More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0727 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0727  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 		 398 aa  812    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0673  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  96.98 
 
 		 400 aa  789    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1139  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  75.5 
 
 		 399 aa  629  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2167  butyryl-CoA dehydrogenase  76.88 
 
 		 399 aa  629  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.710802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4031  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  75.88 
 
 		 399 aa  617  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.328111  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4533  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  75.88 
 
 		 398 aa  615  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0920452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2510  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  71.61 
 
 		 397 aa  599  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0195405  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1740  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.92 
 
 		 397 aa  591  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0177648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1523  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  71.11 
 
 		 397 aa  592  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0413288  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1759  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  69.92 
 
 		 397 aa  591  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7768  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  70.03 
 
 		 397 aa  591  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1806  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.92 
 
 		 397 aa  591  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2093  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.6 
 
 		 398 aa  586  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0300334  normal  0.0497691 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1456  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.1 
 
 		 398 aa  585  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4367  butyryl-CoA dehydrogenase  69.17 
 
 		 397 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1977  butyryl-CoA dehydrogenase  68.75 
 
 		 397 aa  578  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4224  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  56.6 
 
 		 400 aa  462  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0700017  normal  0.0824066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4085  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.84 
 
 		 387 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0615  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.58 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.210833  normal  0.0397055 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.35 
 
 		 386 aa  362  6e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4054  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.32 
 
 		 384 aa  362  7.0000000000000005e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.6 
 
 		 386 aa  358  9e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0244674  normal  0.176746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0446  butyryl-CoA dehydrogenase  45.41 
 
 		 385 aa  353  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2430  acyl-CoA dehydrogenase-like  45.05 
 
 		 385 aa  349  4e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000440313  normal  0.478447 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4228  isovaleryl-CoA dehydrogenase  43.6 
 
 		 385 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.66405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6335  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.31 
 
 		 386 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4169  butyryl-CoA dehydrogenase  44.85 
 
 		 383 aa  347  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0614852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4181  butyryl-CoA dehydrogenase  44.85 
 
 		 383 aa  347  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181503  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4180  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.83 
 
 		 383 aa  345  7e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0221  butyryl-CoA dehydrogenase  46.46 
 
 		 385 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4073  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.42 
 
 		 386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0171  butyryl-CoA dehydrogenase  43.9 
 
 		 385 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260341 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0182  butyryl-CoA dehydrogenase  43.64 
 
 		 385 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0191  butyryl-CoA dehydrogenase  43.64 
 
 		 385 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2715  acyl-CoA dehydrogenase-like  42.34 
 
 		 391 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.785448  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10217  acyl-CoA dehydrogenase fadE3  45.15 
 
 		 373 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.34 
 
 		 381 aa  288  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4372  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.67 
 
 		 374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.12 
 
 		 380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3825  butyryl-CoA dehydrogenase  41.37 
 
 		 400 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  41.65 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  41.9 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  41.9 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  41.65 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  41.65 
 
 		 381 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  41.65 
 
 		 381 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  41.65 
 
 		 381 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  40.66 
 
 		 381 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4427  Butyryl-CoA dehydrogenase  41.13 
 
 		 388 aa  279  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000160956  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  40.41 
 
 		 381 aa  278  9e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4150  butyryl-CoA dehydrogenase  41.13 
 
 		 388 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.19 
 
 		 379 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.6 
 
 		 380 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.24 
 
 		 381 aa  277  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.41 
 
 		 379 aa  275  9e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.41 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.962066  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.87 
 
 		 555 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.67 
 
 		 379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  40.05 
 
 		 380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0312  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.87 
 
 		 555 aa  272  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1679  acyl-CoA dehydrogenase  40.62 
 
 		 548 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0534807  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.36 
 
 		 376 aa  269  7e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.36 
 
 		 377 aa  268  8e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.18 
 
 		 402 aa  268  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0364  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.4 
 
 		 386 aa  268  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2307  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.74 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1172  acyl-CoA dehydrogenase  36.79 
 
 		 384 aa  266  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.336122 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1932  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.82 
 
 		 380 aa  267  2.9999999999999995e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1233  acyl-CoA dehydrogenase-like  37.05 
 
 		 384 aa  267  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.831269  normal  0.440096 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3064  isovaleryl-CoA dehydrogenase  39.64 
 
 		 563 aa  265  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326905  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4358  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.86 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2369  acyl-CoA dehydrogenase-like  38.3 
 
 		 380 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2840  Acyl-CoA dehydrogenase  40.1 
 
 		 551 aa  265  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.12 
 
 		 380 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2576  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.64 
 
 		 378 aa  264  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1175  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.33 
 
 		 381 aa  264  3e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.47 
 
 		 380 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.76 
 
 		 375 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.4 
 
 		 379 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.5 
 
 		 375 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.53 
 
 		 379 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  39.32 
 
 		 376 aa  262  8e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  39.32 
 
 		 376 aa  262  8e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1842  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.02 
 
 		 375 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0292697  normal  0.208883 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  39.32 
 
 		 376 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  39.32 
 
 		 381 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.7 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  39.32 
 
 		 376 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  39.32 
 
 		 376 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2137  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.9 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.545271  normal  0.220827 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  39.06 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  39.32 
 
 		 381 aa  262  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.21 
 
 		 412 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266068  hitchhiker  0.00354782 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.02 
 
 		 375 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  37.4 
 
 		 379 aa  261  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0837  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.52 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  39.32 
 
 		 376 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0148  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.43 
 
 		 385 aa  260  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1804  butyryl-CoA dehydrogenase  39.09 
 
 		 386 aa  260  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  38.34 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>