266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_4043 on replicon NC_013924
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013924  Nmag_4043  Allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 
300 aa  611  9.999999999999999e-175  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.797104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0008  allophanate hydrolase subunit 1  52.76 
 
 
303 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0127  allophanate hydrolase subunit 1  50.34 
 
 
294 aa  316  3e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.821991  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2159  allophanate hydrolase, subunit 1  52.1 
 
 
291 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1883  allophanate hydrolase, subunit 1  52.1 
 
 
291 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1720  allophanate hydrolase, subunit 1  52.1 
 
 
291 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0896  allophanate hydrolase, subunit 1  52.1 
 
 
291 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1182  allophanate hydrolase, subunit 1  52.1 
 
 
291 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0363  allophanate hydrolase, subunit 1  52.1 
 
 
291 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0271  allophanate hydrolase, subunit 1  52.1 
 
 
291 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4580  allophanate hydrolase subunit 1  50.52 
 
 
311 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.632087  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3256  allophanate hydrolase subunit 1  51.23 
 
 
291 aa  309  4e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.350388  normal  0.431322 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0366  allophanate hydrolase subunit 1  54.04 
 
 
291 aa  305  6e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111698  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6283  allophanate hydrolase subunit 1  53.85 
 
 
291 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115287  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2954  allophanate hydrolase subunit 1  53.85 
 
 
291 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.975999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2921  allophanate hydrolase subunit 1  48.99 
 
 
313 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2771  allophanate hydrolase subunit 1  50.18 
 
 
295 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2861  allophanate hydrolase subunit 1  49.82 
 
 
295 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107171  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5869  Allophanate hydrolase subunit 1  48.04 
 
 
291 aa  289  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06460  hypothetical protein  47.37 
 
 
292 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000360881  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2721  hypothetical protein  48.28 
 
 
290 aa  288  7e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.919225  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2935  hypothetical protein  48.28 
 
 
290 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0598  hypothetical protein  46.67 
 
 
292 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2438  allophanate hydrolase subunit 1  47.33 
 
 
289 aa  285  7e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2119  allophanate hydrolase subunit 1  49.12 
 
 
295 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00766127  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2382  Allophanate hydrolase subunit 1  45.61 
 
 
293 aa  271  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2478  Allophanate hydrolase subunit 1  44.29 
 
 
294 aa  268  8e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1574  Urea carboxylase  29.24 
 
 
321 aa  119  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96958  normal  0.273828 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  29.24 
 
 
1208 aa  103  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  28.33 
 
 
1822 aa  101  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  30.25 
 
 
1205 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  27.6 
 
 
1180 aa  99.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  26.64 
 
 
1204 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  30.88 
 
 
1234 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  28.07 
 
 
242 aa  94  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  27.7 
 
 
1209 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  28 
 
 
1206 aa  93.6  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  29.84 
 
 
242 aa  93.2  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  25.58 
 
 
246 aa  93.2  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  26.77 
 
 
243 aa  92  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  28.34 
 
 
229 aa  91.3  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  29.3 
 
 
1233 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  25.89 
 
 
1208 aa  90.9  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  30 
 
 
1172 aa  91.3  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  27.14 
 
 
1212 aa  89.4  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  27.46 
 
 
221 aa  89.4  7e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  27.92 
 
 
1205 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  27.92 
 
 
1205 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  27.92 
 
 
1205 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  29.04 
 
 
1162 aa  89  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  29.07 
 
 
1203 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  27.41 
 
 
677 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  27.84 
 
 
1179 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  31.36 
 
 
1212 aa  88.6  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  27.84 
 
 
1179 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  29.33 
 
 
1182 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  29.07 
 
 
1205 aa  86.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1172  hypothetical protein  23.35 
 
 
243 aa  86.3  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  26.64 
 
 
1183 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  26.74 
 
 
1243 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  24.39 
 
 
1183 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  26.64 
 
 
1205 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  27.18 
 
 
1204 aa  84.3  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  26.64 
 
 
1205 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  27.34 
 
 
1205 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  26.71 
 
 
1176 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1900  hypothetical protein  24.32 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  25.45 
 
 
1228 aa  82.8  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  24.72 
 
 
1200 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  25.69 
 
 
1197 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2040  hypothetical protein  26.38 
 
 
243 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.733064  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1527  hypothetical protein  26.09 
 
 
246 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  26.78 
 
 
1204 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  26.35 
 
 
1176 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1594  urea amidolyase related protein  30.84 
 
 
663 aa  80.5  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  26.64 
 
 
1209 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  25.82 
 
 
1201 aa  80.1  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  25.09 
 
 
1203 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  25.53 
 
 
1197 aa  80.1  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1713  hypothetical protein  25.65 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.115565  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2636  hypothetical protein  26.21 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.24477  decreased coverage  0.0000373796 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  22.78 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  26.64 
 
 
1179 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  25.09 
 
 
1201 aa  79.3  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2832  hypothetical protein  25.4 
 
 
242 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180643  normal  0.812146 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  25.27 
 
 
1207 aa  78.2  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  25.85 
 
 
1203 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2958  Allophanate hydrolase subunit 1  24.29 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  26.16 
 
 
215 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  26.72 
 
 
1204 aa  76.6  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2803  allophanate hydrolase subunit 1  27.51 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.733507 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  23.9 
 
 
1231 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  24.04 
 
 
1241 aa  75.1  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1666  hypothetical protein  24.14 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.947071  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3557  Allophanate hydrolase subunit 1  29.46 
 
 
205 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15839  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3728  urea carboxylase  26.69 
 
 
1220 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0435399  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1700  hypothetical protein  24.14 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  28.1 
 
 
518 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  26.69 
 
 
1209 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  27.11 
 
 
1238 aa  73.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>