More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0686 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0686  sporulation sigma factor SigE  100 
 
 		 241 aa  483  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1066  sporulation sigma factor SigE  83.82 
 
 		 241 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000178993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0852  sporulation sigma factor SigE  82.46 
 
 		 243 aa  371  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0114797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1426  sporulation sigma factor SigE  74.17 
 
 		 241 aa  351  5e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4054  sporulation sigma factor SigE  76.47 
 
 		 249 aa  345  3e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1290  sporulation sigma factor SigE  77.06 
 
 		 249 aa  342  4e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2062  sporulation sigma factor SigE  75.34 
 
 		 243 aa  340  9e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000360983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1900  sporulation sigma factor SigE  71.31 
 
 		 239 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1030  sporulation sigma factor SigE  77.1 
 
 		 239 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000129886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3731  sporulation sigma factor SigE  72.34 
 
 		 239 aa  335  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278458  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2001  sporulation sigma factor SigE  69.53 
 
 		 241 aa  334  5.999999999999999e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000755771  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0447  sporulation sigma factor SigE  76.17 
 
 		 244 aa  333  1e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000743913  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3949  sporulation sigma factor SigE  73.91 
 
 		 239 aa  333  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000781708  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3957  sporulation sigma factor SigE  73.91 
 
 		 239 aa  333  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000112899  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3755  sporulation sigma factor SigE  73.91 
 
 		 239 aa  333  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00369355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3646  sporulation sigma factor SigE  73.91 
 
 		 239 aa  333  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000510031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3663  sporulation sigma factor SigE  73.91 
 
 		 239 aa  333  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000395259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4043  sporulation sigma factor SigE  73.91 
 
 		 239 aa  333  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1236  sporulation sigma factor SigE  73.91 
 
 		 239 aa  333  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000024975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3918  sporulation sigma factor SigE  73.91 
 
 		 239 aa  333  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000071882 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4005  sporulation sigma factor SigE  73.91 
 
 		 239 aa  333  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2553  sporulation sigma factor SigE  77.1 
 
 		 239 aa  332  3e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000344705  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  71.79 
 
 		 239 aa  331  7.000000000000001e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2015  sporulation sigma factor SigE  69.26 
 
 		 235 aa  322  3e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.785691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1733  sporulation sigma factor SigE  69.26 
 
 		 235 aa  322  3e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265453  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1553  sporulation sigma factor SigE  72.9 
 
 		 242 aa  315  5e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000347236  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2469  sporulation sigma factor SigE  70.09 
 
 		 246 aa  314  6e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130703  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0835  sporulation sigma factor SigE  67.65 
 
 		 240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.935984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09150  sporulation sigma factor SigE  67.37 
 
 		 245 aa  310  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000261644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0787  sporulation sigma factor SigE  60.68 
 
 		 244 aa  288  5.0000000000000004e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.761292  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0982  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  50.24 
 
 		 256 aa  216  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2798  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  50.95 
 
 		 234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1501  sporulation sigma factor SigK  45.96 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1582  sporulation sigma factor SigK  51.28 
 
 		 226 aa  205  6e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000492275  normal  0.195753 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1012  sporulation sigma factor SigK  50.72 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05860  sporulation sigma factor SigK  49.29 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  49.07 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0982  sporulation sigma factor SigK  50 
 
 		 245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2021  sporulation sigma factor SigK  46.23 
 
 		 233 aa  194  9e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.653409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1738  sporulation sigma factor SigK  45.75 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.475543  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3546  sporulation sigma factor SigK  45.41 
 
 		 249 aa  192  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4421  sporulation sigma factor SigK  47.66 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4472  sporulation sigma factor SigK  47.66 
 
 		 237 aa  189  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4236  sporulation sigma factor SigK  47.66 
 
 		 237 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4074  sporulation sigma factor SigK  47.66 
 
 		 237 aa  189  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4084  sporulation sigma factor SigK  47.66 
 
 		 237 aa  189  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3065  sporulation sigma factor SigK  47.66 
 
 		 237 aa  189  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0778  sporulation sigma factor SigK  47.66 
 
