More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0204 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2504  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  67.7 
 
 		 562 aa  721    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4351  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  67.46 
 
 		 560 aa  740    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4575  isovaleryl-CoA dehydrogenase  67.18 
 
 		 560 aa  686    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138907  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  75.13 
 
 		 555 aa  849    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1679  acyl-CoA dehydrogenase  74.22 
 
 		 548 aa  817    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0534807  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0204  acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 		 564 aa  1153    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0731517  normal  0.952971 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2186  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  67.12 
 
 		 562 aa  711    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0552217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3064  isovaleryl-CoA dehydrogenase  62.68 
 
 		 563 aa  685    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326905  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0530  Acyl-CoA dehydrogenase  79.22 
 
 		 560 aa  914    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2228  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  67.7 
 
 		 562 aa  721    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489531  normal  0.489903 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0312  isovaleryl-CoA dehydrogenase  73.18 
 
 		 555 aa  827    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2444  isovaleryl-CoA dehydrogenase  80.42 
 
 		 567 aa  952    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.590306  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0310  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  64.17 
 
 		 563 aa  715    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0589554  normal  0.08283 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1059  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.96 
 
 		 569 aa  662    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.773265 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4511  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  67.05 
 
 		 560 aa  707    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547594  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1613  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  66.85 
 
 		 568 aa  716    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2840  Acyl-CoA dehydrogenase  73.22 
 
 		 551 aa  780    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3795  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  57.2 
 
 		 528 aa  569  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2897  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  55.14 
 
 		 527 aa  553  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4427  Butyryl-CoA dehydrogenase  42.97 
 
 		 388 aa  289  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000160956  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4224  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.18 
 
 		 400 aa  288  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0700017  normal  0.0824066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.42 
 
 		 412 aa  287  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266068  hitchhiker  0.00354782 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3825  butyryl-CoA dehydrogenase  42.46 
 
 		 400 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4150  butyryl-CoA dehydrogenase  41.94 
 
 		 388 aa  281  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0833  putative acyl-CoA dehydrogenase  40.15 
 
 		 385 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815342 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2430  acyl-CoA dehydrogenase-like  41.39 
 
 		 385 aa  275  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000440313  normal  0.478447 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4180  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.05 
 
 		 383 aa  273  7e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0446  butyryl-CoA dehydrogenase  39.85 
 
 		 385 aa  270  5e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.53 
 
 		 386 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2093  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.87 
 
 		 398 aa  267  5e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0300334  normal  0.0497691 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0191  butyryl-CoA dehydrogenase  39.43 
 
 		 385 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0182  butyryl-CoA dehydrogenase  39.43 
 
 		 385 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2510  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.77 
 
 		 397 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0195405  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4054  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.33 
 
 		 384 aa  263  8e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1139  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.98 
 
 		 399 aa  263  8e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0171  butyryl-CoA dehydrogenase  39.43 
 
 		 385 aa  263  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260341 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4085  putative acyl-CoA dehydrogenase  38.99 
 
 		 387 aa  262  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4228  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.23 
 
 		 385 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.66405 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1806  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.94 
 
 		 397 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1740  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.94 
 
 		 397 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0177648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1759  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  38.94 
 
 		 397 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7768  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.59 
 
 		 397 aa  258  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0615  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.48 
 
 		 387 aa  258  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.210833  normal  0.0397055 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.66 
 
 		 386 aa  257  5e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0244674  normal  0.176746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6335  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.14 
 
 		 386 aa  256  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1233  acyl-CoA dehydrogenase-like  36.79 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.831269  normal  0.440096 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1172  acyl-CoA dehydrogenase  36.79 
 
 		 384 aa  254  3e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.336122 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.22 
 
 		 380 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.11 
 
 		 383 aa  251  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.96 
 
 		 380 aa  250  6e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1456  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.5 
 
 		 398 aa  250  6e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3683  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.94 
 
 		 384 aa  249  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.685138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0673  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.64 
 
 		 400 aa  249  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0919  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.11 
 
 		 383 aa  248  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0727  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.39 
 
 		 398 aa  248  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4169  butyryl-CoA dehydrogenase  38.75 
 
 		 383 aa  248  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0614852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4181  butyryl-CoA dehydrogenase  38.75 
 
 		 383 aa  248  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181503  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1770  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.31 
 
 		 512 aa  248  2e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2901  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.78 
 
 		 379 aa  248  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0130  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.56 
 
 		 385 aa  248  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0148  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.56 
 
 		 385 aa  248  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4367  butyryl-CoA dehydrogenase  38.35 
 
 		 397 aa  248  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0221  butyryl-CoA dehydrogenase  39.33 
 
 		 385 aa  247  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1052  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.79 
 
 		 386 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.86 
 
 		 385 aa  245  9.999999999999999e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2167  butyryl-CoA dehydrogenase  37.99 
 
 		 399 aa  245  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.710802 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1977  butyryl-CoA dehydrogenase  38.1 
 
 		 397 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43420  putative acyl-CoA dehydrogenase  36.81 
 
 		 384 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0779209  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0220  acyl-CoA dehydrogenase  36.98 
 
 		 384 aa  243  5e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0793985  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  38.34 
 
 		 381 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  38.34 
 
 		 381 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  38.08 
 
 		 381 aa  242  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  37.82 
 
 		 381 aa  242  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  38.08 
 
 		 381 aa  242  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  38.08 
 
 		 381 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  37.82 
 
 		 381 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10217  acyl-CoA dehydrogenase fadE3  38.57 
 
 		 373 aa  242  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.08 
 
 		 381 aa  242  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7329  Acyl-CoA dehydrogenase  36.67 
 
 		 383 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3642  putative acyl-CoA dehydrogenase  36.29 
 
 		 384 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  37.82 
 
 		 381 aa  240  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.43 
 
 		 379 aa  240  4e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.82 
 
 		 381 aa  239  9e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  37.56 
 
 		 381 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.6 
 
 		 377 aa  238  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0298  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.47 
 
 		 381 aa  238  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0176  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.36 
 
 		 385 aa  236  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1523  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.99 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0413288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0274  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.86 
 
 		 382 aa  234  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.630772  normal  0.481537 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4073  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.73 
 
 		 386 aa  233  6e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0413  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.3 
 
 		 382 aa  233  8.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.53 
 
 		 379 aa  233  9e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.01 
 
 		 376 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  36.34 
 
 		 379 aa  231  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.02 
 
 		 380 aa  231  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4031  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.77 
 
 		 399 aa  231  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.328111  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1078  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.42 
 
 		 383 aa  230  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1288  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.24 
 
 		 379 aa  229  7e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.751821 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.28 
 
 		 381 aa  229  8e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0155  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.05 
 
 		 388 aa  229  9e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000954759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>