More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7768 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7768  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 
397 aa  809    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2093  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  77.72 
 
 
398 aa  641    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0300334  normal  0.0497691 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1139  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  77.64 
 
 
399 aa  637    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1523  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  75.57 
 
 
397 aa  631  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0413288  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2510  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  75.44 
 
 
397 aa  626  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0195405  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4367  butyryl-CoA dehydrogenase  73.48 
 
 
397 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1740  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  73.74 
 
 
397 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0177648  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1759  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  73.74 
 
 
397 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1806  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  73.74 
 
 
397 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1977  butyryl-CoA dehydrogenase  72.73 
 
 
397 aa  604  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1456  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  72.04 
 
 
398 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2167  butyryl-CoA dehydrogenase  71.54 
 
 
399 aa  594  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.710802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0727  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.03 
 
 
398 aa  591  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0673  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.28 
 
 
400 aa  590  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4031  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.92 
 
 
399 aa  574  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.328111  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4533  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.42 
 
 
398 aa  571  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0920452  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4224  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  61.07 
 
 
400 aa  482  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0700017  normal  0.0824066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.87 
 
 
386 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4054  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.83 
 
 
384 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6335  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.43 
 
 
386 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0446  butyryl-CoA dehydrogenase  46.35 
 
 
385 aa  378  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0615  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.61 
 
 
387 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.210833  normal  0.0397055 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2430  acyl-CoA dehydrogenase-like  47.91 
 
 
385 aa  375  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000440313  normal  0.478447 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4085  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.61 
 
 
387 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14575  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4228  isovaleryl-CoA dehydrogenase  46.46 
 
 
385 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.66405 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4180  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.71 
 
 
383 aa  366  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4169  butyryl-CoA dehydrogenase  47.01 
 
 
383 aa  363  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0614852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4181  butyryl-CoA dehydrogenase  47.01 
 
 
383 aa  363  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181503  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0182  butyryl-CoA dehydrogenase  45.95 
 
 
385 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0171  butyryl-CoA dehydrogenase  45.95 
 
 
385 aa  364  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260341 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0191  butyryl-CoA dehydrogenase  45.95 
 
 
385 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297032  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.05 
 
 
386 aa  363  4e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0244674  normal  0.176746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0221  butyryl-CoA dehydrogenase  46.61 
 
 
385 aa  358  7e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0556 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2715  acyl-CoA dehydrogenase-like  46.17 
 
 
391 aa  354  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.785448  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4073  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.43 
 
 
386 aa  353  2e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10217  acyl-CoA dehydrogenase fadE3  44.41 
 
 
373 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.3 
 
 
379 aa  288  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.962066  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1175  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.82 
 
 
381 aa  287  2e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2307  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.94 
 
 
381 aa  286  5e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4372  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.15 
 
 
374 aa  286  5.999999999999999e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0833  putative acyl-CoA dehydrogenase  40.78 
 
 
385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815342 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1613  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.24 
 
 
568 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10785  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4358  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.21 
 
 
381 aa  281  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.59 
 
 
402 aa  280  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.82 
 
 
380 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3825  butyryl-CoA dehydrogenase  39.64 
 
 
400 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4427  Butyryl-CoA dehydrogenase  40.41 
 
 
388 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000160956  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.43 
 
 
412 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266068  hitchhiker  0.00354782 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1679  acyl-CoA dehydrogenase  40.1 
 
 
548 aa  279  6e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0534807  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4511  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.1 
 
 
560 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547594  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.05 
 
 
379 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.3 
 
 
381 aa  278  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0312  isovaleryl-CoA dehydrogenase  39.85 
 
 
555 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5641  Butyryl-CoA dehydrogenase  40.26 
 
 
379 aa  276  6e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4150  butyryl-CoA dehydrogenase  39.38 
 
 
388 aa  276  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2228  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.85 
 
 
562 aa  275  7e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489531  normal  0.489903 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0733  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.16 
 
 
377 aa  275  8e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.84 
 
 
377 aa  275  8e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2504  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.85 
 
 
562 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181987  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.52 
 
 
381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  39.64 
 
 
380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3365  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.89 
 
 
381 aa  273  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0447  acyl-CoA dehydrogenase  40 
 
 
375 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  40.52 
 
 
381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  40.52 
 
 
381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2909  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.56 
 
 
389 aa  272  7e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.68 
 
 
379 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  40.78 
 
 
381 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.18 
 
 
555 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  40.78 
 
 
381 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  40.52 
 
 
381 aa  272  9e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  40.52 
 
 
381 aa  272  9e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6504  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.48 
 
 
375 aa  272  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285028  normal  0.547313 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  40.52 
 
 
381 aa  272  9e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.52 
 
 
380 aa  272  9e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  39.68 
 
 
379 aa  272  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  40.52 
 
 
381 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.84 
 
 
379 aa  271  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0391  acyl-CoA dehydrogenase  39.74 
 
 
375 aa  271  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.31925  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2576  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.13 
 
 
378 aa  271  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.8 
 
 
379 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0736  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  40.58 
 
 
379 aa  271  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.763418 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2840  Acyl-CoA dehydrogenase  39.69 
 
 
551 aa  271  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0310  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.92 
 
 
563 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0589554  normal  0.08283 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4575  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.36 
 
 
560 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138907  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  40.26 
 
 
381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.08 
 
 
375 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6291  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.76 
 
 
379 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0530  Acyl-CoA dehydrogenase  39.43 
 
 
560 aa  269  5.9999999999999995e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  39.52 
 
 
379 aa  269  8e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2186  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.33 
 
 
562 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0552217  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0220  acyl-CoA dehydrogenase  37.4 
 
 
384 aa  268  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0793985  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3064  isovaleryl-CoA dehydrogenase  38.72 
 
 
563 aa  268  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326905  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4351  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.46 
 
 
560 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05445  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.15 
 
 
386 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.18 
 
 
380 aa  266  7e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3683  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.99 
 
 
384 aa  266  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.685138 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.55 
 
 
375 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.29 
 
 
375 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1842  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.55 
 
 
375 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0292697  normal  0.208883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>