More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_4361 on replicon NC_011773
Organism: Bacillus cereus AH820



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_4361  RNA polymerase sigma-K factor  100 
 
 
100 aa  191  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4421  sporulation sigma factor SigK  100 
 
 
265 aa  190  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0778  sporulation sigma factor SigK  100 
 
 
237 aa  190  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.377161  hitchhiker  0.0088749 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4236  sporulation sigma factor SigK  100 
 
 
237 aa  190  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4074  sporulation sigma factor SigK  100 
 
 
237 aa  190  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4084  sporulation sigma factor SigK  100 
 
 
237 aa  190  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4190  sporulation sigma factor SigK  100 
 
 
237 aa  190  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4566  sporulation sigma factor SigK  100 
 
 
237 aa  190  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4459  sporulation sigma factor SigK  100 
 
 
237 aa  190  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4472  sporulation sigma factor SigK  100 
 
 
237 aa  190  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3065  sporulation sigma factor SigK  98.99 
 
 
237 aa  187  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  79.17 
 
 
236 aa  154  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0982  sporulation sigma factor SigK  77.08 
 
 
245 aa  152  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  55.29 
 
 
239 aa  99.8  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0912  sigma-70 region 4 domain-containing protein  58.43 
 
 
118 aa  97.8  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2798  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  56.18 
 
 
234 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0517  sporulation sigma factor SigK  55.68 
 
 
244 aa  90.1  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2021  sporulation sigma factor SigK  57.78 
 
 
233 aa  88.2  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.653409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1738  sporulation sigma factor SigK  57.78 
 
 
233 aa  87.8  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.475543  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1737  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  54.76 
 
 
113 aa  87.4  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0277937 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0982  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  53.41 
 
 
256 aa  83.6  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2290  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  50 
 
 
207 aa  82  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.345877  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1501  sporulation sigma factor SigK  49.44 
 
 
231 aa  82  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1582  sporulation sigma factor SigK  52.5 
 
 
226 aa  80.9  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000492275  normal  0.195753 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3546  sporulation sigma factor SigK  50 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0787  sporulation sigma factor SigE  41.11 
 
 
244 aa  72  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.761292  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1290  sporulation sigma factor SigE  40.91 
 
 
249 aa  71.6  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1012  sporulation sigma factor SigK  51.69 
 
 
236 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05860  sporulation sigma factor SigK  44.94 
 
 
232 aa  70.9  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0736  sporulation sigma factor SigK  43.82 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000259555  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2001  sporulation sigma factor SigE  44.44 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000755771  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09150  sporulation sigma factor SigE  39.56 
 
 
245 aa  65.1  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000261644  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0835  sporulation sigma factor SigE  41.3 
 
 
240 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.935984  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2015  sporulation sigma factor SigE  42.86 
 
 
235 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.785691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1733  sporulation sigma factor SigE  42.86 
 
 
235 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3949  sporulation sigma factor SigE  36.36 
 
 
239 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000781708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4005  sporulation sigma factor SigE  36.36 
 
 
239 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3755  sporulation sigma factor SigE  36.36 
 
 
239 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00369355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3646  sporulation sigma factor SigE  36.36 
 
 
239 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000510031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3663  sporulation sigma factor SigE  36.36 
 
 
239 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000395259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3731  sporulation sigma factor SigE  36.36 
 
 
239 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278458  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3957  sporulation sigma factor SigE  36.36 
 
 
239 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000112899  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4043  sporulation sigma factor SigE  36.36 
 
 
239 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3918  sporulation sigma factor SigE  36.36 
 
 
239 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000071882 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1236  sporulation sigma factor SigE  36.36 
 
 
239 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000024975  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4054  sporulation sigma factor SigE  39.13 
 
 
249 aa  63.5  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2062  sporulation sigma factor SigE  45.74 
 
 
243 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000360983  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  40.48 
 
 
239 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1553  sporulation sigma factor SigE  40.66 
 
 
242 aa  62  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000347236  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2553  sporulation sigma factor SigE  36.36 
 
