More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0052 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_2710  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 365 aa  473  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2669  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  100 
 
 		 243 aa  474  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3285  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 365 aa  473  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0052  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 243 aa  474  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0051  ABC transporter, ATP-binding protein  99.59 
 
 		 243 aa  474  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0264  ABC transport system ATP-binding protein  99.59 
 
 		 243 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.575651  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1842  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  99.59 
 
 		 365 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0045  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  93 
 
 		 243 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4451  ABC transporter related  52.56 
 
 		 238 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0769316  normal  0.0804857 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7593  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.43 
 
 		 240 aa  174  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  41.2 
 
 		 242 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3835  ABC transporter related  41.92 
 
 		 237 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1176  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.06 
 
 		 234 aa  171  6.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128405  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7510  branched-chain amino acid transport ATP-binding protein LivF  43.35 
 
 		 246 aa  171  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  38.67 
 
 		 233 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  41.99 
 
 		 233 aa  169  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  40.34 
 
 		 237 aa  168  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0608  ATPase  40.27 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  37.5 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.67 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4484  ABC transporter related  42.56 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  41.84 
 
 		 238 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6492  ABC transporter related  39.83 
 
 		 244 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0130202  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  41.74 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  39.67 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  39.48 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2144  ABC transporter related  41.41 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  40.51 
 
 		 240 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  40.93 
 
 		 240 aa  163  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  42.49 
 
 		 830 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  42.99 
 
 		 823 aa  162  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4379  ABC transporter related protein  43.4 
 
 		 240 aa  163  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3332  ABC transporter related  41.67 
 
 		 235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.803262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  38.81 
 
 		 233 aa  161  8.000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  39.73 
 
 		 233 aa  161  9e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  42.53 
 
 		 823 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0672  ABC transporter related  39.17 
 
 		 239 aa  160  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1863  ABC transporter related  41.33 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1244  ABC transporter-like  37.78 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0565  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  38.01 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000171759  normal  0.616971 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1425  ABC transporter related protein  41.59 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0964175  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1679  ABC transporter-like protein  39.32 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.0768267 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2540  ABC transporter-like protein  39.48 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  39.32 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2264  ABC transporter related  41.85 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0714908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  38.36 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  38.36 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  38.36 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1685  ABC transporter related  36.1 
 
 		 239 aa  159  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  38.36 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  37.23 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3555  ABC transporter related  45.45 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.651056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  38.36 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  41.18 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  38.36 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  41.18 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  38.96 
 
 		 828 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5638  ABC transporter related  42.98 
 
 		 239 aa  158  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2169  ABC transporter related  44.59 
 
 		 235 aa  158  7e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  38.63 
 
 		 233 aa  158  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2393  ABC transporter related  38.77 
 
 		 234 aa  158  9e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  38.77 
 
 		 235 aa  158  9e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2756  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.53 
 
 		 234 aa  158  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211076  normal  0.384438 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  42.92 
 
 		 827 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1383  ABC transporter related  38.94 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.334561  normal  0.312332 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  36.48 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  38.53 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1566  ABC transporter related  41.41 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2611  ABC transporter related  38.46 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  37.9 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6584  ABC transporter related  38.17 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  37.89 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3838  ABC transporter related  41.2 
 
 		 276 aa  156  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.173965  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3339  ABC transporter related  36.44 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6017  ABC transporter related  39.24 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.896257  hitchhiker  0.00867061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4307  branched-chain amino acid transport protein BraG  40 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  39.67 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5991  branched chain amino acid ABC tranpsorter ATP-binding protein  40.77 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  37.78 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3456  ABC transporter related  45.27 
 
 		 1302 aa  156  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.66499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  36.53 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1002  ABC transporter related  42.6 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  39.65 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50560  branched-chain amino acid transport protein BraG  40 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0125838 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  36.12 
 
 		 235 aa  155  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0382  ABC transporter related  44.54 
 
 		 538 aa  155  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  38.33 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  37.5 
 
 		 247 aa  155  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  36.99 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3326  ABC transporter related  35.84 
 
 		 244 aa  155  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2286  ABC transporter related  40.95 
 
 		 265 aa  154  8e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  39.66 
 
 		 238 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  37.07 
 
 		 236 aa  154  9e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  37.66 
 
 		 240 aa  154  9e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3191  ABC transporter related  40.34 
 
 		 748 aa  154  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5326  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.72 
 
 		 243 aa  154  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1137  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.33 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115394 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  36.32 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.78 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  37.66 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>