More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2540 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2540  ABC transporter-like protein  100 
 
 		 229 aa  437  9.999999999999999e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1176  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.87 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128405  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7510  branched-chain amino acid transport ATP-binding protein LivF  51.1 
 
 		 246 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4451  ABC transporter related  49.36 
 
 		 238 aa  198  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0769316  normal  0.0804857 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  44.21 
 
 		 235 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  42.13 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  44.21 
 
 		 245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  44.3 
 
 		 240 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  42.55 
 
 		 238 aa  179  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  44.3 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  40.95 
 
 		 233 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  44.35 
 
 		 240 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  41.2 
 
 		 256 aa  178  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1215  ABC transporter related  43.78 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  42.8 
 
 		 242 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  40.08 
 
 		 238 aa  175  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  39.48 
 
 		 234 aa  174  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  40.52 
 
 		 233 aa  174  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  43.35 
 
 		 234 aa  174  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  46.61 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  41.63 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3977  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.8 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.099286  decreased coverage  0.00201124 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  42.67 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1679  ABC transporter-like protein  46.35 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.0768267 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4793  ABC transporter related  42.67 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.262545  normal  0.126622 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  43.35 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4819  ABC transporter related  44.3 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0621647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  41.28 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  40.43 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0145  ABC transporter related  42.13 
 
 		 243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  39.24 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5343  ABC transporter related  44.02 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  42.56 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  47.86 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  38.89 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4015  ABC transporter related  45.78 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  39.48 
 
 		 234 aa  172  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1426  ABC transporter related  40.85 
 
 		 249 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  41.7 
 
 		 235 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  39.15 
 
 		 235 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  40.77 
 
 		 238 aa  171  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  40.34 
 
 		 235 aa  171  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23010  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  45.34 
 
 		 255 aa  171  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.0665453 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0429  ABC transporter related protein  46.58 
 
 		 236 aa  171  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0665376  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  41.13 
 
 		 235 aa  171  7.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3770  ABC transporter related  40.93 
 
 		 245 aa  171  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.463504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  43.53 
 
 		 234 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  41.74 
 
 		 247 aa  171  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  39.06 
 
 		 238 aa  170  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  39.91 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  40.34 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3396  ABC transporter related  39.47 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  39.15 
 
 		 239 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3657  ABC transporter related  41.95 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.222709  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0683  ABC transporter related protein  43.16 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000101053  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  41.28 
 
 		 259 aa  169  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  40.52 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  41.2 
 
 		 239 aa  168  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.34 
 
 		 238 aa  168  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  39.91 
 
 		 238 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  39.48 
 
 		 238 aa  169  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3479  ABC transporter related  43.81 
 
 		 238 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8311  ABC transporter related  46.19 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.659744  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  45.53 
 
 		 238 aa  168  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  45.53 
 
 		 238 aa  168  7e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  44.64 
 
 		 234 aa  168  7e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  38.2 
 
 		 236 aa  168  7e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  40.93 
 
 		 240 aa  168  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  41.88 
 
 		 234 aa  168  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  38.03 
 
 		 236 aa  168  8e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1099  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.16 
 
 		 242 aa  167  9e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338839  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2245  ABC transporter ATP-binding protein  45.74 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.310243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  40.34 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2450  ABC transporter related  44.39 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.35 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  39.91 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3369  ABC transporter related  40.93 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  39.91 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.06 
 
 		 244 aa  166  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1197  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 242 aa  166  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2057  ABC transporter related  44.39 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0912  ABC transporter related  40.33 
 
 		 244 aa  166  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.91 
 
 		 238 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4484  ABC transporter related  48.15 
 
 		 241 aa  166  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  38.63 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  39.06 
 
 		 238 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1654  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 243 aa  166  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.10025  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  43.4 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  40.45 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2503  ABC transporter related protein  41.1 
 
 		 235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6415  ABC transporter related  40.77 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  41.2 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  39.06 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0063  ABC transporter related  42.62 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.270537 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.41 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  39.06 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  41.98 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.34 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  38.3 
 
 		 236 aa  166  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  43.16 
 
 		 237 aa  166  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>