More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3546 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3546  sporulation sigma factor SigK  100 
 
 		 249 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2798  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  61.6 
 
 		 234 aa  292  4e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1582  sporulation sigma factor SigK  60.7 
 
 		 226 aa  288  7e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000492275  normal  0.195753 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0982  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  57.44 
 
 		 256 aa  285  4e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0982  sporulation sigma factor SigK  57.2 
 
 		 245 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  57.08 
 
 		 236 aa  259  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0517  sporulation sigma factor SigK  54.32 
 
 		 244 aa  259  4e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4190  sporulation sigma factor SigK  55.7 
 
 		 237 aa  254  6e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4236  sporulation sigma factor SigK  55.7 
 
 		 237 aa  254  6e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4074  sporulation sigma factor SigK  55.7 
 
 		 237 aa  254  6e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4084  sporulation sigma factor SigK  55.7 
 
 		 237 aa  254  6e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4566  sporulation sigma factor SigK  55.7 
 
 		 237 aa  254  6e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4459  sporulation sigma factor SigK  55.7 
 
 		 237 aa  254  6e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4472  sporulation sigma factor SigK  55.7 
 
 		 237 aa  254  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0778  sporulation sigma factor SigK  55.7 
 
 		 237 aa  254  6e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.377161  hitchhiker  0.0088749 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3065  sporulation sigma factor SigK  55.7 
 
 		 237 aa  254  8e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4421  sporulation sigma factor SigK  55.7 
 
 		 265 aa  254  9e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1501  sporulation sigma factor SigK  55.37 
 
 		 231 aa  254  9e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1012  sporulation sigma factor SigK  54.47 
 
 		 236 aa  245  4e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  52.56 
 
 		 239 aa  241  7e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05860  sporulation sigma factor SigK  53.25 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2021  sporulation sigma factor SigK  50.66 
 
 		 233 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.653409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1738  sporulation sigma factor SigK  50.66 
 
 		 233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.475543  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2469  sporulation sigma factor SigE  48.61 
 
 		 246 aa  194  8.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130703  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0835  sporulation sigma factor SigE  44.26 
 
 		 240 aa  194  9e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.935984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0686  sporulation sigma factor SigE  45.41 
 
 		 241 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09150  sporulation sigma factor SigE  46.58 
 
 		 245 aa  193  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000261644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0736  sporulation sigma factor SigK  47.73 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000259555  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2015  sporulation sigma factor SigE  43.06 
 
 		 235 aa  192  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.785691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1733  sporulation sigma factor SigE  43.06 
 
 		 235 aa  192  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265453  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1290  sporulation sigma factor SigE  44.14 
 
 		 249 aa  192  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1030  sporulation sigma factor SigE  44.14 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000129886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1900  sporulation sigma factor SigE  43.69 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2062  sporulation sigma factor SigE  43.42 
 
 		 243 aa  189  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000360983  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1066  sporulation sigma factor SigE  44.59 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000178993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1553  sporulation sigma factor SigE  45.37 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000347236  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2290  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  51.96 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.345877  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2001  sporulation sigma factor SigE  44.14 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000755771  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4054  sporulation sigma factor SigE  51.12 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3731  sporulation sigma factor SigE  43.69 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278458  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0852  sporulation sigma factor SigE  44.24 
 
 		 243 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0114797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0447  sporulation sigma factor SigE  44.08 
 
 		 244 aa  184  9e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000743913  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3957  sporulation sigma factor SigE  43.24 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000112899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3949  sporulation sigma factor SigE  43.24 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000781708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3755  sporulation sigma factor SigE  43.24 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00369355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3646  sporulation sigma factor SigE  43.24 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000510031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3663  sporulation sigma factor SigE  43.24 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000395259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1236  sporulation sigma factor SigE  43.24 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000024975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4043  sporulation sigma factor SigE  43.24 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4005  sporulation sigma factor SigE  43.24 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2553  sporulation sigma factor SigE  43.24 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000344705  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3918  sporulation sigma factor SigE  43.24 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000071882 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  43.24 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1426  sporulation sigma factor SigE  43.75 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4418  RNA polymerase sigma-K factor  59.48 
 
 		 149 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2655  sporulation sigma factor SigK  41.32 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0787  sporulation sigma factor SigE  42.79 
 
 		 244 aa  176  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.761292  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0997  sigma-70 region 2 domain-containing protein  59.23 
 
 		 118 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0912  sigma-70 region 4 domain-containing protein  58.93 
 
 		 118 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1770  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  53.23 
 
 		 114 aa  129  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.692748  normal  0.378996 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0501  sigma 28 (flagella/sporulation)  50 
 
 		 126 aa  125  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1737  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  48.18 
 
 		 113 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0277937 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0863  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  34.53 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0374  sporulation sigma factor SigF  31.44 
 
 		 252 aa  95.5  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1425  sporulation sigma factor SigG  30.67 
 
 		 255 aa  95.1  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00153435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07020  sporulation sigma factor SigF  31.32 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3948  sporulation sigma factor SigG  30.67 
 
 		 289 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000196829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3754  sporulation sigma factor SigG  30.67 
 
 		 289 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000419985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3645  sporulation sigma factor SigG  30.67 
 
 		 289 aa  93.2  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.74076e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3662  sporulation sigma factor SigG  30.67 
 
 		 289 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000167357  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4042  sporulation sigma factor SigG  30.67 
 
 		 259 aa  92.8  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000307551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1237  sporulation sigma factor SigG  30.67 
 
 		 259 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3917  sporulation sigma factor SigG  30.67 
 
 		 259 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000372162 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1680  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  32.14 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3955  sporulation sigma factor SigG  30.67 
 
 		 259 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000614575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4004  sporulation sigma factor SigG  30.67 
 
 		 259 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3730  sporulation sigma factor SigG  30.67 
 
 		 292 aa  92.4  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09160  sporulation sigma factor SigG  29.49 
 
 		 260 aa  92  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000197734  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2250  sporulation sigma factor SigF  29.69 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2552  sporulation sigma factor SigG  29.18 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000004552  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1311  sporulation sigma factor SigG  30.21 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000268367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2870  sporulation sigma factor SigG  29.07 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000515832  hitchhiker  0.0000000000171975 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0853  sporulation sigma factor SigG  30.67 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0182418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2000  sporulation sigma factor SigG  29.55 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000480045  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1732  sporulation sigma factor SigG  30.22 
 
 		 257 aa  89.7  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0249664  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0788  sporulation sigma factor SigG  34.56 
 
 		 255 aa  89.4  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667987  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1031  sporulation sigma factor SigG  29.78 
 
 		 259 aa  89  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000174079  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1901  sporulation sigma factor SigG  29.78 
 
 		 259 aa  89  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0448  sporulation sigma factor SigG  28.79 
 
 		 257 aa  89  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243038  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2014  sporulation sigma factor SigG  30.22 
 
 		 257 aa  88.6  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1744  sporulation sigma factor SigF  29.13 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0905  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  28.88 
 
 		 361 aa  88.6  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000725553  hitchhiker  0.000024964 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4142  sporulation sigma factor SigF  28.33 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000821538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3983  sporulation sigma factor SigF  28.33 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00304797  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3903  sporulation sigma factor SigF  28.33 
 
 		 252 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.715722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3829  sporulation sigma factor SigF  28.33 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000549151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1056  sporulation sigma factor SigF  28.33 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.656155  normal  0.0661655 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4094  sporulation sigma factor SigF  28.33 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5514999999999997e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4182  sporulation sigma factor SigF  28.33 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0460854  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4205  sporulation sigma factor SigF  28.33 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000245022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>