More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7510 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7510  branched-chain amino acid transport ATP-binding protein LivF  100 
 
 		 246 aa  484  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1176  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.67 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128405  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2540  ABC transporter-like protein  51.1 
 
 		 229 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  43.81 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  42.92 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5561  ABC transporter related  42.86 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0264  ABC transport system ATP-binding protein  43.33 
 
 		 243 aa  175  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.575651  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1842  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 		 365 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2710  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 		 365 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2669  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.33 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  41.39 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0052  ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0051  ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3285  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 		 365 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  42.11 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  42.11 
 
 		 240 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  42.54 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  43.97 
 
 		 237 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  41.13 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  42.06 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  44.75 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  44.75 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0329  ABC transporter related  37.83 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287188  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  44.75 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4057  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.25 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0191  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.25 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.148253  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1993  ABC transporter related  45 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535094  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5330  ABC transporter related  43.57 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.240884  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  38.89 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  40.17 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4793  ABC transporter related  39.41 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.262545  normal  0.126622 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1890  ABC transporter related  41.53 
 
 		 239 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.865524  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5638  ABC transporter related  42.13 
 
 		 239 aa  168  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1002  ABC transporter related  41.28 
 
 		 238 aa  168  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 		 235 aa  168  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3321  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 		 252 aa  168  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  41.38 
 
 		 235 aa  168  8e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  40 
 
 		 258 aa  168  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0093  ABC transporter related  40.83 
 
 		 252 aa  168  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.899173  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2943  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4631  ABC transporter related  43.88 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1600  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.83 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671798  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3002  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.83 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4451  ABC transporter related  41.1 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0769316  normal  0.0804857 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3368  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.83 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  40.17 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3906  ABC transporter related  40.08 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  40.09 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4656  ABC transporter related  41 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114918 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.5 
 
 		 251 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.760616  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0695  ABC transporter related  39.68 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.321828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0027  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.5 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4524  ABC transporter related  41 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180068  normal  0.792034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2365  ABC transporter related  40.85 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  39.08 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  40.17 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0083  ABC transporter related  40.42 
 
 		 252 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  40.43 
 
 		 234 aa  165  5e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3983  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 251 aa  165  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1685  ABC transporter related  39.44 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  40.66 
 
 		 823 aa  165  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0092  ABC transporter related  40.83 
 
 		 251 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.65269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  40.43 
 
 		 235 aa  165  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  41.08 
 
 		 823 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1819  ABC transporter related protein  40.93 
 
 		 234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.527395  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  40.41 
 
 		 827 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0529  ABC transporter related  40.87 
 
 		 240 aa  165  5.9999999999999996e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000281948  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0045  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.67 
 
 		 243 aa  165  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0109  ABC transporter related  40.42 
 
 		 251 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5703  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 		 238 aa  164  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0288  ABC transporter related  39.75 
 
 		 241 aa  165  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  41.28 
 
 		 251 aa  165  8e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  38.4 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1654  ABC transporter related protein  40.68 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.10025  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  39.5 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0683  ABC transporter related protein  39.92 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000101053  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2963  ABC transporter related  40.42 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  41.18 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.03 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  39.04 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0092  ABC transporter related  40.42 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3369  ABC transporter related  39.74 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581265  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4863  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.73 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000477464  hitchhiker  0.0000052401 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2037  ABC transporter ATP-binding protein  40.95 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2057  ABC transporter related  41.59 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  36.91 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0909  ABC transporter related  42.19 
 
 		 248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2940  ABC transporter related  40.08 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0524506  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3361  ABC transporter related  40.17 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280372  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  40 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  39.74 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4741  ABC transporter related  39.73 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000344378  hitchhiker  0.000000131699 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  39.92 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3573  ABC transporter related  41.2 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.402201 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.24 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  41.52 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0778  ABC transporter related  42.62 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8311  ABC transporter related  42.66 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.659744  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2450  ABC transporter related  41.59 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2245  ABC transporter ATP-binding protein  41.59 
 
 		 233 aa  163  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.310243  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>