More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4085 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4085  putative acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 		 387 aa  798    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0615  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  97.93 
 
 		 387 aa  786    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.210833  normal  0.0397055 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4169  butyryl-CoA dehydrogenase  59.52 
 
 		 383 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0614852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4181  butyryl-CoA dehydrogenase  59.52 
 
 		 383 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181503  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2715  acyl-CoA dehydrogenase-like  56.01 
 
 		 391 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.785448  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2430  acyl-CoA dehydrogenase-like  52.28 
 
 		 385 aa  427  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000440313  normal  0.478447 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4228  isovaleryl-CoA dehydrogenase  51.32 
 
 		 385 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.66405 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4180  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.26 
 
 		 383 aa  417  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4054  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.92 
 
 		 384 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.87 
 
 		 386 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0244674  normal  0.176746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.21 
 
 		 386 aa  408  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4224  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.62 
 
 		 400 aa  403  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0700017  normal  0.0824066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6335  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.84 
 
 		 386 aa  401  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4073  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.32 
 
 		 386 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2510  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50 
 
 		 397 aa  398  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0195405  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2093  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.4 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0300334  normal  0.0497691 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2167  butyryl-CoA dehydrogenase  50.66 
 
 		 399 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.710802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0446  butyryl-CoA dehydrogenase  48.56 
 
 		 385 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4367  butyryl-CoA dehydrogenase  49.73 
 
 		 397 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0182  butyryl-CoA dehydrogenase  48.54 
 
 		 385 aa  381  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1523  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48 
 
 		 397 aa  382  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0413288  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0191  butyryl-CoA dehydrogenase  48.54 
 
 		 385 aa  381  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1977  butyryl-CoA dehydrogenase  49.47 
 
 		 397 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0171  butyryl-CoA dehydrogenase  48.81 
 
 		 385 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260341 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1740  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.94 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0177648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1759  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  48.94 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1806  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.94 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0221  butyryl-CoA dehydrogenase  49.73 
 
 		 385 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0673  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.83 
 
 		 400 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7768  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.61 
 
 		 397 aa  373  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1139  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.02 
 
 		 399 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0727  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.84 
 
 		 398 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1456  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.77 
 
 		 398 aa  372  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4031  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.81 
 
 		 399 aa  368  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.328111  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4533  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.54 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0920452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10217  acyl-CoA dehydrogenase fadE3  47.71 
 
 		 373 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0364  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.91 
 
 		 386 aa  293  5e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  40 
 
 		 379 aa  289  5.0000000000000004e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0837  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.15 
 
 		 390 aa  287  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.95 
 
 		 379 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5641  Butyryl-CoA dehydrogenase  43.13 
 
 		 379 aa  283  5.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.95 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.87 
 
 		 555 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2369  acyl-CoA dehydrogenase-like  41.49 
 
 		 380 aa  277  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0312  isovaleryl-CoA dehydrogenase  38.87 
 
 		 555 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4511  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.36 
 
 		 560 aa  278  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547594  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.95 
 
 		 379 aa  276  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4358  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.32 
 
 		 381 aa  277  3e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1679  acyl-CoA dehydrogenase  38.62 
 
 		 548 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0534807  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  40.69 
 
 		 380 aa  276  6e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.53 
 
 		 380 aa  275  9e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.68 
 
 		 380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.16 
 
 		 402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1288  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.32 
 
 		 379 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.751821 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.37 
 
 		 379 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3527  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.6 
 
 		 386 aa  272  8.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6504  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.35 
 
 		 375 aa  272  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285028  normal  0.547313 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.3 
 
 		 376 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.99 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.962066  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2909  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.47 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4384  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.11 
 
 		 375 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.13 
 
 		 379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1613  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.84 
 
 		 568 aa  270  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10785  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  38.77 
 
 		 376 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  38.77 
 
 		 376 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40 
 
 		 379 aa  270  5e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4575  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.1 
 
 		 560 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138907  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  38.13 
 
 		 379 aa  268  8e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  39.9 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  38.5 
 
 		 376 aa  268  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  39.9 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  38.5 
 
 		 376 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  39.9 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  39.9 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  39.9 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  38.5 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  39.9 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  39.9 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40 
 
 		 412 aa  268  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266068  hitchhiker  0.00354782 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  38.5 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  38.5 
 
 		 376 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  39.9 
 
 		 381 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.63 
 
 		 381 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2444  isovaleryl-CoA dehydrogenase  37.6 
 
 		 567 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.590306  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2307  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.47 
 
 		 381 aa  266  4e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  38.5 
 
 		 376 aa  266  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.47 
 
 		 385 aa  266  5e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.99 
 
 		 380 aa  266  5e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  37.6 
 
 		 379 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  37.97 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0067  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.34 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  39.63 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1175  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.32 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4372  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.1 
 
 		 374 aa  265  1e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3064  isovaleryl-CoA dehydrogenase  37.37 
 
 		 563 aa  264  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326905  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.46 
 
 		 379 aa  264  3e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.9 
 
 		 381 aa  263  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2840  Acyl-CoA dehydrogenase  37.85 
 
 		 551 aa  263  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2684  putative acyl-CoA dehydrogenase  38.5 
 
 		 375 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.126402  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0204  acyl-CoA dehydrogenase  38.99 
 
 		 564 aa  262  8e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0731517  normal  0.952971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>