More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2062 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2062  sporulation sigma factor SigE  100 
 
 		 243 aa  489  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000360983  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0447  sporulation sigma factor SigE  83.61 
 
 		 244 aa  408  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000743913  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1066  sporulation sigma factor SigE  72.41 
 
 		 241 aa  349  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000178993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0852  sporulation sigma factor SigE  71.97 
 
 		 243 aa  346  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0114797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2001  sporulation sigma factor SigE  72.34 
 
 		 241 aa  341  5.999999999999999e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000755771  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0686  sporulation sigma factor SigE  75.34 
 
 		 241 aa  340  9e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1426  sporulation sigma factor SigE  76.42 
 
 		 241 aa  337  7e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2015  sporulation sigma factor SigE  77.31 
 
 		 235 aa  336  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.785691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1733  sporulation sigma factor SigE  77.31 
 
 		 235 aa  336  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265453  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1290  sporulation sigma factor SigE  73.39 
 
 		 249 aa  335  2.9999999999999997e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1030  sporulation sigma factor SigE  70.34 
 
 		 239 aa  333  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000129886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1900  sporulation sigma factor SigE  74.65 
 
 		 239 aa  330  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  71.55 
 
 		 239 aa  329  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3918  sporulation sigma factor SigE  68.49 
 
 		 239 aa  329  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000071882 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3949  sporulation sigma factor SigE  68.49 
 
 		 239 aa  329  3e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000781708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3755  sporulation sigma factor SigE  68.49 
 
 		 239 aa  329  3e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00369355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3646  sporulation sigma factor SigE  68.49 
 
 		 239 aa  329  3e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000510031  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3731  sporulation sigma factor SigE  68.49 
 
 		 239 aa  328  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3663  sporulation sigma factor SigE  68.49 
 
 		 239 aa  329  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000395259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1236  sporulation sigma factor SigE  68.49 
 
 		 239 aa  329  3e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000024975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4043  sporulation sigma factor SigE  68.49 
 
 		 239 aa  329  3e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3957  sporulation sigma factor SigE  68.49 
 
 		 239 aa  329  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000112899  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4005  sporulation sigma factor SigE  68.49 
 
 		 239 aa  329  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2553  sporulation sigma factor SigE  68.07 
 
 		 239 aa  328  7e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000344705  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4054  sporulation sigma factor SigE  74.65 
 
 		 249 aa  318  7e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09150  sporulation sigma factor SigE  65.71 
 
 		 245 aa  312  3.9999999999999997e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000261644  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0835  sporulation sigma factor SigE  70.89 
 
 		 240 aa  311  5.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.935984  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2469  sporulation sigma factor SigE  73.49 
 
 		 246 aa  310  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0787  sporulation sigma factor SigE  62.96 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.761292  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1553  sporulation sigma factor SigE  67.29 
 
 		 242 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000347236  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2798  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  50.23 
 
 		 234 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0982  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  50.25 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1501  sporulation sigma factor SigK  47.25 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1012  sporulation sigma factor SigK  49.3 
 
 		 236 aa  201  6e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1582  sporulation sigma factor SigK  50.52 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000492275  normal  0.195753 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05860  sporulation sigma factor SigK  47.71 
 
 		 232 aa  195  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1738  sporulation sigma factor SigK  44.34 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.475543  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  48.37 
 
 		 236 aa  192  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4421  sporulation sigma factor SigK  50.48 
 
 		 265 aa  191  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2021  sporulation sigma factor SigK  44.34 
 
 		 233 aa  191  8e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.653409  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4459  sporulation sigma factor SigK  50.48 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177817  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3065  sporulation sigma factor SigK  50.48 
 
