More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1290 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1290  sporulation sigma factor SigE  100 
 
 
249 aa  494  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1030  sporulation sigma factor SigE  76.5 
 
 
239 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000129886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3731  sporulation sigma factor SigE  75.98 
 
 
239 aa  359  3e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278458  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1900  sporulation sigma factor SigE  75.32 
 
 
239 aa  359  3e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3957  sporulation sigma factor SigE  75 
 
 
239 aa  358  6e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000112899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3949  sporulation sigma factor SigE  75 
 
 
239 aa  358  6e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000781708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3755  sporulation sigma factor SigE  75 
 
 
239 aa  358  6e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00369355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3646  sporulation sigma factor SigE  75 
 
 
239 aa  358  6e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000510031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3663  sporulation sigma factor SigE  75 
 
 
239 aa  358  6e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000395259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4043  sporulation sigma factor SigE  75 
 
 
239 aa  358  6e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4005  sporulation sigma factor SigE  75 
 
 
239 aa  358  6e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1236  sporulation sigma factor SigE  75 
 
 
239 aa  358  6e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000024975  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3918  sporulation sigma factor SigE  75 
 
 
239 aa  358  6e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000071882 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2553  sporulation sigma factor SigE  73.22 
 
 
239 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000344705  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1066  sporulation sigma factor SigE  75 
 
 
241 aa  346  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000178993  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0686  sporulation sigma factor SigE  75 
 
 
241 aa  345  3e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  72.03 
 
 
239 aa  342  2e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0852  sporulation sigma factor SigE  73.11 
 
 
243 aa  339  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0114797  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2062  sporulation sigma factor SigE  73.06 
 
 
243 aa  336  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000360983  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0447  sporulation sigma factor SigE  73.95 
 
 
244 aa  328  4e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000743913  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1426  sporulation sigma factor SigE  75.93 
 
 
241 aa  328  6e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2015  sporulation sigma factor SigE  67.66 
 
 
235 aa  327  7e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.785691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1733  sporulation sigma factor SigE  67.66 
 
 
235 aa  327  7e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265453  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2001  sporulation sigma factor SigE  66.26 
 
 
241 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000755771  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0835  sporulation sigma factor SigE  68.7 
 
 
240 aa  318  7e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.935984  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4054  sporulation sigma factor SigE  70.89 
 
 
249 aa  317  7.999999999999999e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1553  sporulation sigma factor SigE  74.3 
 
 
242 aa  316  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000347236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09150  sporulation sigma factor SigE  66.24 
 
 
245 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000261644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2469  sporulation sigma factor SigE  65.91 
 
 
246 aa  296  1e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0787  sporulation sigma factor SigE  64.35 
 
 
244 aa  292  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.761292  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2798  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  52.38 
 
 
234 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1501  sporulation sigma factor SigK  49.52 
 
 
231 aa  211  7e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05860  sporulation sigma factor SigK  49.29 
 
 
232 aa  211  7.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0982  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  49.27 
 
 
256 aa  210  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2021  sporulation sigma factor SigK  47.64 
 
 
233 aa  206  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.653409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1738  sporulation sigma factor SigK  47.17 
 
 
233 aa  204  8e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.475543  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  49.52 
 
 
236 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1582  sporulation sigma factor SigK  51.56 
 
 
226 aa  203  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000492275  normal  0.195753 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1012  sporulation sigma factor SigK  48.8 
 
 
236 aa  202  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4421  sporulation sigma factor SigK  48.1 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4236  sporulation sigma factor SigK  48.1 
 
 
237 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4074  sporulation sigma factor SigK  48.1 
 
 
237 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4084  sporulation sigma factor SigK  48.1 
 
 
237 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4566  sporulation sigma factor SigK  48.1 
 
 
237 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4190  sporulation sigma factor SigK  48.1 
 
 
237 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4472  sporulation sigma factor SigK  48.1 
 
 
237 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4459  sporulation sigma factor SigK  48.1 
 
 
237 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0778  sporulation sigma factor SigK  48.1 
 
 
237 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.377161  hitchhiker  0.0088749 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3065  sporulation sigma factor SigK  48.1 
 
