More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2091 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
386 aa  782    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0244674  normal  0.176746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  66.23 
 
 
386 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2430  acyl-CoA dehydrogenase-like  65 
 
 
385 aa  510  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000440313  normal  0.478447 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0182  butyryl-CoA dehydrogenase  65 
 
 
385 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0191  butyryl-CoA dehydrogenase  65 
 
 
385 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297032  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4054  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  65.96 
 
 
384 aa  505  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0171  butyryl-CoA dehydrogenase  64.74 
 
 
385 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0446  butyryl-CoA dehydrogenase  63.68 
 
 
385 aa  495  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4180  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  61.21 
 
 
383 aa  493  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4228  isovaleryl-CoA dehydrogenase  63.16 
 
 
385 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.66405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0221  butyryl-CoA dehydrogenase  63.42 
 
 
385 aa  471  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0556 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10217  acyl-CoA dehydrogenase fadE3  59.66 
 
 
373 aa  436  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0615  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.4 
 
 
387 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.210833  normal  0.0397055 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4085  putative acyl-CoA dehydrogenase  49.87 
 
 
387 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14575  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4224  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.31 
 
 
400 aa  383  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0700017  normal  0.0824066 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2093  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.92 
 
 
398 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0300334  normal  0.0497691 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1139  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.66 
 
 
399 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4367  butyryl-CoA dehydrogenase  45.97 
 
 
397 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6335  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.6 
 
 
386 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4169  butyryl-CoA dehydrogenase  46.56 
 
 
383 aa  368  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0614852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4181  butyryl-CoA dehydrogenase  46.56 
 
 
383 aa  368  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181503  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4073  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.69 
 
 
386 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1977  butyryl-CoA dehydrogenase  45.97 
 
 
397 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7768  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.05 
 
 
397 aa  363  4e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1456  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.35 
 
 
398 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1759  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  45.19 
 
 
397 aa  362  8e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1806  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.19 
 
 
397 aa  362  8e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1740  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.19 
 
 
397 aa  362  8e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0177648  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2510  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.14 
 
 
397 aa  360  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0195405  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2167  butyryl-CoA dehydrogenase  46.49 
 
 
399 aa  360  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.710802 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0673  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.85 
 
 
400 aa  360  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1523  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.79 
 
 
397 aa  360  3e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0413288  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0727  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.6 
 
 
398 aa  358  8e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4533  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.97 
 
 
398 aa  345  6e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0920452  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4031  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.97 
 
 
399 aa  345  6e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.328111  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2715  acyl-CoA dehydrogenase-like  45.17 
 
 
391 aa  338  8e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.785448  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.74 
 
 
379 aa  298  1e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4372  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.8 
 
 
374 aa  289  5.0000000000000004e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4179  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.88 
 
 
381 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.011291  hitchhiker  0.000381045 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.71 
 
 
379 aa  280  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.394739 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.27 
 
 
380 aa  280  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1175  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.58 
 
 
381 aa  280  4e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.71 
 
 
394 aa  279  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.954368  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2909  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.01 
 
 
389 aa  278  2e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4358  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.58 
 
 
381 aa  277  2e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1613  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.78 
 
 
568 aa  277  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10785  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2307  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.05 
 
 
381 aa  275  7e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.05 
 
 
375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.32 
 
 
375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3825  butyryl-CoA dehydrogenase  39.28 
 
 
400 aa  272  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.6 
 
 
381 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.32 
 
 
375 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0815  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.73 
 
 
377 aa  270  2e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0634302  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4427  Butyryl-CoA dehydrogenase  39.02 
 
 
388 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000160956  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4511  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.76 
 
 
560 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547594  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.58 
 
 
379 aa  270  4e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.962066  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.84 
 
 
380 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1059  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.04 
 
 
569 aa  269  5.9999999999999995e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.773265 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  41.34 
 
 
381 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.89 
 
 
380 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  41.34 
 
 
381 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  41.34 
 
 
381 aa  268  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  41.34 
 
 
381 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  41.34 
 
 
381 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  41.34 
 
 
381 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  41.34 
 
 
381 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0882  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.63 
 
 
381 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000390729  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  41.34 
 
 
381 aa  268  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  38.93 
 
 
380 aa  267  2e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0833  putative acyl-CoA dehydrogenase  39.74 
 
 
385 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815342 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  41.09 
 
 
381 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2504  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.85 
 
 
562 aa  266  4e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181987  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2228  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.85 
 
 
562 aa  266  5e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489531  normal  0.489903 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2885  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.56 
 
 
383 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1842  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.79 
 
 
375 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0292697  normal  0.208883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0310  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.44 
 
 
563 aa  265  7e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0589554  normal  0.08283 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4150  butyryl-CoA dehydrogenase  38.66 
 
 
388 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2436  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.56 
 
 
383 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3492  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.3 
 
 
383 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2279  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.56 
 
 
383 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0364  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.95 
 
 
386 aa  263  4e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1172  acyl-CoA dehydrogenase  38.52 
 
 
384 aa  263  4e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.336122 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1233  acyl-CoA dehydrogenase-like  38.52 
 
 
384 aa  263  4.999999999999999e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.831269  normal  0.440096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6291  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.11 
 
 
379 aa  263  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4575  isovaleryl-CoA dehydrogenase  42.02 
 
 
560 aa  263  6e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138907  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.05 
 
 
379 aa  262  8e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2444  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40 
 
 
567 aa  262  8.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.590306  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0919  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.89 
 
 
383 aa  262  8.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  40.53 
 
 
378 aa  261  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663187  normal  0.71414 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.37 
 
 
379 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0264  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.25 
 
 
394 aa  261  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0644181  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.31 
 
 
381 aa  261  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2840  Acyl-CoA dehydrogenase  40.21 
 
 
551 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2136  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.16 
 
 
380 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.281355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.12 
 
 
386 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2500  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.73 
 
 
386 aa  260  3e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0453809  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1205  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.62 
 
 
381 aa  259  4e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000395395  hitchhiker  0.00000719291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2867  Acyl-CoA dehydrogenase-like  40.26 
 
 
375 aa  259  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.967944  normal  0.115681 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.11 
 
 
380 aa  259  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.36 
 
 
555 aa  259  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.349993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>