More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2510 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2093  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  80.56 
 
 
398 aa  654    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0300334  normal  0.0497691 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2510  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 
397 aa  806    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0195405  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7768  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  75.44 
 
 
397 aa  626  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1139  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  74.56 
 
 
399 aa  615  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1456  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  73.99 
 
 
398 aa  617  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0673  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  72.18 
 
 
400 aa  605  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1740  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  73.05 
 
 
397 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0177648  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1759  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  73.05 
 
 
397 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4367  butyryl-CoA dehydrogenase  72.04 
 
 
397 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1806  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  73.05 
 
 
397 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0727  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.61 
 
 
398 aa  599  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1977  butyryl-CoA dehydrogenase  71.79 
 
 
397 aa  599  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2167  butyryl-CoA dehydrogenase  71.86 
 
 
399 aa  593  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.710802 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1523  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  71.72 
 
 
397 aa  593  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0413288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4031  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  72.36 
 
 
399 aa  591  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.328111  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4533  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  72.36 
 
 
398 aa  590  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0920452  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4224  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.73 
 
 
400 aa  463  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0700017  normal  0.0824066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4054  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.09 
 
 
384 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.09 
 
 
386 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2430  acyl-CoA dehydrogenase-like  50.52 
 
 
385 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000440313  normal  0.478447 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4085  putative acyl-CoA dehydrogenase  50 
 
 
387 aa  398  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14575  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4228  isovaleryl-CoA dehydrogenase  49.35 
 
 
385 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.66405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0446  butyryl-CoA dehydrogenase  49.74 
 
 
385 aa  394  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0615  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.47 
 
 
387 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.210833  normal  0.0397055 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4169  butyryl-CoA dehydrogenase  47.67 
 
 
383 aa  381  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0614852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4181  butyryl-CoA dehydrogenase  47.67 
 
 
383 aa  381  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181503  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4180  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.73 
 
 
383 aa  373  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6335  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.91 
 
 
386 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0221  butyryl-CoA dehydrogenase  49.22 
 
 
385 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0556 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0171  butyryl-CoA dehydrogenase  47.78 
 
 
385 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260341 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0182  butyryl-CoA dehydrogenase  47.78 
 
 
385 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0191  butyryl-CoA dehydrogenase  47.78 
 
 
385 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297032  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2715  acyl-CoA dehydrogenase-like  45.15 
 
 
391 aa  362  8e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.785448  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.14 
 
 
386 aa  360  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0244674  normal  0.176746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4073  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.69 
 
 
386 aa  359  4e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10217  acyl-CoA dehydrogenase fadE3  46.87 
 
 
373 aa  332  1e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1613  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.22 
 
 
568 aa  295  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10785  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2840  Acyl-CoA dehydrogenase  42.78 
 
 
551 aa  293  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.01 
 
 
555 aa  292  8e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1679  acyl-CoA dehydrogenase  42.82 
 
 
548 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0534807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0312  isovaleryl-CoA dehydrogenase  42.16 
 
 
555 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1842  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.01 
 
 
375 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0292697  normal  0.208883 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3825  butyryl-CoA dehydrogenase  42.64 
 
 
400 aa  289  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4150  butyryl-CoA dehydrogenase  42.12 
 
 
388 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.19 
 
 
412 aa  288  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266068  hitchhiker  0.00354782 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4372  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.73 
 
 
374 aa  286  4e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4511  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.42 
 
 
560 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547594  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4427  Butyryl-CoA dehydrogenase  42.38 
 
 
388 aa  285  8e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000160956  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.96 
 
 
375 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.22 
 
 
375 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2307  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.8 
 
 
381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4384  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.31 
 
 
375 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17615  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6504  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.05 
 
 
375 aa  282  9e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285028  normal  0.547313 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1175  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40 
 
 
381 aa  281  2e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0733  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.79 
 
 
377 aa  280  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0391  acyl-CoA dehydrogenase  40.58 
 
 
375 aa  280  4e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.31925  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0310  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.49 
 
 
563 aa  280  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0589554  normal  0.08283 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4575  isovaleryl-CoA dehydrogenase  42.42 
 
 
560 aa  280  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138907  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0833  putative acyl-CoA dehydrogenase  42.6 
 
 
385 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2228  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.51 
 
 
562 aa  279  5e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489531  normal  0.489903 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0447  acyl-CoA dehydrogenase  40.31 
 
 
375 aa  278  8e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.31 
 
 
379 aa  278  8e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2186  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.51 
 
 
562 aa  278  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0552217  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2576  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.69 
 
 
378 aa  276  4e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.48 
 
 
381 aa  276  5e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.43 
 
 
375 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4358  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.64 
 
 
381 aa  276  5e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.6 
 
 
379 aa  276  6e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0364  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.48 
 
 
386 aa  276  6e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2504  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.26 
 
 
562 aa  275  7e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181987  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4351  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.62 
 
 
560 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05445  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2444  isovaleryl-CoA dehydrogenase  41.13 
 
 
567 aa  273  3e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.590306  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  38.96 
 
 
381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  39.9 
 
 
380 aa  273  4.0000000000000004e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  38.96 
 
 
381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  37.34 
 
 
379 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0530  Acyl-CoA dehydrogenase  41.13 
 
 
560 aa  273  4.0000000000000004e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  38.96 
 
 
381 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  38.96 
 
 
381 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  38.96 
 
 
381 aa  272  6e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  38.96 
 
 
381 aa  272  6e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  38.96 
 
 
381 aa  272  6e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2082  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.36 
 
 
376 aa  272  7e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1059  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.49 
 
 
569 aa  272  8.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.773265 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0220  acyl-CoA dehydrogenase  38.7 
 
 
384 aa  272  9e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0793985  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.08 
 
 
402 aa  272  9e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.12 
 
 
382 aa  271  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  38.96 
 
 
381 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2867  Acyl-CoA dehydrogenase-like  38.36 
 
 
375 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.967944  normal  0.115681 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.9 
 
 
381 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.671033  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.05 
 
 
377 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  38.7 
 
 
381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  37.86 
 
 
379 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2909  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.78 
 
 
389 aa  269  5.9999999999999995e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4730  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.01 
 
 
376 aa  269  5.9999999999999995e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.74 
 
 
380 aa  269  7e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3106  acyl-CoA dehydrogenase-like  40.31 
 
 
375 aa  269  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2548  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.58 
 
 
375 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  37.5 
 
 
379 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.21 
 
 
379 aa  268  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.362138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>