More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4451 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4451  ABC transporter related  100 
 
 		 238 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0769316  normal  0.0804857 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1842  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.97 
 
 		 365 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0264  ABC transport system ATP-binding protein  52.56 
 
 		 243 aa  228  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.575651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0052  ABC transporter, ATP-binding protein  52.56 
 
 		 243 aa  228  8e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2669  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.56 
 
 		 243 aa  228  8e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3285  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.54 
 
 		 365 aa  228  9e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2710  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.54 
 
 		 365 aa  228  9e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0051  ABC transporter, ATP-binding protein  52.14 
 
 		 243 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0045  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.22 
 
 		 243 aa  227  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2540  ABC transporter-like protein  49.36 
 
 		 229 aa  198  6e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  42.37 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1685  ABC transporter related  43.16 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0477  ABC transporter related  44.3 
 
 		 238 aa  178  8e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.92 
 
 		 244 aa  174  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1679  ABC transporter-like protein  42.17 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.0768267 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  45.13 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  41.53 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  41.1 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  43.22 
 
 		 238 aa  172  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  41.53 
 
 		 240 aa  172  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0912  ABC transporter related  41.67 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  43.64 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  41.74 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  40.81 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5343  ABC transporter related  41.28 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4710  ABC transporter related protein  41.45 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4009  ABC transporter related  41.53 
 
 		 257 aa  168  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.153602  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  40.91 
 
 		 244 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7510  branched-chain amino acid transport ATP-binding protein LivF  41.1 
 
 		 246 aa  168  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0429  ABC transporter related protein  44.93 
 
 		 236 aa  168  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0665376  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  43.83 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0672  ABC transporter related  41.45 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  43.64 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  41.53 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  35.93 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  43.28 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  43.28 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  42.08 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1176  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.74 
 
 		 234 aa  165  6.9999999999999995e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  36.36 
 
 		 233 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  39.06 
 
 		 249 aa  164  9e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4099  ABC transporter related  38.03 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  41.81 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3649  ABC transporter related  40.81 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.5266  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  42.42 
 
 		 828 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  39.66 
 
 		 238 aa  162  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  42.24 
 
 		 234 aa  163  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  38.79 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0731  ABC transporter related  40.95 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  37.34 
 
 		 237 aa  162  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  38.64 
 
 		 260 aa  162  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  41.38 
 
 		 234 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  43.91 
 
 		 830 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2137  ABC transporter related protein  42.08 
 
 		 251 aa  161  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0427504 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2286  ABC transporter related  41.01 
 
 		 265 aa  160  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  39.13 
 
 		 239 aa  160  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  36.64 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5638  ABC transporter related  42.92 
 
 		 239 aa  160  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  40.52 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  36.64 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2365  ABC transporter related  40 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5119  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  39.48 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0043  ABC transporter related  43.53 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1325  ABC transporter-like protein  38.98 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0593111 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2585  ABC transporter related  38.2 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  39.22 
 
 		 242 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  39.66 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  35.59 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  38.4 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6584  ABC transporter related  41.88 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633643  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  40.91 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0145  ABC transporter related  39.91 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  41.1 
 
 		 240 aa  159  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0909  ABC transporter related  39.57 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  39.57 
 
 		 270 aa  159  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  35.78 
 
 		 236 aa  158  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2953  ABC transporter related  39.22 
 
 		 249 aa  158  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.181983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  37.5 
 
 		 236 aa  158  6e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  40.09 
 
 		 238 aa  158  7e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  38.53 
 
 		 234 aa  158  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  38.16 
 
 		 237 aa  158  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  37.18 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  39.74 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6017  ABC transporter related  42.31 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.896257  hitchhiker  0.00867061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  37.78 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  37.18 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0889  ABC transporter related  40.69 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.18 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  39.92 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.45 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  37.07 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  37.18 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  38.4 
 
 		 247 aa  156  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3664  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  35.78 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  37.5 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3970  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  35.78 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.394941  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  36.64 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0838  ABC transporter related  39.91 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0490  ABC transporter related  40.25 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0438645  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>