More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0997 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0997  sigma-70 region 2 domain-containing protein  100 
 
 
118 aa  240  6e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2798  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  76.92 
 
 
234 aa  186  7e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0982  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  70.09 
 
 
256 aa  172  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1582  sporulation sigma factor SigK  65.81 
 
 
226 aa  162  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000492275  normal  0.195753 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0982  sporulation sigma factor SigK  65.52 
 
 
245 aa  156  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  64.66 
 
 
236 aa  156  9e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1012  sporulation sigma factor SigK  69.09 
 
 
236 aa  153  7e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4190  sporulation sigma factor SigK  66.67 
 
 
237 aa  150  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4421  sporulation sigma factor SigK  66.67 
 
 
265 aa  151  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4472  sporulation sigma factor SigK  66.67 
 
 
237 aa  150  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4236  sporulation sigma factor SigK  66.67 
 
 
237 aa  150  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4459  sporulation sigma factor SigK  66.67 
 
 
237 aa  150  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4074  sporulation sigma factor SigK  66.67 
 
 
237 aa  150  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4084  sporulation sigma factor SigK  66.67 
 
 
237 aa  150  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0778  sporulation sigma factor SigK  66.67 
 
 
237 aa  150  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.377161  hitchhiker  0.0088749 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4566  sporulation sigma factor SigK  66.67 
 
 
237 aa  150  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3065  sporulation sigma factor SigK  66.67 
 
 
237 aa  150  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4418  RNA polymerase sigma-K factor  66.67 
 
 
149 aa  149  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1770  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  65.69 
 
 
114 aa  145  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.692748  normal  0.378996 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3546  sporulation sigma factor SigK  59.23 
 
 
249 aa  144  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0517  sporulation sigma factor SigK  56.64 
 
 
244 aa  144  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1501  sporulation sigma factor SigK  62.39 
 
 
231 aa  142  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0501  sigma 28 (flagella/sporulation)  55.36 
 
 
126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05860  sporulation sigma factor SigK  62.39 
 
 
232 aa  135  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  56.9 
 
 
239 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2021  sporulation sigma factor SigK  57.14 
 
 
233 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.653409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1738  sporulation sigma factor SigK  57.14 
 
 
233 aa  124  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.475543  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1900  sporulation sigma factor SigE  51.33 
 
 
239 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2655  sporulation sigma factor SigK  45.3 
 
 
232 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1030  sporulation sigma factor SigE  57.14 
 
 
239 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000129886  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2015  sporulation sigma factor SigE  58.06 
 
 
235 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.785691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1733  sporulation sigma factor SigE  58.06 
 
 
235 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265453  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2290  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  58.89 
 
 
207 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.345877  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3731  sporulation sigma factor SigE  57.14 
 
 
239 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278458  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2553  sporulation sigma factor SigE  56.12 
 
 
239 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000344705  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3949  sporulation sigma factor SigE  56.12 
 
 
239 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000781708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3755  sporulation sigma factor SigE  56.12 
 
 
239 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00369355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1236  sporulation sigma factor SigE  56.12 
 
 
239 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000024975  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3646  sporulation sigma factor SigE  56.12 
 
 
239 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000510031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3663  sporulation sigma factor SigE  56.12 
 
 
239 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000395259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3918  sporulation sigma factor SigE  56.12 
 
 
239 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000071882 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3957  sporulation sigma factor SigE  56.12 
 
 
239 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000112899  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4043  sporulation sigma factor SigE  56.12 
 
 
239 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4005  sporulation sigma factor SigE  56.12 
 
 
239 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09150  sporulation sigma factor SigE  55.91 
 
 
245 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000261644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0736  sporulation sigma factor SigK  57.73 
 
 
219 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000259555  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1553  sporulation sigma factor SigE  57.3 
 
 
242 aa  107  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000347236  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  55.1 
 
 
239 aa  107  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2001  sporulation sigma factor SigE  55.1 
 
 
241 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000755771  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1290  sporulation sigma factor SigE  54.08 
 
 
249 aa  106  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0852  sporulation sigma factor SigE  51.49 
 
