More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4169 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4169  butyryl-CoA dehydrogenase  100 
 
 		 383 aa  789    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0614852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4181  butyryl-CoA dehydrogenase  100 
 
 		 383 aa  789    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181503  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2715  acyl-CoA dehydrogenase-like  64.03 
 
 		 391 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.785448  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0615  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  60.05 
 
 		 387 aa  472  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.210833  normal  0.0397055 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4085  putative acyl-CoA dehydrogenase  59.52 
 
 		 387 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.85 
 
 		 386 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2430  acyl-CoA dehydrogenase-like  51.58 
 
 		 385 aa  421  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000440313  normal  0.478447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4224  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.41 
 
 		 400 aa  413  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0700017  normal  0.0824066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4054  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.74 
 
 		 384 aa  408  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4228  isovaleryl-CoA dehydrogenase  48.56 
 
 		 385 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.66405 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4180  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.11 
 
 		 383 aa  391  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0182  butyryl-CoA dehydrogenase  49.21 
 
 		 385 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0191  butyryl-CoA dehydrogenase  49.21 
 
 		 385 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0171  butyryl-CoA dehydrogenase  49.48 
 
 		 385 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2510  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.67 
 
 		 397 aa  381  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0195405  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0446  butyryl-CoA dehydrogenase  46.95 
 
 		 385 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4073  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.21 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.56 
 
 		 386 aa  368  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0244674  normal  0.176746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7768  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.01 
 
 		 397 aa  363  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0221  butyryl-CoA dehydrogenase  47.75 
 
 		 385 aa  363  2e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2093  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.34 
 
 		 398 aa  363  4e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0300334  normal  0.0497691 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2167  butyryl-CoA dehydrogenase  46.88 
 
 		 399 aa  362  5.0000000000000005e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.710802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4367  butyryl-CoA dehydrogenase  46.88 
 
 		 397 aa  362  8e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6335  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.81 
 
 		 386 aa  361  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1139  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.78 
 
 		 399 aa  360  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1456  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.85 
 
 		 398 aa  360  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1977  butyryl-CoA dehydrogenase  46.61 
 
 		 397 aa  358  6e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1759  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  46.88 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1806  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.88 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1740  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.88 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0177648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1523  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.78 
 
 		 397 aa  352  4e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0413288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4031  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.61 
 
 		 399 aa  348  6e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.328111  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0727  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.85 
 
 		 398 aa  347  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4533  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.09 
 
 		 398 aa  345  5e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0920452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10217  acyl-CoA dehydrogenase fadE3  45.61 
 
 		 373 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0673  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.07 
 
 		 400 aa  340  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.24 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.06 
 
 		 379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  41.8 
 
 		 379 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.33 
 
 		 402 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0837  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.47 
 
 		 390 aa  279  5e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.25 
 
 		 381 aa  279  6e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.53 
 
 		 375 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.74 
 
 		 380 aa  278  9e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  42.51 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  42.51 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  42.51 
 
 		 381 aa  277  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  42.51 
 
 		 381 aa  277  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.31 
 
 		 379 aa  277  2e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  42.51 
 
 		 381 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  42.51 
 
 		 381 aa  277  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  42.51 
 
 		 381 aa  277  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  42.51 
 
 		 381 aa  277  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.29 
 
 		 379 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40 
 
 		 375 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.73 
 
 		 375 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  42.51 
 
 		 381 aa  276  6e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.18 
 
 		 381 aa  275  8e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0919  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.27 
 
 		 383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1613  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.85 
 
 		 568 aa  275  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2369  acyl-CoA dehydrogenase-like  41.42 
 
 		 380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2228  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.38 
 
 		 562 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489531  normal  0.489903 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  41.27 
 
 		 379 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1842  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.47 
 
 		 375 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0292697  normal  0.208883 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.63 
 
 		 385 aa  271  1e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0312  isovaleryl-CoA dehydrogenase  39.52 
 
 		 555 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1288  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.05 
 
 		 379 aa  270  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.751821 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7329  Acyl-CoA dehydrogenase  41.55 
 
 		 383 aa  269  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0391  acyl-CoA dehydrogenase  40.53 
 
 		 375 aa  269  5e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.31925  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2504  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.11 
 
 		 562 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4511  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40 
 
 		 560 aa  269  7e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547594  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3064  isovaleryl-CoA dehydrogenase  39.14 
 
 		 563 aa  269  7e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.6 
 
 		 380 aa  268  8e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.27 
 
 		 379 aa  268  8e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0130  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.62 
 
 		 385 aa  268  8e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0447  acyl-CoA dehydrogenase  40.27 
 
 		 375 aa  268  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0264  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.06 
 
 		 394 aa  267  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0644181  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3642  putative acyl-CoA dehydrogenase  40.27 
 
 		 384 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0148  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.35 
 
 		 385 aa  268  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4358  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.05 
 
 		 381 aa  266  2.9999999999999995e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4351  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.5 
 
 		 560 aa  266  5e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0364  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.73 
 
 		 386 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1679  acyl-CoA dehydrogenase  38.99 
 
 		 548 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0534807  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.2 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43420  putative acyl-CoA dehydrogenase  39.73 
 
 		 384 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0779209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4575  isovaleryl-CoA dehydrogenase  39.73 
 
 		 560 aa  264  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138907  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2909  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.83 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  38.73 
 
 		 379 aa  263  3e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2186  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.56 
 
 		 562 aa  263  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0552217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3106  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.53 
 
 		 375 aa  263  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.332334  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5641  Butyryl-CoA dehydrogenase  41.3 
 
 		 379 aa  263  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0202  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.95 
 
 		 382 aa  262  6e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6410  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  39.79 
 
 		 385 aa  262  8e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603602 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.11 
 
 		 383 aa  262  8.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.05 
 
 		 379 aa  261  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2840  Acyl-CoA dehydrogenase  38.9 
 
 		 551 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2151  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.74 
 
 		 383 aa  261  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.53 
 
 		 376 aa  261  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.68 
 
 		 394 aa  261  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.954368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1078  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.01 
 
 		 383 aa  260  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>