More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2186 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  66.48 
 
 		 555 aa  728    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4575  isovaleryl-CoA dehydrogenase  83.08 
 
 		 560 aa  870    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138907  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2504  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  95.91 
 
 		 562 aa  1058    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1679  acyl-CoA dehydrogenase  66.48 
 
 		 548 aa  715    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0534807  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3064  isovaleryl-CoA dehydrogenase  62.99 
 
 		 563 aa  682    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326905  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4351  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  84.16 
 
 		 560 aa  967    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0312  isovaleryl-CoA dehydrogenase  66.48 
 
 		 555 aa  718    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0530  Acyl-CoA dehydrogenase  63.8 
 
 		 560 aa  707    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2228  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  95.91 
 
 		 562 aa  1056    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489531  normal  0.489903 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2186  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 562 aa  1129    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0552217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2444  isovaleryl-CoA dehydrogenase  64.42 
 
 		 567 aa  706    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.590306  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1059  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  62.16 
 
 		 569 aa  657    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.773265 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4511  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  81.77 
 
 		 560 aa  902    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547594  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1613  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  68.46 
 
 		 568 aa  729    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0204  acyl-CoA dehydrogenase  64.6 
 
 		 564 aa  716    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0731517  normal  0.952971 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2840  Acyl-CoA dehydrogenase  63.94 
 
 		 551 aa  691    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0310  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.34 
 
 		 563 aa  794    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0589554  normal  0.08283 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3795  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  57.92 
 
 		 528 aa  559  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2897  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  55.75 
 
 		 527 aa  551  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4224  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.79 
 
 		 400 aa  300  5e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0700017  normal  0.0824066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.94 
 
 		 412 aa  292  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266068  hitchhiker  0.00354782 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2430  acyl-CoA dehydrogenase-like  42.31 
 
 		 385 aa  287  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000440313  normal  0.478447 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4180  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.31 
 
 		 383 aa  283  7.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0833  putative acyl-CoA dehydrogenase  40.83 
 
 		 385 aa  280  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815342 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3825  butyryl-CoA dehydrogenase  41.07 
 
 		 400 aa  280  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4427  Butyryl-CoA dehydrogenase  40.87 
 
 		 388 aa  279  9e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000160956  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4150  butyryl-CoA dehydrogenase  41.13 
 
 		 388 aa  279  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4054  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.45 
 
 		 384 aa  278  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.25 
 
 		 386 aa  278  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2510  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.41 
 
 		 397 aa  278  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0195405  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4228  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.46 
 
 		 385 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.66405 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.64 
 
 		 383 aa  274  3e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.9 
 
 		 379 aa  270  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0446  butyryl-CoA dehydrogenase  38.72 
 
 		 385 aa  270  7e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7768  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.33 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.9 
 
 		 385 aa  266  5e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6335  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.5 
 
 		 386 aa  266  7e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4367  butyryl-CoA dehydrogenase  39.23 
 
 		 397 aa  266  7e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2093  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.85 
 
 		 398 aa  265  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0300334  normal  0.0497691 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1139  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.79 
 
 		 399 aa  265  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4169  butyryl-CoA dehydrogenase  39.56 
 
 		 383 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0614852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4181  butyryl-CoA dehydrogenase  39.56 
 
 		 383 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181503  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0919  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.6 
 
 		 383 aa  263  6.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0182  butyryl-CoA dehydrogenase  39.39 
 
 		 385 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0191  butyryl-CoA dehydrogenase  39.39 
 
 		 385 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1977  butyryl-CoA dehydrogenase  39.23 
 
 		 397 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1806  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.23 
 
 		 397 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1740  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.23 
 
 		 397 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0177648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1759  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  39.23 
 
 		 397 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4085  putative acyl-CoA dehydrogenase  37.4 
 
 		 387 aa  259  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0171  butyryl-CoA dehydrogenase  39.13 
 
 		 385 aa  259  8e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260341 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.89 
 
 		 386 aa  257  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0244674  normal  0.176746 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1172  acyl-CoA dehydrogenase  37.63 
 
 		 384 aa  256  6e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.336122 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2715  acyl-CoA dehydrogenase-like  37.66 
 
 		 391 aa  256  6e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.785448  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1233  acyl-CoA dehydrogenase-like  37.63 
 
 		 384 aa  256  8e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.831269  normal  0.440096 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3683  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.54 
 
 		 384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.685138 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0220  acyl-CoA dehydrogenase  39.12 
 
 		 384 aa  253  5.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0793985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1052  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40 
 
 		 386 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2901  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.4 
 
 		 379 aa  253  6e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0615  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.62 
 
 		 387 aa  253  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.210833  normal  0.0397055 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0221  butyryl-CoA dehydrogenase  39.23 
 
 		 385 aa  253  6e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4073  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.69 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3451  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.78 
 
 		 377 aa  249  8e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.56 
 
 		 380 aa  249  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.06 
 
 		 380 aa  249  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0155  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.22 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000954759  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2167  butyryl-CoA dehydrogenase  36.29 
 
 		 399 aa  246  6e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.710802 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  39.22 
 
 		 381 aa  246  8e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  39.22 
 
 		 381 aa  246  8e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.3 
 
 		 379 aa  246  9e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43420  putative acyl-CoA dehydrogenase  37.76 
 
 		 384 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0779209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.8 
 
 		 380 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0148  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.02 
 
 		 385 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1523  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.12 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0413288  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.74 
 
 		 377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1318  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.18 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0793911 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1770  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.9 
 
 		 512 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  39.22 
 
 		 381 aa  244  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  39.22 
 
 		 381 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  39.22 
 
 		 381 aa  244  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  38.96 
 
 		 381 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  38.96 
 
 		 381 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  38.96 
 
 		 381 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0298  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.66 
 
 		 381 aa  244  3.9999999999999997e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0130  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.76 
 
 		 385 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3642  putative acyl-CoA dehydrogenase  37.24 
 
 		 384 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.96 
 
 		 381 aa  243  6e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  38.96 
 
 		 381 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.66 
 
 		 382 aa  243  9e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1109  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.89 
 
 		 388 aa  243  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4031  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.53 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.328111  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.96 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10217  acyl-CoA dehydrogenase fadE3  38.19 
 
 		 373 aa  241  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1456  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.64 
 
 		 398 aa  242  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4533  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.53 
 
 		 398 aa  240  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0920452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0037  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.05 
 
 		 387 aa  241  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119681  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.89 
 
 		 388 aa  241  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0119178  unclonable  0.00000752707 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.37 
 
 		 381 aa  239  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0673  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.48 
 
 		 400 aa  239  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0176  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.05 
 
 		 385 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142689  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>