More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_21870 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_21870  acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
391 aa  805    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10506  normal  0.934225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5850  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  57.73 
 
 
380 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0241  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  57.58 
 
 
389 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33630  acyl-CoA dehydrogenase  55.56 
 
 
386 aa  448  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0966  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  57.22 
 
 
390 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1814  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  57.33 
 
 
381 aa  436  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.283341  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2886  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  58.07 
 
 
375 aa  433  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000161346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5326  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.15 
 
 
382 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.777784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0525  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  56.56 
 
 
381 aa  431  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2377  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.19 
 
 
381 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0847683  hitchhiker  0.00260799 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2258  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.96 
 
 
380 aa  425  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.157301  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1242  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  58.59 
 
 
379 aa  428  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.176039  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3174  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.92 
 
 
383 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000929019  hitchhiker  0.000000000938929 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0068  putative acyl-CoA dehydrogenase  55.67 
 
 
391 aa  419  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.544206  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4943  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.41 
 
 
380 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.218623  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0099  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  56.22 
 
 
380 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0089  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.22 
 
 
380 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.372364 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0108  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.22 
 
 
380 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.255375 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2789  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.13 
 
 
385 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.183499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6416  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.58 
 
 
381 aa  402  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.372827 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1208  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.84 
 
 
391 aa  402  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166701  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4016  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.96 
 
 
379 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112227  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0545  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  56.7 
 
 
382 aa  401  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1476  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.44 
 
 
380 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.963789 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2379  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  54.38 
 
 
379 aa  393  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.6 
 
 
379 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.69 
 
 
380 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.38 
 
 
379 aa  333  3e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  45.29 
 
 
379 aa  331  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.74 
 
 
376 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  45.03 
 
 
379 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  44.71 
 
 
376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  44.71 
 
 
376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  44.71 
 
 
376 aa  327  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  45.29 
 
 
379 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  44.71 
 
 
381 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  44.44 
 
 
376 aa  326  5e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  45.03 
 
 
379 aa  326  5e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  44.44 
 
 
376 aa  326  5e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  44.44 
 
 
376 aa  326  5e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  45.03 
 
 
379 aa  325  6e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  45.03 
 
 
379 aa  325  6e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.79 
 
 
389 aa  325  7e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  44.44 
 
 
381 aa  325  7e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  45.03 
 
 
379 aa  325  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  45.03 
 
 
379 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  45.03 
 
 
379 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.5 
 
 
379 aa  325  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  44.44 
 
 
381 aa  324  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1179  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  44.01 
 
 
392 aa  324  2e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.24 
 
 
379 aa  322  6e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.21 
 
 
376 aa  322  8e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.9 
 
 
380 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.57 
 
 
379 aa  319  3.9999999999999996e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.55 
 
 
380 aa  318  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1085  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.69 
 
 
373 aa  315  6e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.863384  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.41 
 
 
381 aa  315  9e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1526  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.17 
 
 
404 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.84855  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3492  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.82 
 
 
383 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2885  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.82 
 
 
383 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2695  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.09 
 
 
382 aa  312  7.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2436  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.82 
 
 
383 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  45.41 
 
 
381 aa  311  9e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  45.14 
 
 
381 aa  311  9e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  45.14 
 
 
381 aa  311  9e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  45.41 
 
 
381 aa  311  9e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  45.14 
 
 
381 aa  311  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  45.14 
 
 
381 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  45.14 
 
 
381 aa  311  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  45.14 
 
 
381 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.8 
 
 
386 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  43.19 
 
 
379 aa  311  2e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  43.19 
 
 
379 aa  311  2e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  44.88 
 
 
381 aa  309  4e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2279  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.28 
 
 
383 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  43.82 
 
 
379 aa  309  5e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.63 
 
 
381 aa  308  8e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1647  acyl-CoA dehydrogenase  44.27 
 
 
385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.658516  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4700  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.57 
 
 
384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.201387  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  41.1 
 
 
379 aa  306  3e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.78 
 
 
375 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4115  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.33 
 
 
390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2589  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.33 
 
 
390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000683478  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3451  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.36 
 
 
377 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.83 
 
 
381 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.78 
 
 
375 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.5 
 
 
380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1782  butyryl-CoA dehydrogenase  43.46 
 
 
379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.257154  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0733  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.3 
 
 
377 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2865  Acyl-CoA dehydrogenase-like  44.74 
 
 
383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0509295  normal  0.212771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.51 
 
 
375 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.62 
 
 
380 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0837  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.94 
 
 
390 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4904  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.9 
 
 
377 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316996  normal  0.149852 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.04 
 
 
379 aa  302  6.000000000000001e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1842  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.51 
 
 
375 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0292697  normal  0.208883 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.36 
 
 
377 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.5 
 
 
383 aa  301  9e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0714  Acyl-CoA dehydrogenase  43.36 
 
 
377 aa  301  9e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5650  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.55 
 
 
377 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>