More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1139 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1740  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  81.11 
 
 		 397 aa  674    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0177648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1523  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  78.39 
 
 		 397 aa  652    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0413288  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1139  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 399 aa  813    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1759  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  81.11 
 
 		 397 aa  674    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4367  butyryl-CoA dehydrogenase  79.49 
 
 		 397 aa  662    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1806  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  81.11 
 
 		 397 aa  674    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1977  butyryl-CoA dehydrogenase  80 
 
 		 397 aa  663    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7768  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  77.64 
 
 		 397 aa  637    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0673  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  75.75 
 
 		 400 aa  631  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1456  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  76.63 
 
 		 398 aa  631  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0727  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  75.5 
 
 		 398 aa  629  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2510  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  74.56 
 
 		 397 aa  615  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0195405  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2167  butyryl-CoA dehydrogenase  73.68 
 
 		 399 aa  605  9.999999999999999e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.710802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4031  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  74.5 
 
 		 399 aa  597  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.328111  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4533  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  74.25 
 
 		 398 aa  594  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0920452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2093  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  72.8 
 
 		 398 aa  592  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0300334  normal  0.0497691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4224  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  59.31 
 
 		 400 aa  491  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0700017  normal  0.0824066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.22 
 
 		 386 aa  388  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4054  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.44 
 
 		 384 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0446  butyryl-CoA dehydrogenase  46.7 
 
 		 385 aa  378  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4228  isovaleryl-CoA dehydrogenase  47.12 
 
 		 385 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.66405 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.66 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0244674  normal  0.176746 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2430  acyl-CoA dehydrogenase-like  47.52 
 
 		 385 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000440313  normal  0.478447 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4085  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.02 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0615  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.76 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.210833  normal  0.0397055 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4180  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.97 
 
 		 383 aa  368  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0182  butyryl-CoA dehydrogenase  45.43 
 
 		 385 aa  362  9e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0191  butyryl-CoA dehydrogenase  45.43 
 
 		 385 aa  362  9e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0171  butyryl-CoA dehydrogenase  45.43 
 
 		 385 aa  361  1e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6335  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.19 
 
 		 386 aa  361  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4169  butyryl-CoA dehydrogenase  45.78 
 
 		 383 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0614852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4181  butyryl-CoA dehydrogenase  45.78 
 
 		 383 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181503  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0221  butyryl-CoA dehydrogenase  47.23 
 
 		 385 aa  355  5.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4073  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.82 
 
 		 386 aa  344  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2715  acyl-CoA dehydrogenase-like  45.48 
 
 		 391 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.785448  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10217  acyl-CoA dehydrogenase fadE3  46.13 
 
 		 373 aa  332  5e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4372  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.67 
 
 		 374 aa  288  9e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.01 
 
 		 381 aa  286  7e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.19 
 
 		 379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  42.38 
 
 		 381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  42.12 
 
 		 381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  42.12 
 
 		 381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  42.38 
 
 		 381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  42.12 
 
 		 381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  42.12 
 
 		 381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  42.12 
 
 		 381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  42.12 
 
 		 381 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3825  butyryl-CoA dehydrogenase  41.9 
 
 		 400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.49 
 
 		 380 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  41.86 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4427  Butyryl-CoA dehydrogenase  42.24 
 
 		 388 aa  279  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000160956  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.24 
 
 		 381 aa  279  6e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  40.16 
 
 		 380 aa  279  7e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.65 
 
 		 380 aa  278  9e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4511  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.75 
 
 		 560 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547594  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4150  butyryl-CoA dehydrogenase  41.48 
 
 		 388 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.47 
 
 		 555 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.09 
 
 		 379 aa  276  6e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.962066  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.15 
 
 		 377 aa  276  6e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4575  isovaleryl-CoA dehydrogenase  39.53 
 
 		 560 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138907  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1613  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.95 
 
 		 568 aa  275  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.96 
 
 		 379 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5641  Butyryl-CoA dehydrogenase  40.41 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0312  isovaleryl-CoA dehydrogenase  39.21 
 
 		 555 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5850  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  40.53 
 
 		 380 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1679  acyl-CoA dehydrogenase  39.47 
 
 		 548 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0534807  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.86 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0447  acyl-CoA dehydrogenase  39.58 
 
 		 375 aa  270  4e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2840  Acyl-CoA dehydrogenase  39.74 
 
 		 551 aa  270  4e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.26 
 
 		 379 aa  269  8e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0833  putative acyl-CoA dehydrogenase  41.03 
 
 		 385 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815342 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2897  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  41.13 
 
 		 527 aa  268  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40 
 
 		 386 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0310  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.56 
 
 		 563 aa  267  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0589554  normal  0.08283 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.53 
 
 		 380 aa  267  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  39.31 
 
 		 376 aa  266  4e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  39.31 
 
 		 376 aa  266  4e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  39.31 
 
 		 376 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4351  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.4 
 
 		 560 aa  266  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05445  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  39.31 
 
 		 376 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  39.31 
 
 		 381 aa  266  5e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  39.31 
 
 		 376 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2695  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.37 
 
 		 382 aa  266  5e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2307  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.26 
 
 		 381 aa  266  5e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0391  acyl-CoA dehydrogenase  39.32 
 
 		 375 aa  266  5e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.31925  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3795  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.79 
 
 		 528 aa  266  5.999999999999999e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3064  isovaleryl-CoA dehydrogenase  38.56 
 
 		 563 aa  266  7e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326905  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.83 
 
 		 379 aa  266  7e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.54 
 
 		 376 aa  265  8e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1932  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.37 
 
 		 380 aa  265  8e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2163  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.31 
 
 		 389 aa  265  8e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820192  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1172  acyl-CoA dehydrogenase  37.89 
 
 		 384 aa  265  8.999999999999999e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.336122 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.08 
 
 		 375 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.81 
 
 		 375 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  39.31 
 
 		 376 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4185  acyl-CoA dehydrogenase-like  39.16 
 
 		 376 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  39.31 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21870  acyl-CoA dehydrogenase  36.5 
 
 		 391 aa  265  1e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10506  normal  0.934225 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2186  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.79 
 
 		 562 aa  265  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0552217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2576  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.78 
 
 		 378 aa  265  1e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>