 		 237 aa  189  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.377161  hitchhiker  0.0088749 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4566  sporulation sigma factor SigK  47.66 
 
 		 237 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4459  sporulation sigma factor SigK  47.66 
 
 		 237 aa  189  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177817  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  47.57 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4190  sporulation sigma factor SigK  47.66 
 
 		 237 aa  189  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0517  sporulation sigma factor SigK  44.66 
 
 		 244 aa  189  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0736  sporulation sigma factor SigK  44.29 
 
 		 219 aa  185  6e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000259555  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2655  sporulation sigma factor SigK  44.08 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2290  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  45.83 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.345877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4418  RNA polymerase sigma-K factor  55.56 
 
 		 149 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1770  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  58.33 
 
 		 114 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.692748  normal  0.378996 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0912  sigma-70 region 4 domain-containing protein  44.64 
 
 		 118 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0997  sigma-70 region 2 domain-containing protein  51.46 
 
 		 118 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0788  sporulation sigma factor SigG  32.02 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667987  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1680  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  35.74 
 
 		 232 aa  99  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2061  sporulation sigma factor SigG  31.78 
 
 		 257 aa  99  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147139  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2000  sporulation sigma factor SigG  30.74 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000480045  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1291  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  30.8 
 
 		 259 aa  96.3  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1737  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  42.59 
 
 		 113 aa  95.9  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0277937 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2870  sporulation sigma factor SigG  33.2 
 
 		 273 aa  95.9  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000515832  hitchhiker  0.0000000000171975 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09160  sporulation sigma factor SigG  30.48 
 
 		 260 aa  95.5  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000197734  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2468  sporulation sigma factor SigG  31.91 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000740675  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0853  sporulation sigma factor SigG  29.96 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0182418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0501  sigma 28 (flagella/sporulation)  44.68 
 
 		 126 aa  94.7  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0448  sporulation sigma factor SigG  31.01 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243038  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1552  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  29.37 
 
 		 256 aa  92.8  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1901  sporulation sigma factor SigG  29.77 
 
 		 259 aa  92.8  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1744  sporulation sigma factor SigF  31.84 
 
 		 256 aa  92.8  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3369  RpoD family RNA polymerase sigma factor  28.97 
 
 		 353 aa  93.2  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.453528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1311  sporulation sigma factor SigG  31.62 
 
 		 269 aa  92.4  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000268367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1031  sporulation sigma factor SigG  29.39 
 
 		 259 aa  92.4  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000174079  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1425  sporulation sigma factor SigG  30 
 
 		 255 aa  92  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00153435  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1732  sporulation sigma factor SigG  30.53 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0249664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2014  sporulation sigma factor SigG  30.53 
 
 		 257 aa  92  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3442  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  29.72 
 
 		 261 aa  92  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12400  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  29.67 
 
 		 358 aa  92  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0607  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4683  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  29.92 
 
 		 367 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0687  sporulation sigma factor SigG  30.67 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3948  sporulation sigma factor SigG  28.9 
 
 		 289 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000196829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3754  sporulation sigma factor SigG  28.9 
 
 		 289 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000419985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3645  sporulation sigma factor SigG  28.9 
 
 		 289 aa  90.5  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.74076e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3662  sporulation sigma factor SigG  28.9 
 
 		 289 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000167357  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4004  sporulation sigma factor SigG  28.9 
 
 		 259 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4042  sporulation sigma factor SigG  28.9 
 
 		 259 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000307551  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2284  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  30.33 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3955  sporulation sigma factor SigG  28.9 
 
 		 259 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000614575  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3917  sporulation sigma factor SigG  28.9 
 
 		 259 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000372162 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2552  sporulation sigma factor SigG  28.9 
 
 		 259 aa  90.5  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000004552  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1067  sporulation sigma factor SigG  30.04 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000166979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3903  sporulation sigma factor SigF  31.45 
 
 		 252 aa  90.1  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.715722  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4142  sporulation sigma factor SigF  31.45 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000821538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3983  sporulation sigma factor SigF  31.45 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00304797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1056  sporulation sigma factor SigF  31.45 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.656155  normal  0.0661655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>