More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4015 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4015  ABC transporter related  100 
 
 		 235 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8311  ABC transporter related  66.36 
 
 		 236 aa  293  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.659744  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3487  ABC transporter related protein  55.65 
 
 		 247 aa  256  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3869  ABC transporter related  54.78 
 
 		 235 aa  251  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166635  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  46.22 
 
 		 238 aa  214  8e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  48.88 
 
 		 242 aa  211  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  50 
 
 		 240 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  50 
 
 		 240 aa  210  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  50 
 
 		 240 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.29 
 
 		 244 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  50.44 
 
 		 238 aa  208  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  50.44 
 
 		 238 aa  208  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  47.06 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0912  ABC transporter related  45.41 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  43.98 
 
 		 242 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  46.22 
 
 		 240 aa  202  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  46.49 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  46.15 
 
 		 234 aa  201  7e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  42.74 
 
 		 234 aa  201  7e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  45.73 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  48.43 
 
 		 243 aa  201  8e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  44.54 
 
 		 237 aa  201  9e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  50.23 
 
 		 234 aa  201  9e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  47.53 
 
 		 235 aa  200  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  44.1 
 
 		 247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  46.61 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  48.43 
 
 		 240 aa  199  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.92 
 
 		 238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  47.35 
 
 		 240 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.92 
 
 		 238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  43.81 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.92 
 
 		 238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.92 
 
 		 238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.92 
 
 		 238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.92 
 
 		 238 aa  198  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  42.04 
 
 		 238 aa  198  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  42.48 
 
 		 238 aa  199  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  43.36 
 
 		 238 aa  198  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  43.36 
 
 		 238 aa  198  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.48 
 
 		 238 aa  198  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  42.04 
 
 		 238 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0988  ABC transporter-related protein  47.26 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.24 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  46.84 
 
 		 694 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  43.36 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  42.92 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  42.92 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4863  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.73 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000477464  hitchhiker  0.0000052401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4741  ABC transporter related  44.73 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000344378  hitchhiker  0.000000131699 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  46.15 
 
 		 234 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  42.92 
 
 		 238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  42.92 
 
 		 238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0627  ABC transporter related  47.37 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  44.44 
 
 		 235 aa  195  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0405  ABC transporter related  48.94 
 
 		 270 aa  195  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0556  ABC transporter-like  44.73 
 
 		 238 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000214193  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  44.73 
 
 		 238 aa  195  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  43.75 
 
 		 258 aa  194  7e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2953  ABC transporter related  46.33 
 
 		 249 aa  194  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.181983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  42.48 
 
 		 239 aa  194  9e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2365  ABC transporter related  48.65 
 
 		 235 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4655  ABC transporter related  45.37 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000808014  hitchhiker  0.00473023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5991  branched chain amino acid ABC tranpsorter ATP-binding protein  48.65 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3838  ABC transporter related  47.06 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.173965  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1444  ABC transporter related  45.5 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  43.04 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1158  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  46.02 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  46.4 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4919  ABC transporter related  44.3 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000800081  decreased coverage  0.0000000000000903598 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1033  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  44.92 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  43.69 
 
 		 247 aa  192  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  43.86 
 
 		 238 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  46.4 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0403  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.95 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0028  ABC transporter related  47.66 
 
 		 272 aa  192  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  44.2 
 
 		 251 aa  192  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2264  ABC transporter related  47.73 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0714908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0545  ABC transporter related  46.36 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.699298  hitchhiker  0.000807716 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0774  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 		 232 aa  192  5e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.937029  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1776  ABC transporter related  44.98 
 
 		 244 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5326  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.74 
 
 		 243 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3396  ABC transporter related  45.45 
 
 		 229 aa  192  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  47.49 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0796  ABC transporter related  45.29 
 
 		 236 aa  191  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  43.81 
 
 		 238 aa  192  6e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  47.39 
 
 		 238 aa  191  6e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1654  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 243 aa  191  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.10025  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  46.05 
 
 		 235 aa  191  7e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1426  ABC transporter related  42.92 
 
 		 249 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  45.37 
 
 		 233 aa  191  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 247 aa  190  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  47.06 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0479  ABC transporter related protein  43.64 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000373417  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0778  ABC transporter related  46.88 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  45.54 
 
 		 242 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  45.33 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>