More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0833 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0833  putative acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
385 aa  787    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815342 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4427  Butyryl-CoA dehydrogenase  66.41 
 
 
388 aa  529  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000160956  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3825  butyryl-CoA dehydrogenase  66.41 
 
 
400 aa  526  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4150  butyryl-CoA dehydrogenase  65.37 
 
 
388 aa  522  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  60.42 
 
 
412 aa  482  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266068  hitchhiker  0.00354782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2474  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.44 
 
 
414 aa  359  5e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4781  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.39 
 
 
418 aa  347  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.215225  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4266  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.65 
 
 
408 aa  345  7e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.123358 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4633  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.65 
 
 
408 aa  344  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.698048  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2093  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.67 
 
 
398 aa  298  8e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0300334  normal  0.0497691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1977  butyryl-CoA dehydrogenase  42.75 
 
 
397 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4367  butyryl-CoA dehydrogenase  42.49 
 
 
397 aa  288  8e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1523  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.6 
 
 
397 aa  287  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0413288  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1759  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  42.49 
 
 
397 aa  285  9e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1740  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.49 
 
 
397 aa  285  9e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0177648  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1806  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.49 
 
 
397 aa  285  9e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7768  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.78 
 
 
397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2228  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.83 
 
 
562 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489531  normal  0.489903 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2504  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.83 
 
 
562 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181987  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1613  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.56 
 
 
568 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10785  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4351  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.57 
 
 
560 aa  280  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05445  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2186  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.83 
 
 
562 aa  280  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0552217  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2510  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.6 
 
 
397 aa  280  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0195405  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4031  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.01 
 
 
399 aa  278  9e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.328111  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0204  acyl-CoA dehydrogenase  40.15 
 
 
564 aa  277  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0731517  normal  0.952971 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4511  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.31 
 
 
560 aa  276  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547594  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4533  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.75 
 
 
398 aa  276  6e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0920452  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3064  isovaleryl-CoA dehydrogenase  41.25 
 
 
563 aa  275  7e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326905  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4575  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.57 
 
 
560 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138907  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2167  butyryl-CoA dehydrogenase  41.19 
 
 
399 aa  272  7e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.710802 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1059  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.13 
 
 
569 aa  272  8.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.773265 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.08 
 
 
379 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2444  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.36 
 
 
567 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.590306  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1456  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.74 
 
 
398 aa  271  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.34 
 
 
382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2840  Acyl-CoA dehydrogenase  40.36 
 
 
551 aa  270  4e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4224  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.15 
 
 
400 aa  270  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0700017  normal  0.0824066 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2430  acyl-CoA dehydrogenase-like  39.79 
 
 
385 aa  269  7e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000440313  normal  0.478447 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0530  Acyl-CoA dehydrogenase  38.76 
 
 
560 aa  269  7e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.82 
 
 
380 aa  269  8e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1139  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.03 
 
 
399 aa  268  8.999999999999999e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2909  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.26 
 
 
389 aa  268  1e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.74 
 
 
386 aa  267  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0244674  normal  0.176746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0182  butyryl-CoA dehydrogenase  39.64 
 
 
385 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0191  butyryl-CoA dehydrogenase  39.64 
 
 
385 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297032  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.06 
 
 
379 aa  266  5e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0171  butyryl-CoA dehydrogenase  39.64 
 
 
385 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6335  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.6 
 
 
386 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0312  isovaleryl-CoA dehydrogenase  39.95 
 
 
555 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1679  acyl-CoA dehydrogenase  39.95 
 
 
548 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0534807  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.84 
 
 
386 aa  263  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2307  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.89 
 
 
381 aa  261  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1052  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.15 
 
 
386 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0919  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.76 
 
 
383 aa  260  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  38.34 
 
 
380 aa  260  3e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.38 
 
 
383 aa  260  3e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.68 
 
 
381 aa  260  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.48 
 
 
381 aa  259  4e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0673  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.28 
 
 
400 aa  259  7e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4054  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.82 
 
 
384 aa  259  8e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.18 
 
 
376 aa  258  9e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.4 
 
 
376 aa  257  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  40.42 
 
 
381 aa  257  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.48 
 
 
379 aa  257  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.962066  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0615  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.06 
 
 
387 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.210833  normal  0.0397055 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4228  isovaleryl-CoA dehydrogenase  39.79 
 
 
385 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.66405 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  40.42 
 
 
381 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0727  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.02 
 
 
398 aa  258  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  37.63 
 
 
376 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  37.63 
 
 
376 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  37.89 
 
 
381 aa  256  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  37.82 
 
 
379 aa  256  4e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  37.63 
 
 
376 aa  256  4e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0391  acyl-CoA dehydrogenase  39.53 
 
 
375 aa  256  4e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.31925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  40.42 
 
 
381 aa  256  5e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0447  acyl-CoA dehydrogenase  39.27 
 
 
375 aa  256  5e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  37.63 
 
 
381 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  40.42 
 
 
381 aa  256  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4085  putative acyl-CoA dehydrogenase  37.53 
 
 
387 aa  256  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14575  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  40.42 
 
 
381 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  37.63 
 
 
376 aa  256  6e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  40.16 
 
 
381 aa  256  7e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  40.16 
 
 
381 aa  256  7e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  40.16 
 
 
381 aa  255  8e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  37.63 
 
 
376 aa  255  9e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  37.63 
 
 
376 aa  255  9e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  37.63 
 
 
381 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0446  butyryl-CoA dehydrogenase  38.18 
 
 
385 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1109  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.88 
 
 
388 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4180  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.05 
 
 
383 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1932  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.56 
 
 
380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  39.9 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2901  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.47 
 
 
379 aa  253  3e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.23 
 
 
555 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.9 
 
 
381 aa  254  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.48 
 
 
380 aa  253  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1318  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.92 
 
 
384 aa  253  3e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0793911 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.05 
 
 
381 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.671033  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.1 
 
 
388 aa  252  8.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0119178  unclonable  0.00000752707 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.76 
 
 
379 aa  252  9.000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>