239 aa  199  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000781708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3755  sporulation sigma factor SigE  48.48 
 
 		 239 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00369355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3646  sporulation sigma factor SigE  48.48 
 
 		 239 aa  199  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000510031  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3957  sporulation sigma factor SigE  48.48 
 
 		 239 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000112899  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3663  sporulation sigma factor SigE  48.48 
 
 		 239 aa  199  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000395259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3918  sporulation sigma factor SigE  48.48 
 
 		 239 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000071882 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4005  sporulation sigma factor SigE  48.48 
 
 		 239 aa  199  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4043  sporulation sigma factor SigE  48.48 
 
 		 239 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1236  sporulation sigma factor SigE  48.48 
 
 		 239 aa  199  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000024975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0835  sporulation sigma factor SigE  45.54 
 
 		 240 aa  198  6e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.935984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2553  sporulation sigma factor SigE  48.48 
 
 		 239 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000344705  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3731  sporulation sigma factor SigE  47.98 
 
 		 239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278458  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2015  sporulation sigma factor SigE  48.48 
 
 		 235 aa  195  6e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.785691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1733  sporulation sigma factor SigE  48.48 
 
 		 235 aa  195  6e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265453  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1290  sporulation sigma factor SigE  47.47 
 
 		 249 aa  195  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1426  sporulation sigma factor SigE  48.99 
 
 		 241 aa  192  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1066  sporulation sigma factor SigE  47.09 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000178993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0686  sporulation sigma factor SigE  47.57 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  46.97 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0852  sporulation sigma factor SigE  47.98 
 
 		 243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0114797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0787  sporulation sigma factor SigE  42.71 
 
 		 244 aa  188  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.761292  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2469  sporulation sigma factor SigE  46.83 
 
 		 246 aa  188  7e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130703  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1553  sporulation sigma factor SigE  48 
 
 		 242 aa  187  9e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000347236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2062  sporulation sigma factor SigE  43.93 
 
 		 243 aa  185  5e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000360983  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2655  sporulation sigma factor SigK  42.98 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4054  sporulation sigma factor SigE  46.97 
 
 		 249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09150  sporulation sigma factor SigE  44.78 
 
 		 245 aa  181  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000261644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4418  RNA polymerase sigma-K factor  62.14 
 
 		 149 aa  181  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0447  sporulation sigma factor SigE  44.22 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000743913  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1770  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  56.64 
 
 		 114 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.692748  normal  0.378996 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0997  sigma-70 region 2 domain-containing protein  56.9 
 
 		 118 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0501  sigma 28 (flagella/sporulation)  53.39 
 
 		 126 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1737  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  50 
 
 		 113 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0277937 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0912  sigma-70 region 4 domain-containing protein  51.85 
 
 		 118 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1298  RpoD family RNA polymerase sigma factor  30.89 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.915931  hitchhiker  0.00000000172563 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0872  RNA polymerase sigma factor RpoS  29.84 
 
 		 330 aa  99.4  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3020  RNA polymerase sigma factor RpoS  31.01 
 
 		 335 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000209414 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4361  RNA polymerase sigma-K factor  55.29 
 
 		 100 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3342  RpoD family RNA polymerase sigma factor  30.89 
 
 		 322 aa  99.4  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101192  unclonable  0.0000000171583 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1517  RNA polymerase sigma factor RpoS  30.62 
 
 		 344 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17480  RNA polymerase sigma factor RpoS  30.62 
 
 		 334 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2631  sigma 28 (flagella/sporulation)  31.25 
 
 		 325 aa  99  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0930  RpoD family RNA polymerase sigma factor  29.1 
 
 		 332 aa  99  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1213  RpoD family RNA polymerase sigma factor  30.89 
 
 		 324 aa  98.6  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0677  RNA polymerase sigma-38 factor RpoS  28.06 
 
 		 322 aa  97.4  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.632708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3348  RNA polymerase sigma factor RpoS  29.5 
 
 		 330 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1245  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  29.73 
 
 		 326 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.411027  unclonable  0.00000000000310525 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3271  RpoD family RNA polymerase sigma factor  29.73 
 
 		 326 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.589431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1253  RNA polymerase sigma factor RpoS  29.69 
 
 		 333 aa  96.7  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0395454  normal  0.0329408 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3128  RpoD family RNA polymerase sigma factor  29.73 
 
 		 326 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0841  RNA polymerase sigma factor RpoS  29.5 
 
 		 330 aa  96.7  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0958  RNA polymerase sigma factor RpoS  29.5 
 
 		 332 aa  96.7  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1193  RpoD family RNA polymerase sigma factor  30.5 
 
 		 322 aa  96.7  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1565  RNA polymerase sigma-38 factor  29.84 
 
 		 335 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.651604  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1552  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  31.67 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178805  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1374  RNA polymerase sigma factor RpoS  29.84 
 
 		 335 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03517  hypothetical protein  28.35 
 
 		 328 aa  96.3  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002516  RNA polymerase sigma factor RpoS  28.35 
 
 		 328 aa  95.9  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3212  RNA polymerase sigma factor RpoS  29.12 
 
 		 330 aa  95.9  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.487557  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1132  RNA polymerase sigma factor RpoS  29.84 
 
 		 335 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3505  RNA polymerase sigma factor RpoS  29.12 
 
 		 330 aa  95.9  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1291  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  31.3 
 
 		 259 aa  95.9  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38680  RNA polymerase sigma factor RpoS  31.42 
 
 		 334 aa  95.9  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3425  RNA polymerase sigma factor RpoS  29.5 
 
 		 332 aa  95.5  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.43603  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0832  RNA polymerase sigma factor RpoS  29.5 
 
 		 332 aa  95.5  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0423608 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1726  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  31.06 
 
 		 369 aa  95.5  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3293  RNA polymerase sigma factor RpoS  29.5 
 
 		 332 aa  95.5  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0947  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  29.12 
 
 		 330 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10987  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1079  RNA polymerase sigma factor RpoS  28.41 
 
 		 296 aa  95.5  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2866  RNA polymerase sigma factor RpoS  29.12 
 
 		 330 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2879  RNA polymerase sigma factor RpoS  29.12 
 
 		 330 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0971  RNA polymerase sigma factor RpoS  29.12 
 
 		 330 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.841481  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>