More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0615 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4085  putative acyl-CoA dehydrogenase  97.93 
 
 
387 aa  786    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14575  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0615  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 
387 aa  799    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.210833  normal  0.0397055 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4169  butyryl-CoA dehydrogenase  60.05 
 
 
383 aa  472  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0614852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4181  butyryl-CoA dehydrogenase  60.05 
 
 
383 aa  472  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181503  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2715  acyl-CoA dehydrogenase-like  56.52 
 
 
391 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.785448  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2430  acyl-CoA dehydrogenase-like  52.39 
 
 
385 aa  428  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000440313  normal  0.478447 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4228  isovaleryl-CoA dehydrogenase  51.32 
 
 
385 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.66405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4054  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.18 
 
 
384 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.4 
 
 
386 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0244674  normal  0.176746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.47 
 
 
386 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4180  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.21 
 
 
383 aa  408  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6335  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.84 
 
 
386 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4224  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.12 
 
 
400 aa  395  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0700017  normal  0.0824066 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2167  butyryl-CoA dehydrogenase  50.66 
 
 
399 aa  395  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.710802 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4073  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.05 
 
 
386 aa  398  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2510  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.47 
 
 
397 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0195405  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2093  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.6 
 
 
398 aa  391  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0300334  normal  0.0497691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0446  butyryl-CoA dehydrogenase  47.4 
 
 
385 aa  386  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1523  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.27 
 
 
397 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0413288  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0171  butyryl-CoA dehydrogenase  48.95 
 
 
385 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260341 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0182  butyryl-CoA dehydrogenase  48.95 
 
 
385 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0191  butyryl-CoA dehydrogenase  48.95 
 
 
385 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297032  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4367  butyryl-CoA dehydrogenase  49.2 
 
 
397 aa  378  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1977  butyryl-CoA dehydrogenase  48.94 
 
 
397 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7768  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.61 
 
 
397 aa  373  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0221  butyryl-CoA dehydrogenase  49.34 
 
 
385 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0556 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0673  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.56 
 
 
400 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1740  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.15 
 
 
397 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0177648  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0727  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.58 
 
 
398 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1759  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  48.15 
 
 
397 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1139  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.76 
 
 
399 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1456  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.51 
 
 
398 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1806  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.15 
 
 
397 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4031  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.54 
 
 
399 aa  362  8e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.328111  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4533  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.28 
 
 
398 aa  359  5e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0920452  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10217  acyl-CoA dehydrogenase fadE3  47.71 
 
 
373 aa  355  8.999999999999999e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  39.73 
 
 
379 aa  290  4e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0364  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.64 
 
 
386 aa  287  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0837  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.89 
 
 
390 aa  287  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.95 
 
 
379 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5641  Butyryl-CoA dehydrogenase  43.13 
 
 
379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.43 
 
 
381 aa  281  1e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2369  acyl-CoA dehydrogenase-like  41.49 
 
 
380 aa  279  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4358  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.73 
 
 
381 aa  279  5e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.48 
 
 
379 aa  279  5e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  41.4 
 
 
380 aa  277  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.15 
 
 
380 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.05 
 
 
380 aa  276  7e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2909  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.16 
 
 
389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.64 
 
 
379 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.04 
 
 
376 aa  273  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.25 
 
 
379 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.962066  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  39.04 
 
 
376 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  39.04 
 
 
376 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.11 
 
 
555 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3527  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.5 
 
 
386 aa  272  7e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496474  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1288  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.05 
 
 
379 aa  272  7e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.751821 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.89 
 
 
402 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  38.77 
 
 
376 aa  271  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1613  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.11 
 
 
568 aa  271  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10785  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  38.77 
 
 
381 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  38.77 
 
 
376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  38.77 
 
 
381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  38.77 
 
 
376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0312  isovaleryl-CoA dehydrogenase  38.11 
 
 
555 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4511  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.58 
 
 
560 aa  269  5e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  38.77 
 
 
376 aa  270  5e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.26 
 
 
379 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0067  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.34 
 
 
394 aa  269  8e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0264  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.89 
 
 
394 aa  268  8e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0644181  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6504  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.81 
 
 
375 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285028  normal  0.547313 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1679  acyl-CoA dehydrogenase  37.85 
 
 
548 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0534807  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2307  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.87 
 
 
381 aa  268  1e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  38.24 
 
 
381 aa  268  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.46 
 
 
380 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4384  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.14 
 
 
375 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17615  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.87 
 
 
379 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.47 
 
 
385 aa  266  5e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1175  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.73 
 
 
381 aa  266  7e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  37.87 
 
 
379 aa  265  8e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.19 
 
 
379 aa  265  1e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.97 
 
 
376 aa  264  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  37.33 
 
 
379 aa  263  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3827  bytyryl-CoA dehydrogenase (short-chain-acyl-CoA dehydrogenase)  40.16 
 
 
379 aa  262  6.999999999999999e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.84 
 
 
380 aa  262  8e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2684  putative acyl-CoA dehydrogenase  38.24 
 
 
375 aa  262  8e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.126402  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6291  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.42 
 
 
379 aa  262  8.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.96 
 
 
412 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266068  hitchhiker  0.00354782 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.37 
 
 
381 aa  261  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  38.71 
 
 
379 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  38.71 
 
 
379 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4372  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.13 
 
 
374 aa  261  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4575  isovaleryl-CoA dehydrogenase  39.32 
 
 
560 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138907  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4666  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.3 
 
 
375 aa  260  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.815528  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.22 
 
 
380 aa  260  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  38.85 
 
 
381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2151  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.27 
 
 
383 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  38.85 
 
 
381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  38.85 
 
 
381 aa  259  6e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  38.85 
 
 
381 aa  259  6e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>