More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0982 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0982  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  100 
 
 		 256 aa  521  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2798  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  70.69 
 
 		 234 aa  333  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1582  sporulation sigma factor SigK  64.25 
 
 		 226 aa  286  2.9999999999999996e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000492275  normal  0.195753 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3546  sporulation sigma factor SigK  57.44 
 
 		 249 aa  285  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1012  sporulation sigma factor SigK  64.32 
 
 		 236 aa  273  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1501  sporulation sigma factor SigK  61.23 
 
 		 231 aa  270  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0517  sporulation sigma factor SigK  57.92 
 
 		 244 aa  267  1e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  58.33 
 
 		 236 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3065  sporulation sigma factor SigK  58.48 
 
 		 237 aa  263  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4472  sporulation sigma factor SigK  58.04 
 
 		 237 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0778  sporulation sigma factor SigK  58.04 
 
 		 237 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.377161  hitchhiker  0.0088749 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4421  sporulation sigma factor SigK  53.94 
 
 		 265 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4459  sporulation sigma factor SigK  58.04 
 
 		 237 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4236  sporulation sigma factor SigK  58.04 
 
 		 237 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4074  sporulation sigma factor SigK  58.04 
 
 		 237 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4084  sporulation sigma factor SigK  58.04 
 
 		 237 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4566  sporulation sigma factor SigK  58.04 
 
 		 237 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4190  sporulation sigma factor SigK  58.04 
 
 		 237 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0982  sporulation sigma factor SigK  56.65 
 
 		 245 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05860  sporulation sigma factor SigK  60.37 
 
 		 232 aa  258  9e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  54.39 
 
 		 239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2021  sporulation sigma factor SigK  56.89 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.653409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1738  sporulation sigma factor SigK  56.89 
 
 		 233 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.475543  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2001  sporulation sigma factor SigE  54.15 
 
 		 241 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000755771  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1900  sporulation sigma factor SigE  46.67 
 
 		 239 aa  222  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1030  sporulation sigma factor SigE  51.23 
 
 		 239 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000129886  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2553  sporulation sigma factor SigE  50.25 
 
 		 239 aa  219  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000344705  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2015  sporulation sigma factor SigE  51.22 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.785691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1733  sporulation sigma factor SigE  51.22 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3949  sporulation sigma factor SigE  50.25 
 
 		 239 aa  218  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000781708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3755  sporulation sigma factor SigE  50.25 
 
 		 239 aa  218  5e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00369355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3646  sporulation sigma factor SigE  50.25 
 
 		 239 aa  218  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000510031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3663  sporulation sigma factor SigE  50.25 
 
 		 239 aa  218  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000395259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4043  sporulation sigma factor SigE  50.25 
 
 		 239 aa  218  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1236  sporulation sigma factor SigE  50.25 
 
 		 239 aa  218  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000024975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3957  sporulation sigma factor SigE  50.25 
 
 		 239 aa  218  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000112899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3918  sporulation sigma factor SigE  50.25 
 
 		 239 aa  218  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000071882 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4005  sporulation sigma factor SigE  50.25 
 
 		 239 aa  218  5e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3731  sporulation sigma factor SigE  50.25 
 
 		 239 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278458  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0686  sporulation sigma factor SigE  50.24 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0852  sporulation sigma factor SigE  49.51 
 
 		 243 aa  216  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0114797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  49.03 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1426  sporulation sigma factor SigE  49.27 
 
 		 241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1290  sporulation sigma factor SigE  49.75 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2062  sporulation sigma factor SigE  50.25 
 
 		 243 aa  210  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000360983  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0736  sporulation sigma factor SigK  54.76 
 
 		 219 aa  209  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000259555  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1066  sporulation sigma factor SigE  49.27 
 
 		 241 aa  208  6e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000178993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0835  sporulation sigma factor SigE  50.25 
 
 		 240 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.935984  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1553  sporulation sigma factor SigE  51.22 
 
