More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6335 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6335  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 
386 aa  790    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4073  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.17 
 
 
386 aa  556  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.83 
 
 
386 aa  414  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4085  putative acyl-CoA dehydrogenase  51.84 
 
 
387 aa  401  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14575  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0615  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.84 
 
 
387 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.210833  normal  0.0397055 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4054  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.06 
 
 
384 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2430  acyl-CoA dehydrogenase-like  51.46 
 
 
385 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000440313  normal  0.478447 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4228  isovaleryl-CoA dehydrogenase  51.06 
 
 
385 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.66405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0171  butyryl-CoA dehydrogenase  48.94 
 
 
385 aa  381  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0446  butyryl-CoA dehydrogenase  48.28 
 
 
385 aa  381  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0182  butyryl-CoA dehydrogenase  48.68 
 
 
385 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0191  butyryl-CoA dehydrogenase  48.68 
 
 
385 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297032  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7768  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.43 
 
 
397 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2510  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.91 
 
 
397 aa  373  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0195405  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.6 
 
 
386 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0244674  normal  0.176746 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2167  butyryl-CoA dehydrogenase  49.61 
 
 
399 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.710802 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4180  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.88 
 
 
383 aa  371  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0221  butyryl-CoA dehydrogenase  49.34 
 
 
385 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4533  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.6 
 
 
398 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0920452  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4031  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.34 
 
 
399 aa  363  2e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.328111  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2093  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47 
 
 
398 aa  363  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0300334  normal  0.0497691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4224  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.8 
 
 
400 aa  362  7.0000000000000005e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0700017  normal  0.0824066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4169  butyryl-CoA dehydrogenase  48.81 
 
 
383 aa  361  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0614852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4181  butyryl-CoA dehydrogenase  48.81 
 
 
383 aa  361  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181503  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1139  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.19 
 
 
399 aa  361  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2715  acyl-CoA dehydrogenase-like  47.71 
 
 
391 aa  351  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.785448  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0673  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.83 
 
 
400 aa  348  9e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4367  butyryl-CoA dehydrogenase  45.05 
 
 
397 aa  348  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0727  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.31 
 
 
398 aa  347  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1759  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  46.26 
 
 
397 aa  345  6e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1806  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.26 
 
 
397 aa  345  6e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1740  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.26 
 
 
397 aa  345  6e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0177648  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1523  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.65 
 
 
397 aa  344  2e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0413288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1977  butyryl-CoA dehydrogenase  45.72 
 
 
397 aa  344  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1456  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.6 
 
 
398 aa  338  5.9999999999999996e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10217  acyl-CoA dehydrogenase fadE3  47.46 
 
 
373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.14 
 
 
379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  42.56 
 
 
379 aa  333  3e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.85 
 
 
380 aa  330  3e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.65 
 
 
381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  44.85 
 
 
381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  45.12 
 
 
381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  44.85 
 
 
381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  45.12 
 
 
381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  44.85 
 
 
381 aa  327  3e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  44.85 
 
 
381 aa  327  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  44.85 
 
 
381 aa  327  3e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.5 
 
 
380 aa  326  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.09 
 
 
380 aa  326  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  44.59 
 
 
381 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  44.33 
 
 
381 aa  324  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  44.33 
 
 
379 aa  324  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.06 
 
 
381 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  44.06 
 
 
379 aa  324  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.95 
 
 
376 aa  322  7e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  42.48 
 
 
376 aa  322  8e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  44.33 
 
 
379 aa  322  8e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  42.48 
 
 
376 aa  322  8e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  44.33 
 
 
379 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  44.06 
 
 
379 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  44.06 
 
 
379 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  44.06 
 
 
379 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  44.06 
 
 
379 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  42.22 
 
 
381 aa  319  6e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  42.22 
 
 
376 aa  318  7e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  42.22 
 
 
376 aa  319  7e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.16 
 
 
379 aa  318  7e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  42.22 
 
 
376 aa  319  7e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  42.22 
 
 
381 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  43.8 
 
 
379 aa  318  9e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.31 
 
 
379 aa  317  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  41.95 
 
 
376 aa  316  4e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0268  butyryl-CoA dehydrogenase  45.26 
 
 
379 aa  316  4e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  41.69 
 
 
381 aa  315  6e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0837  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.37 
 
 
390 aa  315  7e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2369  acyl-CoA dehydrogenase-like  43.16 
 
 
380 aa  315  8e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.46 
 
 
379 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  43.86 
 
 
379 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.82 
 
 
379 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4358  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.62 
 
 
381 aa  313  3.9999999999999997e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.71 
 
 
381 aa  312  6.999999999999999e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1288  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.33 
 
 
379 aa  312  6.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.751821 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2307  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.5 
 
 
381 aa  312  7.999999999999999e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.81 
 
 
382 aa  311  9e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.38 
 
 
377 aa  311  1e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.89 
 
 
380 aa  311  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.85 
 
 
389 aa  311  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.56 
 
 
380 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45 
 
 
382 aa  309  5e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4372  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.43 
 
 
374 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2867  Acyl-CoA dehydrogenase-like  43.09 
 
 
375 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.967944  normal  0.115681 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.9 
 
 
376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0733  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.91 
 
 
377 aa  307  3e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.19 
 
 
394 aa  306  3e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.954368  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0096  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  41.11 
 
 
378 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0160842  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1932  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.26 
 
 
380 aa  306  5.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2576  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.26 
 
 
378 aa  305  7e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6504  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.53 
 
 
375 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285028  normal  0.547313 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2500  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.89 
 
 
380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0247  Acyl-CoA dehydrogenase  45.29 
 
 
378 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>