 
239 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000344705  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1426  sporulation sigma factor SigE  36.67 
 
 
241 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1900  sporulation sigma factor SigE  37.5 
 
 
239 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1030  sporulation sigma factor SigE  37.5 
 
 
239 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000129886  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1066  sporulation sigma factor SigE  38.04 
 
 
241 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000178993  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2655  sporulation sigma factor SigK  37.5 
 
 
232 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2469  sporulation sigma factor SigE  37.23 
 
 
246 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130703  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0686  sporulation sigma factor SigE  38.04 
 
 
241 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0852  sporulation sigma factor SigE  36.96 
 
 
243 aa  57.4  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0114797  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0447  sporulation sigma factor SigE  43.16 
 
 
244 aa  56.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000743913  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1680  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  42.39 
 
 
232 aa  52  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2001  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  37.89 
 
 
270 aa  52.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.605415  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4595  RpoD family RNA polymerase sigma factor  36.36 
 
 
640 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09420  RNA polymerase sigma factor RpoD, C-terminal domain/RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  33.33 
 
 
394 aa  51.6  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0120  RNA polymerase, sigma 28 subunit  46.25 
 
 
246 aa  50.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0478  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  42.53 
 
 
238 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2066  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  36.47 
 
 
259 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000506599  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1626  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  35.62 
 
 
688 aa  49.7  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1427  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  34.21 
 
 
504 aa  48.9  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.744088 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2284  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  51.92 
 
 
249 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1203  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  39.24 
 
 
281 aa  48.9  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512753  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1611  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  33.77 
 
 
433 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000262017 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1617  RNA polymerase, sigma 28 subunit  33.77 
 
 
441 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00878104  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1991  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  34.21 
 
 
549 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.918536  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1531  RNA polymerase sigma factor  33.77 
 
 
502 aa  48.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.138503  decreased coverage  0.00383208 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13280  RNA polymerase sigma factor RpoD, C-terminal domain/RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  34.21 
 
 
497 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00389203  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0905  RNA polymerase sigma factor  34.48 
 
 
571 aa  47.8  0.00005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1761  RNA polymerase sigma factor  34.21 
 
 
559 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1861  RNA polymerase sigma factor RpoS  33.73 
 
 
352 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0331  RNA polymerase sigma factor  33.73 
 
 
352 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2398  RpoD subfamily RNA polymerase sigma-70  34.21 
 
 
555 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.107802  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14350  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  33.77 
 
 
433 aa  47.4  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0336848  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1607  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  32.47 
 
 
559 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.512877  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7088  DNA-directed RNA polymerase sigma subunit (sigma70/sigma32)-like protein  33.82 
 
 
561 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0640657  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2963  RNA polymerase sigma factor  32.47 
 
 
495 aa  47.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.743322  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0863  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  39.51 
 
 
245 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15880  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  34.18 
 
 
516 aa  47.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.876653  normal  0.155423 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1806  sigma 70 (RpoD)  36.76 
 
 
594 aa  47  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000803488  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2138  RNA polymerase sigma factor SigB  34.52 
 
 
256 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2000  sporulation sigma factor SigG  53.33 
 
 
256 aa  46.2  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000480045  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2101  RNA polymerase sigma factor SigB  34.52 
 
 
256 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0557419  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2305  sporulation sigma factor SigF  40.96 
 
 
251 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2020  sporulation sigma factor SigF  40.96 
 
 
251 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1113  RNA polymerase sigma factor RpoD  37.29 
 
 
373 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000049377  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1642  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  38.75 
 
 
343 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000192835  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09100  RNA polymerase sigma factor RpoD, C-terminal domain/RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  35.29 
 
 
422 aa  45.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.321739  normal  0.63498 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1311  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  35.29 
 
 
409 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.046516 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0713  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  39.68 
 
 
417 aa  45.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1224  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  34.41 
 
 
257 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0121865  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14741  type II alternative sigma-70 family RNA polymerase sigma factor  32.89 
 
 
313 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14881  type II alternative sigma-70 family RNA polymerase sigma factor  32.89 
 
 
313 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>