More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1426 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1426  sporulation sigma factor SigE  100 
 
 
241 aa  484  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1066  sporulation sigma factor SigE  75.83 
 
 
241 aa  364  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000178993  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0686  sporulation sigma factor SigE  74.17 
 
 
241 aa  363  2e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0852  sporulation sigma factor SigE  76.39 
 
 
243 aa  353  1e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0114797  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2062  sporulation sigma factor SigE  69.83 
 
 
243 aa  339  2.9999999999999998e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000360983  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  74.88 
 
 
239 aa  335  2.9999999999999997e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1900  sporulation sigma factor SigE  70.29 
 
 
239 aa  331  5e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1030  sporulation sigma factor SigE  68.88 
 
 
239 aa  329  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000129886  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1290  sporulation sigma factor SigE  75.23 
 
 
249 aa  328  6e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0447  sporulation sigma factor SigE  74.18 
 
 
244 aa  325  5e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000743913  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3731  sporulation sigma factor SigE  69.07 
 
 
239 aa  324  9e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278458  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2553  sporulation sigma factor SigE  69.07 
 
 
239 aa  324  9e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000344705  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3949  sporulation sigma factor SigE  69.07 
 
 
239 aa  323  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000781708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3755  sporulation sigma factor SigE  69.07 
 
 
239 aa  323  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00369355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3957  sporulation sigma factor SigE  69.07 
 
 
239 aa  323  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000112899  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3646  sporulation sigma factor SigE  69.07 
 
 
239 aa  323  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000510031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3663  sporulation sigma factor SigE  69.07 
 
 
239 aa  323  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000395259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3918  sporulation sigma factor SigE  69.07 
 
 
239 aa  323  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000071882 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4043  sporulation sigma factor SigE  69.07 
 
 
239 aa  323  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1236  sporulation sigma factor SigE  69.07 
 
 
239 aa  323  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000024975  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4005  sporulation sigma factor SigE  69.07 
 
 
239 aa  323  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2001  sporulation sigma factor SigE  65 
 
 
241 aa  319  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000755771  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4054  sporulation sigma factor SigE  71.91 
 
 
249 aa  317  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1553  sporulation sigma factor SigE  71.56 
 
 
242 aa  316  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000347236  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2015  sporulation sigma factor SigE  67.81 
 
 
235 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.785691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1733  sporulation sigma factor SigE  67.81 
 
 
235 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265453  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09150  sporulation sigma factor SigE  65.68 
 
 
245 aa  306  1.0000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000261644  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0835  sporulation sigma factor SigE  71.77 
 
 
240 aa  305  3e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.935984  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2469  sporulation sigma factor SigE  67.59 
 
 
246 aa  291  6e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0787  sporulation sigma factor SigE  64.19 
 
 
244 aa  281  6.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.761292  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0982  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  49.27 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2798  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  50.73 
 
 
234 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1501  sporulation sigma factor SigK  44.02 
 
 
231 aa  202  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05860  sporulation sigma factor SigK  49.02 
 
 
232 aa  195  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  48.99 
 
 
239 aa  193  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1012  sporulation sigma factor SigK  47.37 
 
 
236 aa  192  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1582  sporulation sigma factor SigK  48.21 
 
 
226 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000492275  normal  0.195753 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  46.08 
 
 
236 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2021  sporulation sigma factor SigK  44.81 
 
 
233 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.653409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1738  sporulation sigma factor SigK  44.81 
 
 
233 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.475543  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0982  sporulation sigma factor SigK  45.59 
 
 
245 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0517  sporulation sigma factor SigK  43.96 
 
 
244 aa  186  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3546  sporulation sigma factor SigK  43.75 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3065  sporulation sigma factor SigK  42.04 
 
 
237 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4236  sporulation sigma factor SigK  42.04 
 
 
237 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4190  sporulation sigma factor SigK  42.04 
 
 
237 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4074  sporulation sigma factor SigK  42.04 
 
 
237 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4084  sporulation sigma factor SigK  42.04 
 
 
237 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4566  sporulation sigma factor SigK  42.04 
 
 
237 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4472  sporulation sigma factor SigK  42.04 
 
 
237 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0778  sporulation sigma factor SigK  42.04 
 
 
237 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.377161  hitchhiker  0.0088749 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4459  sporulation sigma factor SigK  42.04 
 
