More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1456 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1456  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
398 aa  815    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1139  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  76.63 
 
 
399 aa  631  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2510  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  73.99 
 
 
397 aa  617  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0195405  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1740  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  72.8 
 
 
397 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0177648  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1759  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  72.8 
 
 
397 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1806  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  72.8 
 
 
397 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4367  butyryl-CoA dehydrogenase  72.04 
 
 
397 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7768  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  72.04 
 
 
397 aa  602  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1977  butyryl-CoA dehydrogenase  71.54 
 
 
397 aa  597  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2093  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.21 
 
 
398 aa  591  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0300334  normal  0.0497691 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2167  butyryl-CoA dehydrogenase  71.75 
 
 
399 aa  593  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.710802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0727  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.1 
 
 
398 aa  585  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1523  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  68.51 
 
 
397 aa  582  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0413288  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0673  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  68.84 
 
 
400 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4031  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.25 
 
 
399 aa  580  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.328111  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4533  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.93 
 
 
398 aa  577  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0920452  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4224  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  60.05 
 
 
400 aa  486  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0700017  normal  0.0824066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.91 
 
 
386 aa  378  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4085  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.77 
 
 
387 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14575  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4054  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.86 
 
 
384 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4228  isovaleryl-CoA dehydrogenase  45.1 
 
 
385 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.66405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0615  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.51 
 
 
387 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.210833  normal  0.0397055 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0446  butyryl-CoA dehydrogenase  45.05 
 
 
385 aa  365  1e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.35 
 
 
386 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0244674  normal  0.176746 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2430  acyl-CoA dehydrogenase-like  45.55 
 
 
385 aa  361  1e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000440313  normal  0.478447 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0182  butyryl-CoA dehydrogenase  47 
 
 
385 aa  361  1e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0191  butyryl-CoA dehydrogenase  47 
 
 
385 aa  361  1e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297032  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4169  butyryl-CoA dehydrogenase  45.85 
 
 
383 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0614852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4181  butyryl-CoA dehydrogenase  45.85 
 
 
383 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181503  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0171  butyryl-CoA dehydrogenase  47 
 
 
385 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260341 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4180  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.98 
 
 
383 aa  350  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6335  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.6 
 
 
386 aa  338  7e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0221  butyryl-CoA dehydrogenase  44.27 
 
 
385 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0556 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4073  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.82 
 
 
386 aa  336  5e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2715  acyl-CoA dehydrogenase-like  43.38 
 
 
391 aa  330  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.785448  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10217  acyl-CoA dehydrogenase fadE3  46.52 
 
 
373 aa  330  4e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2307  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.78 
 
 
381 aa  286  5.999999999999999e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.36 
 
 
379 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0447  acyl-CoA dehydrogenase  40.58 
 
 
375 aa  281  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4358  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.58 
 
 
381 aa  281  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.74 
 
 
375 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1085  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.67 
 
 
373 aa  280  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.863384  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0391  acyl-CoA dehydrogenase  40.84 
 
 
375 aa  281  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.31925  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0733  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.01 
 
 
377 aa  281  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3825  butyryl-CoA dehydrogenase  40.3 
 
 
400 aa  280  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.74 
 
 
375 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.82 
 
 
381 aa  280  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.08 
 
 
380 aa  278  8e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1175  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.26 
 
 
381 aa  277  3e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.74 
 
 
375 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1126  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.84 
 
 
373 aa  276  4e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4427  Butyryl-CoA dehydrogenase  40.21 
 
 
388 aa  276  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000160956  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0364  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.66 
 
 
386 aa  276  6e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  41.3 
 
 
381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  41.3 
 
 
381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4150  butyryl-CoA dehydrogenase  39.69 
 
 
388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  40 
 
 
380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.32 
 
 
379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  41.3 
 
 
381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  41.3 
 
 
381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1842  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.96 
 
 
375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0292697  normal  0.208883 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  41.3 
 
 
381 aa  273  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  41.3 
 
 
381 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  41.3 
 
 
381 aa  273  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  41.3 
 
 
381 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  37.5 
 
 
379 aa  273  4.0000000000000004e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2909  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.41 
 
 
389 aa  272  6e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4185  acyl-CoA dehydrogenase-like  39.53 
 
 
376 aa  272  6e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.01 
 
 
376 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  41.04 
 
 
381 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0833  putative acyl-CoA dehydrogenase  39.74 
 
 
385 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815342 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.3 
 
 
379 aa  271  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.962066  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1179  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  37.69 
 
 
392 aa  271  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2840  Acyl-CoA dehydrogenase  38.4 
 
 
551 aa  271  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4372  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.31 
 
 
374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.53 
 
 
376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.36 
 
 
379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.3 
 
 
380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0459  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.48 
 
 
376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.672922 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5985  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.01 
 
 
376 aa  270  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00997774 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3838  acyl-CoA dehydrogenase-like  39.01 
 
 
376 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.18 
 
 
380 aa  269  7e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.45 
 
 
381 aa  269  8e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.89 
 
 
555 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  39.53 
 
 
381 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4365  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.01 
 
 
376 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0312  isovaleryl-CoA dehydrogenase  37.89 
 
 
555 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  39.53 
 
 
376 aa  268  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  39.53 
 
 
376 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  39.53 
 
 
376 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1679  acyl-CoA dehydrogenase  37.89 
 
 
548 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0534807  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  39.53 
 
 
376 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3774  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.01 
 
 
376 aa  267  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4257  putative acyl-CoA dehydrogenase  37.96 
 
 
376 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6504  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.96 
 
 
375 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285028  normal  0.547313 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  39.53 
 
 
376 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  39.01 
 
 
381 aa  267  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  39.53 
 
 
381 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  39.53 
 
 
376 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0459  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.22 
 
 
376 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>