 
237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0982  sporulation sigma factor SigK  49.5 
 
 
245 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  47.47 
 
 
239 aa  195  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3546  sporulation sigma factor SigK  44.14 
 
 
249 aa  192  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0517  sporulation sigma factor SigK  44.61 
 
 
244 aa  188  5.999999999999999e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0736  sporulation sigma factor SigK  44.29 
 
 
219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000259555  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2655  sporulation sigma factor SigK  44.08 
 
 
232 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2290  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  46.63 
 
 
207 aa  167  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.345877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4418  RNA polymerase sigma-K factor  54.17 
 
 
149 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1425  sporulation sigma factor SigG  32.43 
 
 
255 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00153435  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0788  sporulation sigma factor SigG  33.46 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667987  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1770  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  57.29 
 
 
114 aa  112  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.692748  normal  0.378996 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2061  sporulation sigma factor SigG  33.07 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147139  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2870  sporulation sigma factor SigG  34.43 
 
 
273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000515832  hitchhiker  0.0000000000171975 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0448  sporulation sigma factor SigG  32.68 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243038  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1552  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  31.42 
 
 
256 aa  109  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178805  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1291  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  32.82 
 
 
259 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0912  sigma-70 region 4 domain-containing protein  46.43 
 
 
118 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2014  sporulation sigma factor SigG  32.81 
 
 
257 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09160  sporulation sigma factor SigG  32.71 
 
 
260 aa  109  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000197734  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2468  sporulation sigma factor SigG  33.46 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000740675  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1732  sporulation sigma factor SigG  32.81 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0249664  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0853  sporulation sigma factor SigG  30.68 
 
 
272 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0182418  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0997  sigma-70 region 2 domain-containing protein  54.08 
 
 
118 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1067  sporulation sigma factor SigG  31.03 
 
 
257 aa  105  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000166979  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0687  sporulation sigma factor SigG  31.91 
 
 
257 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1744  sporulation sigma factor SigF  33.06 
 
 
256 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1680  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  32.34 
 
 
232 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2000  sporulation sigma factor SigG  31.52 
 
 
256 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000480045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4053  sporulation sigma factor SigG  31.03 
 
 
257 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000132793  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0501  sigma 28 (flagella/sporulation)  46.24 
 
 
126 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2552  sporulation sigma factor SigG  30.47 
 
 
259 aa  99.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000004552  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1031  sporulation sigma factor SigG  30.86 
 
 
259 aa  99  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000174079  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0374  sporulation sigma factor SigF  31.28 
 
 
252 aa  99  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3730  sporulation sigma factor SigG  30.47 
 
 
292 aa  99  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1237  sporulation sigma factor SigG  30.47 
 
 
259 aa  99  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299824  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1901  sporulation sigma factor SigG  30.86 
 
 
259 aa  98.6  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3948  sporulation sigma factor SigG  30.08 
 
 
289 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000196829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3754  sporulation sigma factor SigG  30.08 
 
 
289 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000419985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3645  sporulation sigma factor SigG  30.08 
 
 
289 aa  97.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.74076e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3662  sporulation sigma factor SigG  30.08 
 
 
289 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000167357  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4042  sporulation sigma factor SigG  30.08 
 
 
259 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000307551  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1311  sporulation sigma factor SigG  31.58 
 
 
269 aa  97.1  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000268367  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3955  sporulation sigma factor SigG  30.08 
 
 
259 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000614575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4004  sporulation sigma factor SigG  30.08 
 
 
259 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3917  sporulation sigma factor SigG  30.08 
 
 
259 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000372162 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2284  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  29.11 
 
 
249 aa  96.7  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0064  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  32.41 
 
 
285 aa  96.3  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.534501  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3442  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  31.69 
 
 
261 aa  95.9  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3813  sporulation sigma factor SigF  30.2 
 
 
252 aa  95.5  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3829  sporulation sigma factor SigF  30.2 
 
 
252 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000549151  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4294  sporulation sigma factor SigF  30.2 
 
 
252 aa  95.5  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.728684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>