 		 237 aa  190  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4236  sporulation sigma factor SigK  50.48 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4074  sporulation sigma factor SigK  50.48 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4190  sporulation sigma factor SigK  50.48 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4084  sporulation sigma factor SigK  50.48 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4566  sporulation sigma factor SigK  50.48 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4472  sporulation sigma factor SigK  50.48 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0778  sporulation sigma factor SigK  50.48 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.377161  hitchhiker  0.0088749 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3546  sporulation sigma factor SigK  43.42 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0982  sporulation sigma factor SigK  48.86 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0517  sporulation sigma factor SigK  43.72 
 
 		 244 aa  188  5e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  43.93 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0736  sporulation sigma factor SigK  44.09 
 
 		 219 aa  184  9e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000259555  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2655  sporulation sigma factor SigK  44.91 
 
 		 232 aa  168  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2290  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  44.79 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.345877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4418  RNA polymerase sigma-K factor  55.08 
 
 		 149 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1770  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  59.38 
 
 		 114 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.692748  normal  0.378996 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0912  sigma-70 region 4 domain-containing protein  45.54 
 
 		 118 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0853  sporulation sigma factor SigG  31.72 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0182418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0788  sporulation sigma factor SigG  32.81 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667987  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1425  sporulation sigma factor SigG  33.47 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00153435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09160  sporulation sigma factor SigG  32.14 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000197734  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1552  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  32.26 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178805  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0997  sigma-70 region 2 domain-containing protein  55.34 
 
 		 118 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1291  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  32.67 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2061  sporulation sigma factor SigG  31.91 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147139  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0448  sporulation sigma factor SigG  31.54 
 
 		 257 aa  99  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243038  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1732  sporulation sigma factor SigG  31.03 
 
 		 257 aa  98.6  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0249664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1067  sporulation sigma factor SigG  31.95 
 
 		 257 aa  98.6  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000166979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0836  sporulation sigma factor SigG  32.49 
 
 		 234 aa  98.6  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.904059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0687  sporulation sigma factor SigG  33.2 
 
 		 257 aa  98.6  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2014  sporulation sigma factor SigG  31.27 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0501  sigma 28 (flagella/sporulation)  45.19 
 
 		 126 aa  96.7  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2552  sporulation sigma factor SigG  30.15 
 
 		 259 aa  96.7  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000004552  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1311  sporulation sigma factor SigG  33.19 
 
 		 269 aa  95.1  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000268367  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3948  sporulation sigma factor SigG  29.77 
 
 		 289 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000196829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3754  sporulation sigma factor SigG  29.77 
 
 		 289 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000419985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3645  sporulation sigma factor SigG  29.77 
 
 		 289 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.74076e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3662  sporulation sigma factor SigG  29.77 
 
 		 289 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000167357  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4004  sporulation sigma factor SigG  29.77 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4042  sporulation sigma factor SigG  29.77 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000307551  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2468  sporulation sigma factor SigG  30.35 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000740675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3917  sporulation sigma factor SigG  29.77 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000372162 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1737  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  43.52 
 
 		 113 aa  94.4  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0277937 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3955  sporulation sigma factor SigG  29.77 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000614575  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1680  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  31.91 
 
 		 232 aa  94.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2000  sporulation sigma factor SigG  30.04 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000480045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4053  sporulation sigma factor SigG  32.44 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000132793  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1237  sporulation sigma factor SigG  29.39 
 
 		 259 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2870  sporulation sigma factor SigG  30.65 
 
 		 273 aa  92.8  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000515832  hitchhiker  0.0000000000171975 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1031  sporulation sigma factor SigG  29.88 
 
 		 259 aa  92.4  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000174079  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0120  RNA polymerase, sigma 28 subunit  32.16 
 
 		 246 aa  92.4  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3730  sporulation sigma factor SigG  29.39 
 
 		 292 aa  92  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1901  sporulation sigma factor SigG  29.48 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2284  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  30.65 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2771  sporulation sigma factor SigF  29.22 
 
 		 252 aa  89  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000547183  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0975  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  25.79 
 
 		 285 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000391946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12400  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  29.27 
 
 		 358 aa  86.7  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0607  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0064  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  28.46 
 
 		 285 aa  86.7  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.534501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>