122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4667 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1309  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  88.41 
 
 
397 aa  685    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1150  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  88.92 
 
 
397 aa  704    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.428628 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4667  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  100 
 
 
396 aa  786    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4852  acyl-CoA dehydrogenase-like  59.64 
 
 
395 aa  448  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.150232 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2174  putative acyl-CoA dehydrogenase  52.89 
 
 
382 aa  381  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0970  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.05 
 
 
379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2613  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  44.92 
 
 
373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.346291 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2211  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.8 
 
 
378 aa  266  7e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0038  putative acyl-CoA dehydrogenase  37.57 
 
 
360 aa  256  3e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5417  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  43.68 
 
 
373 aa  252  9.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2837  putative acyl-CoA dehydrogenase  42.62 
 
 
375 aa  249  6e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0305  putative acyl-CoA dehydrogenase  41.06 
 
 
376 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.1367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3484  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.84 
 
 
358 aa  226  7e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3792  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  43.24 
 
 
358 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.267616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3866  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  44.44 
 
 
362 aa  209  9e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0222771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1706  putative acyl-CoA dehydrogenase  36.77 
 
 
375 aa  186  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.087432  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4820  putative acyl-CoA dehydrogenase  37.3 
 
 
375 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0622  acyl-CoA dehydrogenase  34.65 
 
 
354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00205931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0160  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  28.48 
 
 
344 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0165  hypothetical protein  28.48 
 
 
344 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2627  hypothetical protein  28.94 
 
 
353 aa  130  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0414836  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0459  hypothetical protein  29.97 
 
 
367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2929  hypothetical protein  33.53 
 
 
355 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34490  hypothetical protein  33.33 
 
 
355 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000897326  normal  0.153318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2274  acyl-CoA dehydrogenase  29.1 
 
 
354 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.921595  normal  0.572718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2095  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  28.12 
 
 
354 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3638  acyl-CoA dehydrogenase, putative  28.45 
 
 
354 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0587866  normal  0.442088 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3928  acyl-CoA dehydrogenase, putative  29.34 
 
 
366 aa  93.6  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.438549  normal  0.0461862 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6334  putative acyl-CoA dehydrogenase  29.79 
 
 
371 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1538  putative acyl-CoA dehydrogenase  26.82 
 
 
367 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6511  hypothetical protein  28.99 
 
 
371 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6745  hypothetical protein  28.99 
 
 
371 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839762  normal  0.367272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1452  acyl-CoA dehydrogenase  27.78 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00428618  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0102  putative acyl-CoA dehydrogenase  27.94 
 
 
367 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988493  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0700  acyl-CoA dehydrogenase family protein  25.34 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.564675  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1359  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  25.55 
 
 
426 aa  62  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5825  putative acyl-CoA dehydrogenase  27.79 
 
 
365 aa  61.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.803301 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1645  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.75 
 
 
387 aa  56.2  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04688  Isovaleryl-coenzyme A dehydrogenase (EC 1.3.99.10) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T5L6]  23.84 
 
 
431 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480161  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38440  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  25.99 
 
 
387 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2846  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.01 
 
 
389 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2739  acyl-CoA dehydrogenase, putative  25.64 
 
 
447 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0833  putative acyl-CoA dehydrogenase  23.62 
 
 
385 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815342 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3274  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  25.11 
 
 
387 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2973  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.28 
 
 
389 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.698816  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1458  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.09 
 
 
389 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.499178 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3223  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.35 
 
 
389 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3779  isovaleryl-CoA dehydrogenase  29.41 
 
 
396 aa  51.2  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3057  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.41 
 
 
396 aa  51.2  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4085  putative acyl-CoA dehydrogenase  22.96 
 
 
387 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14575  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2828  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.73 
 
 
389 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0615  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.26 
 
 
387 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.210833  normal  0.0397055 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.73 
 
 
389 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.295941  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2470  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.21 
 
 
387 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0293728  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2245  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  23.3 
 
 
389 aa  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2322  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.18 
 
 
389 aa  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2727  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.6 
 
 
389 aa  49.7  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1719  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.2 
 
 
389 aa  50.1  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2394  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.18 
 
 
389 aa  49.7  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.869835 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1672  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.18 
 
 
389 aa  49.7  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1608  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.48 
 
 
388 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0385936  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1897  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.18 
 
 
389 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6366  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  21.96 
 
 
387 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4987  acyl-CoA dehydrogenase family protein-like  22.89 
 
 
367 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.432457  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2062  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.93 
 
 
395 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2780  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.16 
 
 
390 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0393743 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0960  isovaleryl-CoA dehydrogenase  29.41 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.433991  normal  0.388602 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1362  isovaleryl-CoA dehydrogenase  28.19 
 
 
389 aa  48.9  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.431847 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5991  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.85 
 
 
395 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000302563 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0966  acyl-CoA dehydrogenase  24.45 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3127  acyl-CoA dehydrogenase-like  27.52 
 
 
393 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105998  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5240  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.52 
 
 
393 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288959  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1074  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.45 
 
 
387 aa  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.490532  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.53 
 
 
382 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4686  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.41 
 
 
393 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162224  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0423  isovaleryl-CoA dehydrogenase  27.52 
 
 
414 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.733872  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5032  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.52 
 
 
393 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5121  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.52 
 
 
393 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.975401  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4588  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.52 
 
 
393 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3360  isovaleryl-CoA dehydrogenase  29.19 
 
 
410 aa  47  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0167  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.31 
 
 
376 aa  46.6  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3466  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.52 
 
 
393 aa  46.6  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360992  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1288  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.56 
 
 
379 aa  46.6  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.751821 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1498  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.77 
 
 
382 aa  46.6  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49560  Acyl-CoA dehydrogenase  30.71 
 
 
393 aa  46.2  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.531636  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4190  isovaleryl-CoA dehydrogenase  27.52 
 
 
393 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4371  isovaleryl-CoA dehydrogenase  27.52 
 
 
395 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3662  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.51 
 
 
387 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000131881 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3562  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.4 
 
 
393 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.364762 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  21.43 
 
 
379 aa  45.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0279  acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  27.33 
 
 
393 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.236676  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0901  putative acyl-CoA dehydrogenase  23.72 
 
 
386 aa  45.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1142  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.79 
 
 
386 aa  45.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.268805  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0241  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.05 
 
 
389 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0803  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.7 
 
 
378 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2121  isovaleryl-CoA dehydrogenase  21.45 
 
 
388 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.274166  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1126  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.72 
 
 
373 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3656  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.08 
 
 
387 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.179163  normal  0.0293073 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.8 
 
 
393 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1168  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  21.85 
 
 
385 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437637  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>