More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0835 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0835  sporulation sigma factor SigE  100 
 
 
240 aa  481  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.935984  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1290  sporulation sigma factor SigE  71.3 
 
 
249 aa  317  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1066  sporulation sigma factor SigE  73.83 
 
 
241 aa  316  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000178993  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0852  sporulation sigma factor SigE  73.36 
 
 
243 aa  315  3e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0114797  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3731  sporulation sigma factor SigE  70.89 
 
 
239 aa  313  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278458  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2553  sporulation sigma factor SigE  66.67 
 
 
239 aa  313  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000344705  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3918  sporulation sigma factor SigE  70.89 
 
 
239 aa  312  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000071882 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3949  sporulation sigma factor SigE  70.89 
 
 
239 aa  312  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000781708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3755  sporulation sigma factor SigE  70.89 
 
 
239 aa  312  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00369355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3646  sporulation sigma factor SigE  70.89 
 
 
239 aa  312  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000510031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3663  sporulation sigma factor SigE  70.89 
 
 
239 aa  312  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000395259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4043  sporulation sigma factor SigE  70.89 
 
 
239 aa  312  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4005  sporulation sigma factor SigE  70.89 
 
 
239 aa  312  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2469  sporulation sigma factor SigE  69.13 
 
 
246 aa  312  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1236  sporulation sigma factor SigE  70.89 
 
 
239 aa  312  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000024975  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3957  sporulation sigma factor SigE  70.89 
 
 
239 aa  312  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000112899  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0686  sporulation sigma factor SigE  67.65 
 
 
241 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2062  sporulation sigma factor SigE  70.89 
 
 
243 aa  311  5.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000360983  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2001  sporulation sigma factor SigE  71.43 
 
 
241 aa  311  6.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000755771  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1030  sporulation sigma factor SigE  64.71 
 
 
239 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000129886  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1426  sporulation sigma factor SigE  71.77 
 
 
241 aa  305  3e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1900  sporulation sigma factor SigE  64.44 
 
 
239 aa  305  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  64.73 
 
 
239 aa  303  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0447  sporulation sigma factor SigE  68 
 
 
244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000743913  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2015  sporulation sigma factor SigE  64.66 
 
 
235 aa  300  1e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.785691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1733  sporulation sigma factor SigE  64.66 
 
 
235 aa  300  1e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265453  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4054  sporulation sigma factor SigE  69.44 
 
 
249 aa  289  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1553  sporulation sigma factor SigE  66.67 
 
 
242 aa  286  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000347236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09150  sporulation sigma factor SigE  66.36 
 
 
245 aa  286  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000261644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0787  sporulation sigma factor SigE  65.42 
 
 
244 aa  284  9e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.761292  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0982  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  50.25 
 
 
256 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2798  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  47.56 
 
 
234 aa  201  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  45.54 
 
 
239 aa  198  7e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2021  sporulation sigma factor SigK  46.01 
 
 
233 aa  198  7.999999999999999e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.653409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1738  sporulation sigma factor SigK  46.01 
 
 
233 aa  198  7.999999999999999e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.475543  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1501  sporulation sigma factor SigK  47.87 
 
 
231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0982  sporulation sigma factor SigK  47.98 
 
 
245 aa  194  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3546  sporulation sigma factor SigK  44.26 
 
 
249 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1582  sporulation sigma factor SigK  47.42 
 
 
226 aa  193  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000492275  normal  0.195753 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  48.86 
 
 
236 aa  192  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05860  sporulation sigma factor SigK  47.6 
 
 
232 aa  191  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4421  sporulation sigma factor SigK  43.28 
 
 
265 aa  190  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4236  sporulation sigma factor SigK  44.84 
 
 
237 aa  188  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4074  sporulation sigma factor SigK  44.84 
 
 
237 aa  188  8e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4084  sporulation sigma factor SigK  44.84 
 
 
237 aa  188  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0778  sporulation sigma factor SigK  44.84 
 
 
237 aa  188  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.377161  hitchhiker  0.0088749 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4566  sporulation sigma factor SigK  44.84 
 
 
237 aa  188  8e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4472  sporulation sigma factor SigK  44.84 
 
 
237 aa  188  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4459  sporulation sigma factor SigK  44.84 
 
 
237 aa  188  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4190  sporulation sigma factor SigK  44.84 
 
