More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1523 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1139  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  78.39 
 
 		 399 aa  652    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1523  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 397 aa  820    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0413288  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1759  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  81.95 
 
 		 397 aa  670    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4367  butyryl-CoA dehydrogenase  81.36 
 
 		 397 aa  664    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1806  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  81.95 
 
 		 397 aa  670    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1977  butyryl-CoA dehydrogenase  81.11 
 
 		 397 aa  660    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1740  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  81.95 
 
 		 397 aa  670    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0177648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7768  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  75.57 
 
 		 397 aa  631  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2093  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  72.47 
 
 		 398 aa  598  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0300334  normal  0.0497691 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2510  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  71.72 
 
 		 397 aa  593  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0195405  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0673  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.36 
 
 		 400 aa  593  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0727  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.11 
 
 		 398 aa  592  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2167  butyryl-CoA dehydrogenase  71.61 
 
 		 399 aa  589  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.710802 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1456  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  68.51 
 
 		 398 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4533  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.43 
 
 		 398 aa  577  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0920452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4031  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.43 
 
 		 399 aa  577  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.328111  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4224  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  56.46 
 
 		 400 aa  464  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0700017  normal  0.0824066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4054  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.3 
 
 		 384 aa  393  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4085  putative acyl-CoA dehydrogenase  48 
 
 		 387 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0615  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.27 
 
 		 387 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.210833  normal  0.0397055 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2430  acyl-CoA dehydrogenase-like  47.12 
 
 		 385 aa  379  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000440313  normal  0.478447 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0446  butyryl-CoA dehydrogenase  46.93 
 
 		 385 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.94 
 
 		 386 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4228  isovaleryl-CoA dehydrogenase  45.41 
 
 		 385 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.66405 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.79 
 
 		 386 aa  360  3e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0244674  normal  0.176746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4180  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.91 
 
 		 383 aa  358  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0182  butyryl-CoA dehydrogenase  44.91 
 
 		 385 aa  354  1e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0191  butyryl-CoA dehydrogenase  44.91 
 
 		 385 aa  354  1e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0171  butyryl-CoA dehydrogenase  44.91 
 
 		 385 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260341 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4169  butyryl-CoA dehydrogenase  43.78 
 
 		 383 aa  352  5e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0614852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4181  butyryl-CoA dehydrogenase  43.78 
 
 		 383 aa  352  5e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181503  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0221  butyryl-CoA dehydrogenase  46.93 
 
 		 385 aa  352  7e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4073  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.49 
 
 		 386 aa  348  1e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6335  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.65 
 
 		 386 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2715  acyl-CoA dehydrogenase-like  43.95 
 
 		 391 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.785448  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10217  acyl-CoA dehydrogenase fadE3  43.49 
 
 		 373 aa  316  5e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0833  putative acyl-CoA dehydrogenase  42.6 
 
 		 385 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815342 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.1 
 
 		 379 aa  280  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5641  Butyryl-CoA dehydrogenase  39.48 
 
 		 379 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.62 
 
 		 379 aa  280  4e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4372  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.21 
 
 		 374 aa  280  4e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.64 
 
 		 379 aa  276  5e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.962066  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  38.18 
 
 		 380 aa  272  6e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4427  Butyryl-CoA dehydrogenase  40.05 
 
 		 388 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000160956  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3825  butyryl-CoA dehydrogenase  39.49 
 
 		 400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.54 
 
 		 402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.21 
 
 		 380 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.87 
 
 		 379 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4150  butyryl-CoA dehydrogenase  39.02 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  38.87 
 
 		 379 aa  265  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1088  acyl-CoA dehydrogenase  39.58 
 
 		 380 aa  264  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0264  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.72 
 
 		 394 aa  264  3e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0644181  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.14 
 
 		 379 aa  264  3e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4358  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.5 
 
 		 381 aa  263  3e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.48 
 
 		 412 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266068  hitchhiker  0.00354782 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3827  bytyryl-CoA dehydrogenase (short-chain-acyl-CoA dehydrogenase)  36.62 
 
 		 379 aa  262  6.999999999999999e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1172  acyl-CoA dehydrogenase  37.5 
 
 		 384 aa  261  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.336122 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  37.24 
 
 		 379 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1233  acyl-CoA dehydrogenase-like  37.5 
 
 		 384 aa  261  2e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.831269  normal  0.440096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6291  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.55 
 
 		 379 aa  261  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2909  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.39 
 
 		 389 aa  261  2e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.1 
 
 		 386 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2307  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.38 
 
 		 381 aa  260  3e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0447  acyl-CoA dehydrogenase  38.22 
 
 		 375 aa  260  3e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1175  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.92 
 
 		 381 aa  260  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0391  acyl-CoA dehydrogenase  38.22 
 
 		 375 aa  260  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.31925  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0220  acyl-CoA dehydrogenase  37.04 
 
 		 384 aa  259  6e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0793985  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3683  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.58 
 
 		 384 aa  259  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.685138 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1613  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.47 
 
 		 568 aa  259  8e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.22 
 
 		 380 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3642  putative acyl-CoA dehydrogenase  38.46 
 
 		 384 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7329  Acyl-CoA dehydrogenase  36.77 
 
 		 383 aa  257  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.93 
 
 		 379 aa  256  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.87 
 
 		 381 aa  257  3e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.11 
 
 		 382 aa  256  4e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.86 
 
 		 381 aa  256  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  35.92 
 
 		 379 aa  256  5e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2369  acyl-CoA dehydrogenase-like  37.14 
 
 		 380 aa  256  5e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2897  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  40.21 
 
 		 527 aa  256  5e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.46 
 
 		 380 aa  256  5e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2500  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.17 
 
 		 386 aa  256  6e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0453809  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.7 
 
 		 376 aa  256  6e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.42 
 
 		 380 aa  256  7e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43420  putative acyl-CoA dehydrogenase  37.93 
 
 		 384 aa  255  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0779209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1078  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.87 
 
 		 383 aa  256  7e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0733  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.65 
 
 		 377 aa  255  8e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.24 
 
 		 379 aa  255  8e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0815  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.32 
 
 		 377 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0634302  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.21 
 
 		 389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0067  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.69 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.08 
 
 		 380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.86 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2576  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.28 
 
 		 378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  37.3 
 
 		 376 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  37.3 
 
 		 376 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.48 
 
 		 379 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.24 
 
 		 381 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2082  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.02 
 
 		 376 aa  253  5.000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0736  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  38.12 
 
 		 379 aa  252  7e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.763418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4511  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.16 
 
 		 560 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>