 		 242 aa  204  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000347236  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0447  sporulation sigma factor SigE  45.11 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000743913  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2290  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  55.21 
 
 		 207 aa  202  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.345877  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2469  sporulation sigma factor SigE  50.49 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0787  sporulation sigma factor SigE  47.32 
 
 		 244 aa  201  7e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.761292  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09150  sporulation sigma factor SigE  45.89 
 
 		 245 aa  199  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000261644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4054  sporulation sigma factor SigE  50.24 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2655  sporulation sigma factor SigK  42.61 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4418  RNA polymerase sigma-K factor  61.43 
 
 		 149 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0997  sigma-70 region 2 domain-containing protein  70.09 
 
 		 118 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0912  sigma-70 region 4 domain-containing protein  72.32 
 
 		 118 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1770  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  64.66 
 
 		 114 aa  156  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.692748  normal  0.378996 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0501  sigma 28 (flagella/sporulation)  57.8 
 
 		 126 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1737  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  55.75 
 
 		 113 aa  120  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0277937 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09160  sporulation sigma factor SigG  31.01 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000197734  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0788  sporulation sigma factor SigG  32.66 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667987  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1311  sporulation sigma factor SigG  30.23 
 
 		 269 aa  101  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000268367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1291  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  31.28 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2061  sporulation sigma factor SigG  31.67 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147139  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2000  sporulation sigma factor SigG  31.54 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000480045  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0448  sporulation sigma factor SigG  34.32 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243038  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2870  sporulation sigma factor SigG  30.16 
 
 		 273 aa  97.1  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000515832  hitchhiker  0.0000000000171975 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2468  sporulation sigma factor SigG  30.89 
 
 		 260 aa  95.9  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000740675  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0863  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  31.03 
 
 		 245 aa  93.6  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0624  RNA polymerase sigma factor RpoD  30.61 
 
 		 361 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00076534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0853  sporulation sigma factor SigG  30.24 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0182418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2250  sporulation sigma factor SigF  28.69 
 
 		 250 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1031  sporulation sigma factor SigG  28.98 
 
 		 259 aa  92.8  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000174079  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002516  RNA polymerase sigma factor RpoS  28.97 
 
 		 328 aa  92.8  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03517  hypothetical protein  28.97 
 
 		 328 aa  92.4  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1901  sporulation sigma factor SigG  29.8 
 
 		 259 aa  92.4  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2749  RpoD family RNA polymerase sigma factor  29.2 
 
 		 326 aa  92.4  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1085  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  30.32 
 
 		 320 aa  92  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0522379  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3342  RpoD family RNA polymerase sigma factor  28.15 
 
 		 322 aa  92  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101192  unclonable  0.0000000171583 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0836  sporulation sigma factor SigG  30.57 
 
 		 234 aa  92  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.904059  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2001  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  34.84 
 
 		 270 aa  91.3  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.605415  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3432  RNA polymerase sigma-38 factor  29.2 
 
 		 326 aa  91.3  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1425  sporulation sigma factor SigG  30.42 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00153435  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2014  sporulation sigma factor SigG  29.44 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1732  sporulation sigma factor SigG  29.44 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0249664  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0687  sporulation sigma factor SigG  30.57 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1213  RpoD family RNA polymerase sigma factor  28.52 
 
 		 324 aa  91.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07020  sporulation sigma factor SigF  31.28 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2552  sporulation sigma factor SigG  29.46 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000004552  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1204  RNA polymerase sigma factor RpoS  29.02 
 
 		 327 aa  90.5  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000153411  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1123  RNA polymerase, sigma 28 subunit  29.2 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1194  RNA polymerase, sigma 28 subunit  29.2 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1124  RNA polymerase, sigma 38 subunit, RpoS  29.2 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2739  RpoD family RNA polymerase sigma factor  31.71 
 
 		 323 aa  90.5  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1552  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  30.13 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178805  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0677  RNA polymerase sigma-38 factor RpoS  28.26 
 
 		 322 aa  90.9  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.632708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3730  sporulation sigma factor SigG  29.88 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>