 
243 aa  105  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0114797  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0686  sporulation sigma factor SigE  51.46 
 
 
241 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2062  sporulation sigma factor SigE  55.34 
 
 
243 aa  104  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000360983  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1426  sporulation sigma factor SigE  54.84 
 
 
241 aa  103  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0447  sporulation sigma factor SigE  56.12 
 
 
244 aa  103  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000743913  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2469  sporulation sigma factor SigE  56.57 
 
 
246 aa  102  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130703  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0835  sporulation sigma factor SigE  51.52 
 
 
240 aa  102  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.935984  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1066  sporulation sigma factor SigE  46.15 
 
 
241 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000178993  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0787  sporulation sigma factor SigE  48.08 
 
 
244 aa  99  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.761292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4054  sporulation sigma factor SigE  54.84 
 
 
249 aa  93.2  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0788  sporulation sigma factor SigG  45.78 
 
 
255 aa  72  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667987  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2870  sporulation sigma factor SigG  40.23 
 
 
273 aa  71.2  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000515832  hitchhiker  0.0000000000171975 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09160  sporulation sigma factor SigG  42.53 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000197734  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2468  sporulation sigma factor SigG  43.37 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000740675  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0486  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  46.43 
 
 
379 aa  68.2  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07020  sporulation sigma factor SigF  43.75 
 
 
257 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0234  RpoD family RNA polymerase sigma factor  39.25 
 
 
371 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417606  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1224  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  44.74 
 
 
257 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0121865  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2284  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  50.82 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2000  sporulation sigma factor SigG  40.23 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000480045  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2014  sporulation sigma factor SigG  40.23 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1732  sporulation sigma factor SigG  40.23 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0249664  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0937  RNA polymerase sigma-70 factor family protein  41.98 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1079  RNA polymerase sigma factor RpoS  40.66 
 
 
296 aa  65.5  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0677  RNA polymerase sigma-38 factor RpoS  34.21 
 
 
322 aa  65.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.632708  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1552  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  44.29 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178805  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1231  RNA polymerase, sigma 28 subunit  38.14 
 
 
294 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.927052  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1008  RNA polymerase, sigma 28 subunit  44.93 
 
 
289 aa  64.3  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000100967  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1813  RNA polymerase, sigma 28 subunit  44.93 
 
 
304 aa  64.3  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.130349  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1426  RNA polymerase sigma factor RpoD  45.35 
 
 
369 aa  64.3  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0144524  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0853  sporulation sigma factor SigG  37.76 
 
 
272 aa  64.3  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0182418  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1031  sporulation sigma factor SigG  41.46 
 
 
259 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000174079  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1291  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  45.59 
 
 
259 aa  64.3  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1901  sporulation sigma factor SigG  42.31 
 
 
259 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0863  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  46.77 
 
 
245 aa  63.5  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1436  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  37.23 
 
 
344 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.121871  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0374  sporulation sigma factor SigF  37.04 
 
 
252 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1836  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  50 
 
 
596 aa  62.8  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2061  sporulation sigma factor SigG  37.93 
 
 
257 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147139  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1354  RNA polymerase sigma factor RpoS  39.22 
 
 
359 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.19929  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1453  RNA polymerase sigma factor RpoS  39.22 
 
 
361 aa  62  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122572  normal  0.421204 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0053  RNA polymerase sigma factor RpoS  39.22 
 
 
359 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0962717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0448  sporulation sigma factor SigG  39.08 
 
 
257 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243038  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2226  RNA polymerase sigma factor RpoS  39.22 
 
 
363 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2198  RNA polymerase sigma factor RpoS  39.22 
 
 
359 aa  62  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.524707  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1425  sporulation sigma factor SigG  41.38 
 
 
255 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00153435  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2506  RNA polymerase sigma subunit RpoS (sigma-38)  39.56 
 
 
321 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2236  RNA polymerase sigma factor RpoS  39.22 
 
 
359 aa  62  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1116  RNA polymerase sigma factor RpoS  39.22 
 
 
359 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2066  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  42.68 
 
 
259 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000506599  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>