More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1176 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA1176  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 234 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128405  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2540  ABC transporter-like protein  50.87 
 
 		 229 aa  227  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7510  branched-chain amino acid transport ATP-binding protein LivF  48.67 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  40.76 
 
 		 237 aa  179  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2264  ABC transporter related  44.02 
 
 		 234 aa  178  7e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0714908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  39.48 
 
 		 234 aa  177  9e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  38.03 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  38.98 
 
 		 242 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  39.57 
 
 		 235 aa  176  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  40.68 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0889  ABC transporter related  41.38 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  39.66 
 
 		 249 aa  175  5e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  40.93 
 
 		 240 aa  175  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 		 238 aa  175  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  42.74 
 
 		 823 aa  174  8e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  40.51 
 
 		 240 aa  174  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.61 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.61 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.61 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.61 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.61 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  39.83 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  39.41 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.61 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.61 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  41.2 
 
 		 235 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.22 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  41.67 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0264  ABC transport system ATP-binding protein  39.06 
 
 		 243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.575651  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1842  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.06 
 
 		 365 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  42.31 
 
 		 823 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  41.18 
 
 		 237 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2669  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.06 
 
 		 243 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4484  ABC transporter related  42.49 
 
 		 241 aa  171  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0052  ABC transporter, ATP-binding protein  39.06 
 
 		 243 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0051  ABC transporter, ATP-binding protein  39.06 
 
 		 243 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  40.79 
 
 		 236 aa  170  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  38.89 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  37.18 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  38.2 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0045  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.63 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  41.38 
 
 		 242 aa  171  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2710  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.06 
 
 		 365 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  38.89 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3285  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.06 
 
 		 365 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  37.18 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  37.18 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1679  ABC transporter-like protein  39.74 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.0768267 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  38.63 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  38.98 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  37.77 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  40.77 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  36.75 
 
 		 238 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  36.75 
 
 		 238 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  36.75 
 
 		 238 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3498  ABC transporter related  41.52 
 
 		 236 aa  169  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  39.24 
 
 		 240 aa  168  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  39.57 
 
 		 830 aa  168  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  36.75 
 
 		 238 aa  168  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  41.48 
 
 		 235 aa  167  9e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  37.55 
 
 		 237 aa  167  9e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4793  ABC transporter related  41.38 
 
 		 233 aa  167  9e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.262545  normal  0.126622 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  39.5 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  38.36 
 
 		 437 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  36.32 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0701  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.43 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  36.29 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  38.79 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4565  ABC transporter related  43.89 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.683769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  38.36 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  37.87 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  39.06 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  37.87 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.06 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  39.41 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  39.19 
 
 		 234 aa  166  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  38.56 
 
 		 265 aa  165  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  38.46 
 
 		 235 aa  165  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  40.95 
 
 		 234 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  41.6 
 
 		 237 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  37.6 
 
 		 239 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4451  ABC transporter related  39.74 
 
 		 238 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0769316  normal  0.0804857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0597  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.76 
 
 		 252 aa  164  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0909896  normal  0.0238528 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  36.44 
 
 		 236 aa  164  9e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  36.02 
 
 		 236 aa  164  9e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  40.62 
 
 		 238 aa  164  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  37.77 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  38.56 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  39.32 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  37.82 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  39.32 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0288  ABC transporter related  37.61 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  39.06 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0043  ABC transporter related  38.33 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0429  ABC transporter related protein  40.51 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0665376  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  40.34 
 
 		 827 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  37.55 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  40.64 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1425  ABC transporter related protein  39.66 
 
 		 239 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0964175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>