More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1452 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1452  acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 		 350 aa  680    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00428618  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2274  acyl-CoA dehydrogenase  31.53 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.921595  normal  0.572718 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0459  hypothetical protein  30.41 
 
 		 367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2627  hypothetical protein  29.48 
 
 		 353 aa  124  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0414836  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3638  acyl-CoA dehydrogenase, putative  31.73 
 
 		 354 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0587866  normal  0.442088 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2095  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  31.44 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1538  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.02 
 
 		 367 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2211  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.12 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0700  acyl-CoA dehydrogenase family protein  26.42 
 
 		 354 aa  116  5e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.564675  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2929  hypothetical protein  32.29 
 
 		 355 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0165  hypothetical protein  24.04 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0160  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  24.04 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34490  hypothetical protein  32.56 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000897326  normal  0.153318 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2174  putative acyl-CoA dehydrogenase  24.3 
 
 		 382 aa  106  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5825  putative acyl-CoA dehydrogenase  30.66 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.803301 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4852  acyl-CoA dehydrogenase-like  27.12 
 
 		 395 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.150232 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0970  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.43 
 
 		 379 aa  99.8  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0622  acyl-CoA dehydrogenase  22.99 
 
 		 354 aa  99.4  9e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00205931  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6511  hypothetical protein  29.64 
 
 		 371 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6745  hypothetical protein  29.64 
 
 		 371 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839762  normal  0.367272 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6334  putative acyl-CoA dehydrogenase  29.92 
 
 		 371 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2837  putative acyl-CoA dehydrogenase  28.38 
 
 		 375 aa  96.7  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0038  putative acyl-CoA dehydrogenase  23.19 
 
 		 360 aa  96.7  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1150  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  27.11 
 
 		 397 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.428628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3792  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  29.65 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5417  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  27.06 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3928  acyl-CoA dehydrogenase, putative  31.05 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.438549  normal  0.0461862 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3484  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.97 
 
 		 358 aa  94  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1309  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.7 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0305  putative acyl-CoA dehydrogenase  29.35 
 
 		 376 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.1367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4667  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  27.59 
 
 		 396 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0171462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1706  putative acyl-CoA dehydrogenase  28.32 
 
 		 375 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.087432  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0102  putative acyl-CoA dehydrogenase  30.42 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2613  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  26.25 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.346291 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4820  putative acyl-CoA dehydrogenase  27.48 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3866  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  29.17 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0222771 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  26.42 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  26.42 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2576  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.15 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  26.7 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  26.3 
 
 		 381 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  26.7 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  26.7 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  26.7 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  26.7 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  26.7 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1371  butyryl-CoA dehydrogenase  23.77 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.183303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.07 
 
 		 381 aa  59.3  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1288  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.14 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.751821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1892  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.36 
 
 		 378 aa  57  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.18 
 
 		 382 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6504  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.56 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285028  normal  0.547313 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33630  acyl-CoA dehydrogenase  26.14 
 
 		 386 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.14 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25 
 
 		 382 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.68 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2082  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.74 
 
 		 376 aa  54.7  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0313  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.73 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.740089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4384  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.58 
 
 		 375 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2001  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.77 
 
 		 366 aa  53.5  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1179  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  29.41 
 
 		 392 aa  53.5  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2279  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.74 
 
 		 383 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.68 
 
 		 388 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0119178  unclonable  0.00000752707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0876  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.43 
 
 		 387 aa  53.1  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.189497  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1109  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.79 
 
 		 388 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2530  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  24.41 
 
 		 378 aa  52.8  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204143  normal  0.36456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3492  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.44 
 
 		 383 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2436  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.74 
 
 		 383 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4023  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.29 
 
 		 379 aa  52.8  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.49 
 
 		 389 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335652  normal  0.412983 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0966  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.09 
 
 		 390 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  20.99 
 
 		 402 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1132  Acyl-CoA dehydrogenase, type 1  25.72 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4372  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.93 
 
 		 374 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  23.61 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0947  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.94 
 
 		 393 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2033  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.98 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0666462  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0344  acyl-CoA dehydrogenase-like  25.24 
 
 		 395 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5507  long-chain-acyl-CoA dehydrogenase  24.56 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0837  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.88 
 
 		 390 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3973  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.81 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78306  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1787  hypothetical protein  23.17 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1788  hypothetical protein  23.17 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4086  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.81 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303595  normal  0.349393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2430  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.42 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.303023  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.15 
 
 		 379 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  22.97 
 
 		 379 aa  50.4  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1261  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.82 
 
 		 385 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.403217  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4391  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.93 
 
 		 386 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2500  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.72 
 
 		 386 aa  50.1  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0453809  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1192  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.67 
 
 		 385 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0644386  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5112  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  19.76 
 
 		 599 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3106  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.53 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.332334  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5102  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.74 
 
 		 380 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1590  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.2 
 
 		 396 aa  50.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.99 
 
 		 379 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2471  butyryl-CoA dehydrogenase  25.54 
 
 		 597 aa  50.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0669  putative acyl-CoA dehydrogenase  24.68 
 
 		 389 aa  49.7  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282449  normal  0.0349391 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0830  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.27 
 
 		 397 aa  49.7  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.897667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1375  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.3 
 
 		 387 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.178062  normal  0.0980928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>