More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4073 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4073  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
386 aa  786    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6335  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  69.17 
 
 
386 aa  556  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.79 
 
 
386 aa  403  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4054  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.19 
 
 
384 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4085  putative acyl-CoA dehydrogenase  51.32 
 
 
387 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14575  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0615  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.05 
 
 
387 aa  398  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.210833  normal  0.0397055 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4228  isovaleryl-CoA dehydrogenase  47.76 
 
 
385 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.66405 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2430  acyl-CoA dehydrogenase-like  49.73 
 
 
385 aa  385  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000440313  normal  0.478447 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0446  butyryl-CoA dehydrogenase  47.34 
 
 
385 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4169  butyryl-CoA dehydrogenase  49.21 
 
 
383 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0614852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4181  butyryl-CoA dehydrogenase  49.21 
 
 
383 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181503  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0171  butyryl-CoA dehydrogenase  46.68 
 
 
385 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260341 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0182  butyryl-CoA dehydrogenase  46.42 
 
 
385 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0191  butyryl-CoA dehydrogenase  46.42 
 
 
385 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297032  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4180  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.89 
 
 
383 aa  366  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.69 
 
 
386 aa  365  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0244674  normal  0.176746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0221  butyryl-CoA dehydrogenase  47.34 
 
 
385 aa  363  4e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0556 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2510  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.69 
 
 
397 aa  359  4e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0195405  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7768  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.43 
 
 
397 aa  353  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2167  butyryl-CoA dehydrogenase  47.27 
 
 
399 aa  353  4e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.710802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4224  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.36 
 
 
400 aa  350  2e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0700017  normal  0.0824066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1523  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.49 
 
 
397 aa  348  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0413288  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2093  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.03 
 
 
398 aa  345  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0300334  normal  0.0497691 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1139  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.82 
 
 
399 aa  344  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2715  acyl-CoA dehydrogenase-like  45.26 
 
 
391 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.785448  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10217  acyl-CoA dehydrogenase fadE3  44.54 
 
 
373 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0727  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.42 
 
 
398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0673  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.16 
 
 
400 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1456  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.82 
 
 
398 aa  336  5e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4367  butyryl-CoA dehydrogenase  43.34 
 
 
397 aa  333  3e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1977  butyryl-CoA dehydrogenase  43.86 
 
 
397 aa  332  5e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1759  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  43.86 
 
 
397 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1740  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.86 
 
 
397 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0177648  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1806  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.86 
 
 
397 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4533  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.97 
 
 
398 aa  331  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0920452  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4031  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.71 
 
 
399 aa  329  6e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.328111  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  40.58 
 
 
379 aa  303  4.0000000000000003e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4358  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.34 
 
 
381 aa  302  7.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  41.36 
 
 
379 aa  298  9e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2909  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.69 
 
 
389 aa  296  5e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.99 
 
 
379 aa  295  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2307  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.15 
 
 
381 aa  295  1e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.51 
 
 
380 aa  293  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.57 
 
 
385 aa  291  9e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.53 
 
 
380 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.47 
 
 
402 aa  290  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.79 
 
 
379 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.05 
 
 
380 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.58 
 
 
379 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.16 
 
 
375 aa  288  8e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.43 
 
 
375 aa  288  9e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  41.32 
 
 
381 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  41.32 
 
 
381 aa  288  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  41.32 
 
 
381 aa  288  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  41.32 
 
 
381 aa  288  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.05 
 
 
381 aa  288  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  41.32 
 
 
381 aa  287  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  41.32 
 
 
381 aa  287  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4179  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.33 
 
 
381 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.011291  hitchhiker  0.000381045 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  41.32 
 
 
381 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  41.1 
 
 
379 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.45 
 
 
383 aa  287  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  41.32 
 
 
381 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  41.1 
 
 
379 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  41.1 
 
 
379 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.53 
 
 
388 aa  286  4e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0119178  unclonable  0.00000752707 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  40.58 
 
 
379 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  41.05 
 
 
381 aa  285  7e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1175  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.43 
 
 
381 aa  285  8e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  40.84 
 
 
379 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.05 
 
 
381 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  40.31 
 
 
379 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.91 
 
 
375 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  40.58 
 
 
379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2867  Acyl-CoA dehydrogenase-like  39.73 
 
 
375 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.967944  normal  0.115681 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  40.58 
 
 
379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  40.58 
 
 
379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.74 
 
 
379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0736  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  39.9 
 
 
379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.763418 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.58 
 
 
379 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0882  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.06 
 
 
381 aa  283  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000390729  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.47 
 
 
383 aa  282  5.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1842  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.37 
 
 
375 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0292697  normal  0.208883 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.1 
 
 
382 aa  282  6.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  39.21 
 
 
376 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.64 
 
 
381 aa  282  8.000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  39.21 
 
 
376 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  38.9 
 
 
379 aa  282  9e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2576  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.21 
 
 
378 aa  281  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0837  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.48 
 
 
390 aa  280  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.41 
 
 
383 aa  280  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4384  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.38 
 
 
375 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17615  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1109  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.22 
 
 
388 aa  279  5e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.19 
 
 
389 aa  279  5e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.1 
 
 
377 aa  279  5e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  38.95 
 
 
381 aa  279  6e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  38.95 
 
 
381 aa  279  6e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  38.95 
 
 
376 aa  279  7e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4372  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.26 
 
 
374 aa  278  8e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  38.95 
 
 
376 aa  278  9e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>