More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3827 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3827  bytyryl-CoA dehydrogenase (short-chain-acyl-CoA dehydrogenase)  100 
 
 
379 aa  785    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5641  Butyryl-CoA dehydrogenase  77.04 
 
 
379 aa  614  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  75.66 
 
 
380 aa  605  9.999999999999999e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  74.67 
 
 
379 aa  596  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.962066  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6291  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  74.07 
 
 
379 aa  590  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  74.67 
 
 
379 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  71.24 
 
 
380 aa  569  1e-161  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  56.99 
 
 
379 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  57.26 
 
 
380 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  57.78 
 
 
382 aa  437  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  54.62 
 
 
379 aa  434  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.94 
 
 
379 aa  430  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  57.52 
 
 
380 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.3 
 
 
394 aa  426  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.954368  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  54.88 
 
 
379 aa  422  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  54.88 
 
 
379 aa  423  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.3 
 
 
379 aa  421  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.394739 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  55.94 
 
 
379 aa  422  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  55.94 
 
 
379 aa  422  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  54.35 
 
 
379 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  54.09 
 
 
379 aa  418  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  54.35 
 
 
379 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  54.35 
 
 
379 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  54.09 
 
 
379 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.09 
 
 
379 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  54.09 
 
 
379 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  57.26 
 
 
386 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  54.09 
 
 
379 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  55.44 
 
 
376 aa  412  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  55.44 
 
 
381 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  55.17 
 
 
376 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  55.17 
 
 
376 aa  411  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  55.17 
 
 
381 aa  411  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  55.17 
 
 
376 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  55.44 
 
 
381 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.3 
 
 
379 aa  414  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  55.17 
 
 
376 aa  411  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.85 
 
 
379 aa  412  1e-114  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  54.91 
 
 
376 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  54.47 
 
 
379 aa  408  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1782  butyryl-CoA dehydrogenase  55.41 
 
 
379 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.257154  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4610  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.35 
 
 
379 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000229425  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.91 
 
 
376 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.91 
 
 
376 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2136  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.83 
 
 
380 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.281355 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.02 
 
 
381 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2281  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  54.88 
 
 
380 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1665  butyryl-CoA dehydrogenase  54.35 
 
 
380 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2192  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  54.35 
 
 
380 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.516178  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.56 
 
 
379 aa  401  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  53.56 
 
 
379 aa  397  1e-109  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.05 
 
 
380 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  50.53 
 
 
379 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2026  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.83 
 
 
641 aa  387  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000211003  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0733  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.13 
 
 
377 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.47 
 
 
379 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2369  acyl-CoA dehydrogenase-like  51.72 
 
 
380 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3451  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.03 
 
 
377 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  49.74 
 
 
379 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50 
 
 
402 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.46 
 
 
389 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.59 
 
 
380 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0730  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.87 
 
 
381 aa  377  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.66 
 
 
380 aa  376  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1932  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.13 
 
 
380 aa  372  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0081  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.53 
 
 
642 aa  370  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0096  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  47.99 
 
 
378 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0160842  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0140  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  48.79 
 
 
376 aa  368  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.06 
 
 
381 aa  369  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0837  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.74 
 
 
390 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.53 
 
 
380 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0092  butyryl-CoA dehydrogenase  49.87 
 
 
378 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0447  acyl-CoA dehydrogenase  47.18 
 
 
375 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0364  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.47 
 
 
386 aa  365  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4257  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.45 
 
 
376 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1288  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.6 
 
 
379 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.751821 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0391  acyl-CoA dehydrogenase  47.18 
 
 
375 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.31925  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6504  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.92 
 
 
375 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285028  normal  0.547313 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2500  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.74 
 
 
380 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4385  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.54 
 
 
377 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351154  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2906  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.79 
 
 
375 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.99 
 
 
375 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4365  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.26 
 
 
376 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  50.79 
 
 
381 aa  364  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0714  Acyl-CoA dehydrogenase  50.27 
 
 
377 aa  364  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  50.79 
 
 
381 aa  364  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4904  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.54 
 
 
377 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316996  normal  0.149852 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  50.53 
 
 
381 aa  363  2e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  50.53 
 
 
381 aa  363  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  50.53 
 
 
381 aa  363  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5650  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.75 
 
 
377 aa  363  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1084  butyryl-CoA dehydrogenase  48.81 
 
 
377 aa  363  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0155468 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1179  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  47.09 
 
 
392 aa  363  2e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  50.53 
 
 
381 aa  363  3e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4384  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.65 
 
 
375 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17615  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0505  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.13 
 
 
561 aa  363  4e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0459  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.18 
 
 
376 aa  362  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.672922 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4257  butyryl-CoA dehydrogenase  48.54 
 
 
377 aa  362  4e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.725306  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2137  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.68 
 
 
382 aa  362  6e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.545271  normal  0.220827 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0268  butyryl-CoA dehydrogenase  48.28 
 
 
379 aa  362  7.0000000000000005e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>