More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1288 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1288  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 
379 aa  785    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.751821 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0837  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  74.87 
 
 
390 aa  595  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1932  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.45 
 
 
380 aa  553  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0730  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  66.76 
 
 
381 aa  535  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3527  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  68.25 
 
 
386 aa  531  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496474  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3396  acyl-CoA dehydrogenase  68.66 
 
 
351 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.581792  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3002  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  61.64 
 
 
388 aa  495  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2369  acyl-CoA dehydrogenase-like  60.16 
 
 
380 aa  481  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  52.53 
 
 
379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  52.27 
 
 
379 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  52.8 
 
 
379 aa  403  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  52.53 
 
 
379 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  52.53 
 
 
379 aa  402  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  52.8 
 
 
379 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.53 
 
 
379 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  52.53 
 
 
379 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  52.27 
 
 
379 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  52.27 
 
 
379 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2163  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.4 
 
 
389 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820192  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.47 
 
 
379 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.73 
 
 
379 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0264  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.79 
 
 
394 aa  385  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0644181  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.93 
 
 
380 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  48.55 
 
 
379 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1647  butyryl-CoA dehydrogenase  49.34 
 
 
379 aa  381  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.8 
 
 
376 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2211  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.08 
 
 
379 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0439927  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2299  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.21 
 
 
379 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  47.73 
 
 
376 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.08 
 
 
380 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  48 
 
 
376 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  48 
 
 
376 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  48 
 
 
376 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  48 
 
 
376 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.67 
 
 
379 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  47.73 
 
 
381 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  48 
 
 
376 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  47.73 
 
 
381 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.81 
 
 
380 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.73 
 
 
376 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  47.47 
 
 
381 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1782  butyryl-CoA dehydrogenase  48.81 
 
 
379 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.257154  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  47.23 
 
 
379 aa  366  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0067  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.73 
 
 
394 aa  365  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.34 
 
 
380 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3827  bytyryl-CoA dehydrogenase (short-chain-acyl-CoA dehydrogenase)  49.6 
 
 
379 aa  368  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.91 
 
 
379 aa  362  5.0000000000000005e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.67 
 
 
386 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.72 
 
 
381 aa  359  4e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  45.91 
 
 
379 aa  359  6e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  45.91 
 
 
379 aa  359  6e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5641  Butyryl-CoA dehydrogenase  48.55 
 
 
379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.87 
 
 
394 aa  355  7.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.954368  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.61 
 
 
377 aa  355  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0812  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  47.49 
 
 
393 aa  354  2e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6504  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.76 
 
 
375 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285028  normal  0.547313 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.4 
 
 
381 aa  353  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.6 
 
 
382 aa  353  2.9999999999999997e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.76 
 
 
375 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.28 
 
 
379 aa  352  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.962066  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4384  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.03 
 
 
375 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17615  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.73 
 
 
389 aa  352  7e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.81 
 
 
379 aa  351  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.67 
 
 
381 aa  351  1e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  48.14 
 
 
381 aa  350  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.91 
 
 
379 aa  350  2e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  48.14 
 
 
381 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  48.14 
 
 
381 aa  350  3e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  48.14 
 
 
381 aa  350  3e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  48.14 
 
 
381 aa  350  3e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  48.14 
 
 
381 aa  350  3e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  48.14 
 
 
381 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  48.14 
 
 
381 aa  349  4e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2500  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.77 
 
 
380 aa  349  4e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4358  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.63 
 
 
381 aa  349  5e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  47.87 
 
 
381 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  47.49 
 
 
380 aa  348  1e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.07 
 
 
379 aa  347  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.394739 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2137  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.89 
 
 
382 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.545271  normal  0.220827 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.44 
 
 
382 aa  346  4e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2906  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.03 
 
 
375 aa  346  4e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2281  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.91 
 
 
380 aa  345  8e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.96 
 
 
375 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.01 
 
 
380 aa  344  2e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2307  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.97 
 
 
381 aa  343  2.9999999999999997e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.69 
 
 
375 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0733  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.41 
 
 
377 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.24 
 
 
379 aa  342  7e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1150  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.95 
 
 
380 aa  342  8e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2192  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.38 
 
 
380 aa  342  8e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.516178  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3451  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.94 
 
 
377 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3574  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.36 
 
 
377 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1842  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.59 
 
 
375 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0292697  normal  0.208883 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.95 
 
 
380 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.35 
 
 
380 aa  340  2.9999999999999998e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2909  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.65 
 
 
389 aa  339  5e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2867  Acyl-CoA dehydrogenase-like  44.2 
 
 
375 aa  338  8e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.967944  normal  0.115681 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1665  butyryl-CoA dehydrogenase  45.38 
 
 
380 aa  338  8e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0391  acyl-CoA dehydrogenase  45.68 
 
 
375 aa  338  8e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.31925  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6291  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.77 
 
 
379 aa  337  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>