More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2093 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2093  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 		 398 aa  807    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0300334  normal  0.0497691 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2510  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  80.56 
 
 		 397 aa  654    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0195405  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7768  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  77.72 
 
 		 397 aa  641    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1523  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  72.47 
 
 		 397 aa  598  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0413288  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1139  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  72.8 
 
 		 399 aa  592  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0673  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.36 
 
 		 400 aa  592  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1456  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.21 
 
 		 398 aa  591  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2167  butyryl-CoA dehydrogenase  71.93 
 
 		 399 aa  590  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.710802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1740  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.28 
 
 		 397 aa  588  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0177648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1759  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  71.28 
 
 		 397 aa  588  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1806  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.28 
 
 		 397 aa  588  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0727  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.6 
 
 		 398 aa  586  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4367  butyryl-CoA dehydrogenase  70.28 
 
 		 397 aa  585  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1977  butyryl-CoA dehydrogenase  70.28 
 
 		 397 aa  580  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4533  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.6 
 
 		 398 aa  572  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0920452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4031  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.35 
 
 		 399 aa  571  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.328111  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4224  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  57.76 
 
 		 400 aa  467  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0700017  normal  0.0824066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4085  putative acyl-CoA dehydrogenase  50.4 
 
 		 387 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0615  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.6 
 
 		 387 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.210833  normal  0.0397055 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50 
 
 		 386 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4054  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.22 
 
 		 384 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0446  butyryl-CoA dehydrogenase  47.14 
 
 		 385 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2430  acyl-CoA dehydrogenase-like  48.3 
 
 		 385 aa  379  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000440313  normal  0.478447 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.92 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0244674  normal  0.176746 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4228  isovaleryl-CoA dehydrogenase  49.07 
 
 		 385 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.66405 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0182  butyryl-CoA dehydrogenase  47.52 
 
 		 385 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0191  butyryl-CoA dehydrogenase  47.52 
 
 		 385 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0171  butyryl-CoA dehydrogenase  47.52 
 
 		 385 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260341 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2715  acyl-CoA dehydrogenase-like  45.79 
 
 		 391 aa  364  1e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.785448  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6335  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47 
 
 		 386 aa  363  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4169  butyryl-CoA dehydrogenase  45.34 
 
 		 383 aa  363  4e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0614852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4181  butyryl-CoA dehydrogenase  45.34 
 
 		 383 aa  363  4e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181503  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4180  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.23 
 
 		 383 aa  360  2e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0221  butyryl-CoA dehydrogenase  46.61 
 
 		 385 aa  358  8e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4073  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.03 
 
 		 386 aa  345  1e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10217  acyl-CoA dehydrogenase fadE3  45.23 
 
 		 373 aa  326  5e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3825  butyryl-CoA dehydrogenase  42.13 
 
 		 400 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4358  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.67 
 
 		 381 aa  300  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0833  putative acyl-CoA dehydrogenase  43.67 
 
 		 385 aa  298  8e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815342 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.01 
 
 		 381 aa  296  6e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4372  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.08 
 
 		 374 aa  295  9e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.51 
 
 		 412 aa  295  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266068  hitchhiker  0.00354782 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4427  Butyryl-CoA dehydrogenase  41.65 
 
 		 388 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000160956  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0733  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.84 
 
 		 377 aa  292  6e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4150  butyryl-CoA dehydrogenase  41.39 
 
 		 388 aa  291  9e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1175  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.56 
 
 		 381 aa  292  9e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  42.23 
 
 		 381 aa  290  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  42.23 
 
 		 381 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  42.49 
 
 		 381 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  42.49 
 
 		 381 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  42.23 
 
 		 381 aa  289  7e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  42.23 
 
 		 381 aa  289  7e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  42.23 
 
 		 381 aa  289  7e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  42.23 
 
 		 381 aa  288  9e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.3 
 
 		 380 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  41.97 
 
 		 381 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2307  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.16 
 
 		 381 aa  285  7e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  40.21 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2576  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.45 
 
 		 378 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.78 
 
 		 380 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4511  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.65 
 
 		 560 aa  281  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547594  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.51 
 
 		 379 aa  281  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1679  acyl-CoA dehydrogenase  41.75 
 
 		 548 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0534807  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1842  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.48 
 
 		 375 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0292697  normal  0.208883 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.45 
 
 		 381 aa  278  9e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2840  Acyl-CoA dehydrogenase  41.09 
 
 		 551 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.7 
 
 		 375 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2909  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.9 
 
 		 389 aa  277  2e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6291  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.06 
 
 		 379 aa  277  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.96 
 
 		 375 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.57 
 
 		 555 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0312  isovaleryl-CoA dehydrogenase  41.24 
 
 		 555 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.12 
 
 		 375 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0364  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.58 
 
 		 386 aa  276  4e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.16 
 
 		 380 aa  276  4e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.9 
 
 		 402 aa  275  7e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1613  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.21 
 
 		 568 aa  275  8e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.86 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.1 
 
 		 394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.954368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.12 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2382  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.89 
 
 		 389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.5 
 
 		 380 aa  273  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5641  Butyryl-CoA dehydrogenase  40.16 
 
 		 379 aa  272  8.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4575  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.36 
 
 		 560 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138907  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.58 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.962066  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  37.86 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0459  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.54 
 
 		 376 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.672922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1109  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.3 
 
 		 388 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2444  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.46 
 
 		 567 aa  271  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.590306  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2082  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.8 
 
 		 376 aa  271  2e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6504  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.7 
 
 		 375 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285028  normal  0.547313 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.01 
 
 		 379 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4257  putative acyl-CoA dehydrogenase  38.01 
 
 		 376 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0736  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  39.79 
 
 		 379 aa  270  4e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.763418 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.52 
 
 		 385 aa  269  5e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1233  acyl-CoA dehydrogenase-like  37.76 
 
 		 384 aa  269  5e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.831269  normal  0.440096 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0459  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.6 
 
 		 376 aa  270  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.24 
 
 		 388 aa  269  5e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0119178  unclonable  0.00000752707 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1172  acyl-CoA dehydrogenase  37.5 
 
 		 384 aa  269  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.336122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.22 
 
 		 382 aa  269  5.9999999999999995e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>