More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4180 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4180  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 
383 aa  790    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0446  butyryl-CoA dehydrogenase  82.68 
 
 
385 aa  654    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0182  butyryl-CoA dehydrogenase  82.86 
 
 
385 aa  651    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0171  butyryl-CoA dehydrogenase  82.86 
 
 
385 aa  650    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260341 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0191  butyryl-CoA dehydrogenase  82.86 
 
 
385 aa  651    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297032  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0221  butyryl-CoA dehydrogenase  81.36 
 
 
385 aa  624  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0556 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2430  acyl-CoA dehydrogenase-like  74.15 
 
 
385 aa  598  1e-170  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000440313  normal  0.478447 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  74.28 
 
 
386 aa  596  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4054  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  73.63 
 
 
384 aa  595  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10217  acyl-CoA dehydrogenase fadE3  80.79 
 
 
373 aa  594  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4228  isovaleryl-CoA dehydrogenase  72.89 
 
 
385 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.66405 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.21 
 
 
386 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0244674  normal  0.176746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4085  putative acyl-CoA dehydrogenase  50.26 
 
 
387 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14575  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0615  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.21 
 
 
387 aa  408  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.210833  normal  0.0397055 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4169  butyryl-CoA dehydrogenase  47.11 
 
 
383 aa  391  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0614852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4181  butyryl-CoA dehydrogenase  47.11 
 
 
383 aa  391  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181503  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2510  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.73 
 
 
397 aa  373  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0195405  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4224  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.7 
 
 
400 aa  373  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0700017  normal  0.0824066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4367  butyryl-CoA dehydrogenase  47.48 
 
 
397 aa  368  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6335  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.88 
 
 
386 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1977  butyryl-CoA dehydrogenase  47.4 
 
 
397 aa  368  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7768  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.71 
 
 
397 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2167  butyryl-CoA dehydrogenase  47.34 
 
 
399 aa  365  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.710802 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1139  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.97 
 
 
399 aa  368  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4073  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.89 
 
 
386 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2093  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.23 
 
 
398 aa  360  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0300334  normal  0.0497691 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1740  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.95 
 
 
397 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0177648  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1759  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  46.95 
 
 
397 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1806  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.95 
 
 
397 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1523  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.91 
 
 
397 aa  358  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0413288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4031  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.28 
 
 
399 aa  356  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.328111  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4533  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.01 
 
 
398 aa  353  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0920452  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1456  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.98 
 
 
398 aa  350  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0673  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.36 
 
 
400 aa  349  6e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0727  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.83 
 
 
398 aa  345  6e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2715  acyl-CoA dehydrogenase-like  42.71 
 
 
391 aa  341  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.785448  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1175  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.86 
 
 
381 aa  297  2e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4511  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.49 
 
 
560 aa  292  7e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547594  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2307  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.01 
 
 
381 aa  292  7e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4358  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.73 
 
 
381 aa  289  6e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3064  isovaleryl-CoA dehydrogenase  42.48 
 
 
563 aa  286  4e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326905  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0312  isovaleryl-CoA dehydrogenase  39.95 
 
 
555 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4575  isovaleryl-CoA dehydrogenase  41.87 
 
 
560 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138907  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.82 
 
 
394 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.954368  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2909  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.06 
 
 
389 aa  283  5.000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2186  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.31 
 
 
562 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0552217  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4372  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.91 
 
 
374 aa  283  5.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.05 
 
 
555 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1679  acyl-CoA dehydrogenase  39.69 
 
 
548 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0534807  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.69 
 
 
375 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.69 
 
 
375 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2228  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.21 
 
 
562 aa  279  7e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489531  normal  0.489903 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2504  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.21 
 
 
562 aa  278  9e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181987  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.11 
 
 
379 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2840  Acyl-CoA dehydrogenase  39.79 
 
 
551 aa  276  6e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4351  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.43 
 
 
560 aa  275  8e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05445  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1059  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40 
 
 
569 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.773265 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.02 
 
 
375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0204  acyl-CoA dehydrogenase  40.05 
 
 
564 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0731517  normal  0.952971 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.02 
 
 
379 aa  273  5.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.394739 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4427  Butyryl-CoA dehydrogenase  38.92 
 
 
388 aa  273  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000160956  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3825  butyryl-CoA dehydrogenase  38.66 
 
 
400 aa  272  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0310  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.69 
 
 
563 aa  272  6e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0589554  normal  0.08283 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2444  isovaleryl-CoA dehydrogenase  38.97 
 
 
567 aa  272  6e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.590306  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1613  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.83 
 
 
568 aa  271  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10785  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1052  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.43 
 
 
386 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  38.56 
 
 
376 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  38.56 
 
 
376 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  38.56 
 
 
376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3642  putative acyl-CoA dehydrogenase  40.21 
 
 
384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  38.56 
 
 
376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.41 
 
 
376 aa  270  4e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.16 
 
 
381 aa  270  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  38.56 
 
 
376 aa  269  5e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  38.3 
 
 
381 aa  269  7e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  38.3 
 
 
376 aa  268  8e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  40.16 
 
 
381 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  40.16 
 
 
381 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  38.3 
 
 
381 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4150  butyryl-CoA dehydrogenase  37.89 
 
 
388 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1842  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.95 
 
 
375 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0292697  normal  0.208883 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.89 
 
 
380 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  40.16 
 
 
381 aa  268  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  40.16 
 
 
381 aa  267  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  40.16 
 
 
381 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  40.16 
 
 
381 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  38.3 
 
 
381 aa  268  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  40.16 
 
 
381 aa  267  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1172  acyl-CoA dehydrogenase  38.71 
 
 
384 aa  268  2e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.336122 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0530  Acyl-CoA dehydrogenase  37.82 
 
 
560 aa  267  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  40.16 
 
 
381 aa  268  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1233  acyl-CoA dehydrogenase-like  38.71 
 
 
384 aa  267  2e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.831269  normal  0.440096 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.3 
 
 
379 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  40.16 
 
 
381 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.95 
 
 
412 aa  266  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266068  hitchhiker  0.00354782 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43420  putative acyl-CoA dehydrogenase  39.95 
 
 
384 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0779209  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0837  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.07 
 
 
390 aa  266  4e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4610  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.69 
 
 
379 aa  266  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000229425  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0264  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.74 
 
 
394 aa  266  5e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0644181  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.06 
 
 
385 aa  266  5.999999999999999e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>