 
237 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177817  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4421  sporulation sigma factor SigK  42.04 
 
 
265 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0736  sporulation sigma factor SigK  44.24 
 
 
219 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000259555  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2655  sporulation sigma factor SigK  44.88 
 
 
232 aa  168  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2290  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  46.43 
 
 
207 aa  166  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.345877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4418  RNA polymerase sigma-K factor  45.77 
 
 
149 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1770  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  57.14 
 
 
114 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.692748  normal  0.378996 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0912  sigma-70 region 4 domain-containing protein  43.1 
 
 
118 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0997  sigma-70 region 2 domain-containing protein  54.84 
 
 
118 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2870  sporulation sigma factor SigG  32.92 
 
 
273 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000515832  hitchhiker  0.0000000000171975 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2000  sporulation sigma factor SigG  30.62 
 
 
256 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000480045  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0788  sporulation sigma factor SigG  32.28 
 
 
255 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1291  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  32.28 
 
 
259 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1425  sporulation sigma factor SigG  31.64 
 
 
255 aa  103  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00153435  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1552  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  29.07 
 
 
256 aa  102  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178805  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1680  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  33.62 
 
 
232 aa  102  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0853  sporulation sigma factor SigG  29.78 
 
 
272 aa  102  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0182418  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0687  sporulation sigma factor SigG  32.16 
 
 
257 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1737  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  44.44 
 
 
113 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0277937 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2061  sporulation sigma factor SigG  30.71 
 
 
257 aa  99.8  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147139  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09160  sporulation sigma factor SigG  30.94 
 
 
260 aa  95.9  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000197734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3442  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  32.11 
 
 
261 aa  95.5  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1067  sporulation sigma factor SigG  31.51 
 
 
257 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000166979  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0501  sigma 28 (flagella/sporulation)  43.62 
 
 
126 aa  94  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0448  sporulation sigma factor SigG  31.1 
 
 
257 aa  94  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243038  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1224  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  33.88 
 
 
257 aa  93.2  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0121865  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1008  RNA polymerase, sigma 28 subunit  28.51 
 
 
289 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000100967  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1496  sigma 28 (flagella/sporulation)  31.08 
 
 
270 aa  90.1  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2552  sporulation sigma factor SigG  29.2 
 
 
259 aa  90.1  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000004552  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0064  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  29.64 
 
 
285 aa  90.1  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.534501  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1255  RNA polymerase sigma S (sigma-38) factor transcription regulator protein  27.38 
 
 
343 aa  89.7  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2284  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  30.38 
 
 
249 aa  89.7  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1744  sporulation sigma factor SigF  31.13 
 
 
256 aa  89.4  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1844  RNA polymerase sigma factor RpoS  27.78 
 
 
362 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1732  sporulation sigma factor SigG  28.8 
 
 
257 aa  89.7  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0249664  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3369  RpoD family RNA polymerase sigma factor  28.4 
 
 
353 aa  89.7  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.453528  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1820  RNA polymerase sigma factor RpoS  27.78 
 
 
362 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.735784  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1731  RNA polymerase sigma factor RpoS  27.78 
 
 
361 aa  89.4  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194795  normal  0.148712 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1758  RNA polymerase sigma factor RpoS  27.78 
 
 
361 aa  89.4  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6562  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1203  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  30.17 
 
 
281 aa  89.4  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512753  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1354  RNA polymerase sigma factor RpoS  27.41 
 
 
359 aa  89  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.19929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2236  RNA polymerase sigma factor RpoS  27.41 
 
 
359 aa  89  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2365  RNA polymerase sigma factor RpoS  27.41 
 
 
359 aa  89  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5121  RNA polymerase sigma factor RpoS  27.41 
 
 
362 aa  89  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0496977  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1453  RNA polymerase sigma factor RpoS  27.41 
 
 
361 aa  89  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122572  normal  0.421204 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1116  RNA polymerase sigma factor RpoS  27.41 
 
 
359 aa  89  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1844  RNA polymerase sigma factor RpoS  27.41 
 
 
359 aa  89  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0053  RNA polymerase sigma factor RpoS  27.41 
 
 
359 aa  89  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0962717  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2198  RNA polymerase sigma factor RpoS  27.41 
 
 
359 aa  89  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.524707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>