 
237 aa  188  8e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3065  sporulation sigma factor SigK  44.84 
 
 
237 aa  187  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1012  sporulation sigma factor SigK  46.67 
 
 
236 aa  186  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0517  sporulation sigma factor SigK  40.97 
 
 
244 aa  185  5e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0736  sporulation sigma factor SigK  45.58 
 
 
219 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000259555  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2655  sporulation sigma factor SigK  43.6 
 
 
232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2290  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  46.07 
 
 
207 aa  158  8e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.345877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4418  RNA polymerase sigma-K factor  48.15 
 
 
149 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1770  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  50.98 
 
 
114 aa  105  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.692748  normal  0.378996 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2014  sporulation sigma factor SigG  33.59 
 
 
257 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1732  sporulation sigma factor SigG  33.59 
 
 
257 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0249664  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0997  sigma-70 region 2 domain-containing protein  51.52 
 
 
118 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0853  sporulation sigma factor SigG  31.64 
 
 
272 aa  102  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0182418  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0912  sigma-70 region 4 domain-containing protein  44.64 
 
 
118 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09160  sporulation sigma factor SigG  32.39 
 
 
260 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000197734  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1291  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  33.76 
 
 
259 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0501  sigma 28 (flagella/sporulation)  43.1 
 
 
126 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0448  sporulation sigma factor SigG  33.73 
 
 
257 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243038  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0836  sporulation sigma factor SigG  31.91 
 
 
234 aa  99.8  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.904059  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1067  sporulation sigma factor SigG  33.9 
 
 
257 aa  99  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000166979  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2061  sporulation sigma factor SigG  34.13 
 
 
257 aa  97.8  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1237  sporulation sigma factor SigG  30.38 
 
 
259 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299824  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2870  sporulation sigma factor SigG  33.06 
 
 
273 aa  97.8  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000515832  hitchhiker  0.0000000000171975 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4042  sporulation sigma factor SigG  30.86 
 
 
259 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000307551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3730  sporulation sigma factor SigG  30.59 
 
 
292 aa  97.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2552  sporulation sigma factor SigG  30.86 
 
 
259 aa  97.1  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000004552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3917  sporulation sigma factor SigG  30.86 
 
 
259 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000372162 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4004  sporulation sigma factor SigG  30.86 
 
 
259 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3955  sporulation sigma factor SigG  30.86 
 
 
259 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000614575  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3948  sporulation sigma factor SigG  30.86 
 
 
289 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000196829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3754  sporulation sigma factor SigG  30.86 
 
 
289 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000419985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3645  sporulation sigma factor SigG  30.86 
 
 
289 aa  96.7  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.74076e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3662  sporulation sigma factor SigG  30.86 
 
 
289 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000167357  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1552  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  30.86 
 
 
256 aa  96.3  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178805  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0788  sporulation sigma factor SigG  32.14 
 
 
255 aa  95.9  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667987  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1425  sporulation sigma factor SigG  33.2 
 
 
255 aa  95.1  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00153435  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1737  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  44.44 
 
 
113 aa  95.1  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0277937 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0687  sporulation sigma factor SigG  31.6 
 
 
257 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1680  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  32.34 
 
 
232 aa  94.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1031  sporulation sigma factor SigG  31.3 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000174079  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2000  sporulation sigma factor SigG  31.08 
 
 
256 aa  92.4  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000480045  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1311  sporulation sigma factor SigG  31.86 
 
 
269 aa  92.4  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000268367  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2468  sporulation sigma factor SigG  33.47 
 
 
260 aa  92.4  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000740675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1901  sporulation sigma factor SigG  30.49 
 
 
259 aa  91.7  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1744  sporulation sigma factor SigF  30.29 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0975  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  26.91 
 
 
285 aa  89.4  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000391946  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0374  sporulation sigma factor SigF  31.67 
 
 
252 aa  89  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1231  RNA polymerase, sigma 28 subunit  29.32 
 
 
294 aa  89.4  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.927052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4053  sporulation sigma factor SigG  31.56 
 
 
257 aa  89  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000132793  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2771  sporulation sigma factor SigF  31.54 
 
 
252 aa  87.8  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000547183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4205  sporulation sigma factor SigF  31.54 
 
 
252 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000245022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>